2010 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子コピー数異常(CNV）に着目した神経疾患における新規遺伝子変異の探求
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21200041
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| Research Institution | Niigata University |
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Principal Investigator |
池内 健 新潟大学, 研究推進機構超域学術院, 准教授 (20372469)
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| Keywords | 遺伝性精神疾患 / 遺伝子同定 / 遺伝子コピー数 / ゲノムワイド解析 / 候補遺伝子アプローチ |
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| Research Abstract |
ヒトゲノムDNAには遺伝子コピー数の変化(copy number variation:CNV)が存在し,その中の幾つかのCNVの異常が神経疾患発症の原因となることが明らかにされている.例えば,家族性アルツハイマー病家系におけるアミロイド前駆体タンパク(APP)遺伝子重複や遺伝性パーキンソニズムにおけるαシヌクレイン(SNCA)遺伝子重複がその例である.少ない発症者を有する家系のサンプル収集のみが可能な遺伝性神経疾患には原因遺伝子が未同定な疾患が数多く存在している.本研究では,このような遺伝子未同定の遺伝性神経変性疾患の小家系に着目して,CNV異常による新規の遺伝子変異を探求することを目的としている.
本年度は,家系のサンプル品質のチェックにより解析可能なゲノムDNAについて,DNAチップを用いた網羅的な解析を行った.Human Omni Express Chip(Illumina社)を解析に用いた.このHuman Omni Express Chipには,733,202の一塩基置換多型(SNPs)が平均4.1kb間隔に全ゲノム上に配置されている.このDNAチップを用い網羅的解析を行うと,健常人においてもCNV領域が複数存在しているが,そのCNV領域は健常人毎により異なっていた.血族結婚を有する若年性パーキンソン病(PARK2)患者のCNV領域をKaryoStudioを用いて健常者との比較を行ったところ,第6番染色体長腕にLOH(loss of heterozygosity)領域が存在し,その部位の遺伝子量がnullとなり欠失変異であることが想定された.さらに,24サンプルの小家系(遺伝性認知症,遺伝性パーキンソニズム)のCNV解析を終了し,健常者との比較により患者特異的に存在するCNV領域群を検出した.
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