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2023 Fiscal Year Annual Research Report

Cryo-EM structure of the ghrelin receptor coupled to an engineered heterotrimeric G protein

Research Project

Project/Area Number 20KK0359
Research InstitutionKurume University

Principal Investigator

椎村 祐樹  久留米大学, 付置研究所, 助教 (40551297)

Project Period (FY) 2021 – 2023
Keywordsグレリン受容体 / GPCR / 構造生物学
Outline of Annual Research Achievements

グレリン受容体アゴニストとして唯一承認されているアナモレリンが結合したグレリン受容体ーGq複合体の立体構造を2.9オングストローム分解能で決定して、アナモレリンの結合領域を同定した。研究期間中にグレリン受容体の活性型構造が複数報告されたため、京都大学医学部のイム博士および米国Sanford研究所の増保博士と協力して、アナモレリン結合領域を含むグレリン受容体アゴニスト結合領域を抽出して、この領域に見られる一塩基多型がグレリン受容体アゴニストのシグナル活性に与える影響を調べた。その結果、ある変異体において、アゴニストの種類によってシグナル活性が変わることを見出した。研究協力者のBrian Kobilka博士との議論を踏まえて、これらのデータをまとめて論文を執筆・投稿した。ビッグデータを活用した一塩基多型とそのシグナル活性の違いを示した論文は、構造生物学分野にとどまらず幅広い層の読者を対象とするとして、査読者から好意的な評価を受けたが、立体構造解析に改善の余地があることを指摘された。そこでクライオ電子顕微鏡実験をやり直し、構造モデルの精密化によって2.7オングストローム分解能で構造を決定し直し、リガンド結合領域を新たに定義した。また分子シミュレーション (MD) を要求されたため、新たに共同研究先にアゴニスト結合時におけるグレリン受容体の動的変化の推測を依頼した。現在、MD解析待ちであるが、期限である2024年7月までに加筆して、再投稿を予定している。

  • Research Products

    (6 results)

All 2024 2023 2021

All Int'l Joint Research (1 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Stanford University(米国)2021

    • Year and Date
      2021-09-01 – 2022-08-31
    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      Stanford University
    • Co-investigator Overseas
      Brian Kobilka
    • Department
      School of Medicine
    • Job Title
      Professor
  • [Presentation] グレリン受容体のリガンド認識機構および活性化機構の構造学的洞察.2024

    • Author(s)
      椎村祐樹、林到炫、浅田秀基、松井一真、岩田想、児島将康.
    • Organizer
      日本薬学会第144年会.
  • [Presentation] Insights into the structure of the agonist-bound ghrelin receptor.2023

    • Author(s)
      Yuki Shiimura, Dohyun Im, Ryosuke Tany, Ryoji Kise, Hidetsugu Asada, So Iwata, Masuho Ikuo, Masayasu Kojima.
    • Organizer
      第96回日本内分泌学会学術総会.
  • [Presentation] 構造情報に基づいたグレリン受容体アゴニストのシグナル活性の比較.2023

    • Author(s)
      椎村祐樹、林到炫、谷猪遼介、浅田秀基、増保生郎、松井一真、岩田想、児島将康.
    • Organizer
      第49回神経内分泌学会.
  • [Presentation] グレリン受容体のリガンド認識機構の構造基盤.2023

    • Author(s)
      椎村祐樹.
    • Organizer
      第27回日本心血管内分泌代謝学会学術総会.
  • [Presentation] The structural feature of ghrelin receptor.2023

    • Author(s)
      Yuki Shiimura, Dohyun Im, Ryosuke Tany, Hidetsugu Asada, Kazuma Matsui, Masuho Ikuo, So Iwata, Masayasu Kojima.
    • Organizer
      第44回日本肥満学会・第41回日本肥満症治療学会学術集会. 日韓台合同シンポジウム
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2024-12-25  

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