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2010 Fiscal Year Annual Research Report

性差のエピゲノム解析

Research Project

Project/Area Number 21221008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

塩田 邦郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80196352)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 八木 慎太郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 特任教授 (10420225)
大鐘 潤  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教 (50313078)
中山 裕之  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (40155891)
種村 健太郎  東京大学, 国立医薬品食品衛生研究所・毒性部, 主任研究官 (20332322)
KeywordsDNAメチル化プロフィール / T-DMR / 発生分化 / 性依存性 / 常染色体 / 性染色体
Research Abstract

平成21年度のゲノム全域のDNAメチル化解析(D-REAM法)の結果を基とし、同定したT-DMRの解析および新たに精子・精原細胞を含む複数の組織・細胞のD-REAM法による解析を進めた。
性ホルモン依存性T-DMRの同定と発生・分化のDNAメチル化ダイナミクス:21年度に同定したT-DMRのうち複数領域について、性腺切除・性ホルモン付加手術を施した成熟雌・雄マウスの主要な組織(肝臓・大脳等)でのメチル化状況を調べた。その結果雄性ホルモン依存的にメチル化が変化する領域を見いだした。この領域のメチル化状況は発生時期依存的に変化することも確認した。
性染色体の染色体全域のメチル化変化:未分化ES細胞と成体組織とを比較すると、常染色体、性染色体ともに、雌雄共通したT-DMRを同定することができ、ESで脱メチル化している遺伝子の周辺にはSINE、メチル化されている遺伝子周辺にはLINEが多いという特徴を示した。しかしX染色体に着目すると、雄では成体で高メチル化を示すのに対し、雌では成体で低メチル化と雌雄で異なる傾向を示した。興味あることにX染色体はLINEが多くSINEがほとんど無いという特徴を持つことから、X不活化とDNAメチル化プロフィールの形成との関連について新たな切り口を与えている。さらに雌雄で異なるメチル化変動を示す遺伝子には、複数の疾患関連遺伝子が含まれることが判明した。
少量サンプルの解析技術の確立:T-DMRの多領域・少量サンプルメチル化解析技術確立を目的とし、T-DMRを持つ遺伝子の多領域・少量サンプルでの発現解析法の検討を行い、系を確立した。
卵特有ピストン(Hlfoo)のDNAメチル化プロフィール形成への関与:Hlfooは、卵でのみ発現し、受精後速やかに消失する。またHlfoo遺伝子はT-DMRを有し、雄や雌組織で高度にメチル化される。雄のES細胞にHlfooを強制発現させたところ、一部の卵子形成に重要な遺伝子領域のメチル化が変化することを確認し、卵子のDNAメチル化プロフィール形成に関与することが示唆された。

  • Research Products

    (18 results)

All 2010 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Enrichment of short interspersed transposable elements to embryonic stem cell-specific hypomethylated gene regions.2010

    • Author(s)
      H.Muramoto, et al.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 15 Pages: 855-865

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA methylation status of nuclear-encoded mitochondrial genes underliesthe tissue-dependent mitochondrial functions.2010

    • Author(s)
      M.Takasugi, et al.
    • Journal Title

      BMC Genomics

      Volume: 11 Pages: 481

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs) residing in mouse pluripotent stem cells.2010

    • Author(s)
      S.Sato, et al.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 15 Pages: 607-618

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide analysis of epigenetic signatures for kidney-specific transporters.2010

    • Author(s)
      R.Kikuchi, et al.
    • Journal Title

      Kidney Int

      Volume: 78 Pages: 569-577

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 細胞・組織特異的DNAメチル化領域-ES細胞、ips細胞及び組織のDNA2010

    • Author(s)
      村本玄紀, 他
    • Journal Title

      実験医学(増刊)

