2013 Fiscal Year Final Research Report
Analysis of Sex-dependent Epigenome
| Project/Area Number |
21221008
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
基礎ゲノム科学
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
SHIOTA Kunio 東京大学, 農学生命科学研究科, 教授 (80196352)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
YAGI Shintaro 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任教授 (10420225)
OHGANE Jun 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教 (50313078)
NAKAYAMA Hiroyuki 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 教授 (40155891)
TANEMURA Kentaro 東北大学, 農学研究科, 准教授 (20332322)
YAMANOUCHI Keitaro 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授 (70272440)
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| Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) |
TANAKA Satoshi 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授 (90242164)
KIKUSUI Takefumi 麻布大学, 獣医学部, 教授 (90302596)
YAMANOUCHI Keitaro 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 准教授 (70272440)
YAGI Shintaro 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任教授 (10420225)
TANEMURA Kentaro 東北大学, 農学研究科, 准教授 (20332322)
HIROSAWA Mitsuko 東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 助教
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| Project Period (FY) |
2009-05-11 – 2014-03-31
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| Keywords | ゲノム / エピゲノム / ゲノムネットワーク / T-DMR / 性差 / DNAメチル化 / ヒストン修飾 |
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| Research Abstract |
What is known about the biology of sexual differences is that there are striking differences in the biological functions that can lead to human and animal diseases. Epigenetic systems are recognized as memory systems for inheritable gene functions. DNA methylation plays a role the main epigenetic regulation mechanism in mammals. A unique feature of the mammalian genome is that there are numerous tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs), which include genes and their regulatory elements. We have developed D-REAM, a genome-wide DNA methylation analysis method using a genome tiling array, for T-DMRs profiling with restriction tag-mediated amplification. This research project highlights the epigenome of tissues and cells in male and female respectively. We found that there are T-DMRs that are differentially methylated between male and female animals, other than those found in the sex chromosomes and the genomic regions related to sexual organs development.
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Research Products
(49 results)
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[Journal Article] Epigenetic assessment of environmental chemicals detected in maternal peripheral and cord blood samples2011
Author(s)
Arai Y, Ohgane J, Yagi S, Ito R, Iwasaki Y, Saito K, Akutsu K, Takatori S, Ishii R, Hayashi R, Izumi S, Sugino N, Kondo F, Horie M, Nakazawa H, Makino T, Shiota K
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Journal Title
J Reprod Dev
Volume: 57(4)
Pages: 507-17
Peer Reviewed
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[Journal Article] Genome-wide DNA methylation profile of tissue-dependent and differentially methylated regions (T-DMRs) residing in mouse pluripotent stem cells2010
Author(s)
Sato S, Yagi S, Arai Y, Hirabayashi K, Hattori N, Iwatani M, Okita K, Ohgane J, Tanaka S, Wakayama T, Yamanaka S, Shiota K
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Journal Title
Genes Cells
Volume: 15(6)
Pages: 607-18
DOI
Peer Reviewed
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[Remarks] 国際シンポジウムの主催 性差のエピジェネティクスの基礎から応用の情報交換と社会への発信を目指して、国際シンポジウム"Sex-Differences in Epigenetics and Epigenomics"を開催し、(中島ホール、東京大学フードサイエンス棟 2012年9月12日)、学生、大学院生、一般の研究者を対象に、性差に関するエピジェネティクスの重要性をアピールした。本研究プロジェクトメンバー(4名:八木、早川、中西、高杉)により成果の一部を発表した (学会発表15-18)。また、海外からDr. Scott Coonrod (Cornel Univ.), Dr. Masako Suzuki (Albert Einstein College of Medicine)、国内から服部奈緒子博士(国立がんセンター)、秦健一郎博士(国立成育医療センター)を演者に招き、総合討論を行った。