      Volume: 28 Pages: 81-86

  • [Journal Article] エイジングおよびアンチエイジングのためのエピジェネティクス2010

    • Author(s)
      早川晃司, 他
    • Journal Title

      アンチエイジング医学-日本抗加齢医学会雑誌

      Volume: 6(1) Pages: 50-57

  • [Journal Article] 肥満・肥満症の成因と発症機序 エピジェネティック調節2010

    • Author(s)
      高杉征樹, 他
    • Journal Title

      日本臨林

      Volume: 68(2) Pages: 307-312

  • [Presentation] 細胞・組織特異転写因子ネットワークのエピジェネティクス2010

    • Author(s)
      塩田邦郎
    • Organizer
      第51回日本組織細胞化学会総会
    • Place of Presentation
      秋葉原コンベンションホール(東京)
    • Year and Date
      20100904-20100905
  • [Presentation] Transposable elements are genomic landmarks for DNA hypomethy lation specific to embryonic stem cells.2010

    • Author(s)
      Hiroki Muramoto, et al.
    • Organizer
      75th Cold Spring Harbor Symposium : Nuclear Organization & Function
    • Place of Presentation
      Cold Spring Harbor, NY, U.S.A
    • Year and Date
      20100602-20100607
  • [Presentation] ES細胞特異的低メチル化遺伝子領域は特徴的な反復配列分布を示す/Enrichment of short interspersed transposable elements(SINEs)to embryonic stem cell(ESCs)-specific hypomethylated gene regions.2010

    • Author(s)
      村本玄紀, 他
    • Organizer
      第4回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      米子市文化ホール(鳥取県)
    • Year and Date
      20100528-20100529
  • [Presentation] Genome-wide DNA methylation profile of pluripotent stem Cells.2010

    • Author(s)
      Shinya Sato, et al.
    • Organizer
      Experimental Biology2010
    • Place of Presentation
      Anaheim, CA, U.S.A
    • Year and Date
      20100424-20100428
  • [Presentation] Epigenetic marks of nuclear-encoded mitochondrial genesby DNA methylation.2010

    • Author(s)
      Masaki Takasugi, et al.
    • Organizer
      Experimental Biology2010
    • Place of Presentation
      Anaheim, CA, U.S.A
    • Year and Date
      20100424-20100428
  • [Presentation] Gene-orientation-dependent DNA methylation patterns in the mouse prolactin(Prl)family gene cluster locus.2010

    • Author(s)
      Koji Hayakawa, et al.
    • Organizer
      Experimental Biology2010
    • Place of Presentation
      Anaheim, CA, U.S.A
    • Year and Date
      20100424-20100428
  • [Presentation] Enrichment of Short interspersed transposable elements(SINEs) in hypomethy lated genic regions in embryonic stem cells.2010

    • Author(s)
      Hiroki Muramoto, et al.
    • Organizer
      Experimental Biology2010
    • Place of Presentation
      Anaheim, CA, U.S.A
    • Year and Date
      20100424-20100428
  • [Presentation] Epigenetic marks of nuclear-encoded mitochondoria genes by DNA.2010

    • Author(s)
      Masaki Takasugi, et al.
    • Organizer
      Experimental Biology2010
    • Place of Presentation
      Anaheim, CA, U.S.A
    • Year and Date
      20100424-20100428
  • [Presentation] 環境リスクのエピジェネティクスとエピゲノム研究2010

    • Author(s)
      塩田邦郎
    • Organizer
      日本薬学会環境衛生部会主催フォーラム2010:衛生薬学・環境トキシコロジーにおけるフォーラム
    • Place of Presentation
      星薬科大学(東京)
    • Year and Date
      2010-09-09
  • [Presentation] Epigenomic Profiling 0f Mouse Intostinal Mucosa2010

    • Author(s)
      八木慎太郎
    • Organizer
      JST-食の安全研究センター共催ワークショップThe ROLE OF NUTRITION AND MICROBIOTAIN EARLY LIFE
    • Place of Presentation
      東京大学農学部食の安全研究センター(東京)
    • Year and Date
      2010-03-08
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.vm.a.u-tokyo.ac.jp/seika/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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