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2011 Fiscal Year Annual Research Report

巨大炭素鎖を持つ特異な天然有機分子の化学

Research Project

Project/Area Number 21221009
Research InstitutionKanagawa University

Principal Investigator

上村 大輔  神奈川大学, 理学部, 教授 (00022731)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大野 修  慶應義塾大学, 理工学部, 助教 (20436992)
末永 聖武  慶應義塾大学, 理工学部, 准教授 (60273215)
有本 博一  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (60262789)
宮本 憲二  慶應義塾大学, 理工学部, 准教授 (60360111)
Keywords巨大炭素鎖有機分子 / 生物活性 / 海洋生物共生鞭毛藻 / 生物学的存在意義 / 分子量2,169 / 生体内動態 / メタゲノム
Research Abstract

巨大炭素鎖有機分子の代表的な存在であるハリコンドリンBの合成誘導体、エリブリンが乳がんの末期患者のための治療薬として、全世界的に認可、使用されるに至った。テレビ番組として放映され、社会的にも大きなインパクトを与えた。
巨大炭素鎖有機分子の創製に力を注ぎ、共生渦鞭毛藻の培養から、新たに分子駄2,169のアンジゲノールAをはじめ、典型的な巨大炭素有機分子を得た。この構造決定は、独自に開発したGrubbs触媒を利用したallyl v-o-dio1の選択的酸化分解法を駆使して遠成することが出来た。A、B、Cが存在する。生物活性としては、抗肥満薬リードとして期待できる脂肪蓄積阻書活性が確認できた。
分子量5,088の分子については、分離法の改良に成功して、イオン交換樹脂による分離をうまく適用でき、すでに推定している部分構造とオレフィンメタセシス条件での独自のallyIvio-diol分解法を駆使して、現在構造解析中である。分子量8,245の分子についても分離に成功しており、今後構造解析に入る。
サンゴの幼生の変態、着生を誘導する新規マクロライド、ルミナオライドの立体化学を推定することが出来た。こういった分子の立体構造を考える上でROESY法を使ったNOE解析と、JBCA法の利用による立体配座解析が、極めて有効であることが分かった。以上のように、巨大炭素鎖有機分子に関する研究は順調に進捗し、目的とする新しい化学物資の世界、「巨大炭素鎖分子の化学」が創成されつつあると認識できるようになった。これらの内容は、IUPACの天然物化学国際会議の基調講演で紹介した。
一方、クロイソカイメン由来の難培養性バクテリアのフォスミドライブラリを構築した。15万クローンあるので物質生産を検討したところ、新規物質のビスインドール体が発見できた。これを継続進展させれば、さらに大きな生成物が期待できる。加えて、この方法はバック法ライブラリーへと展開でき、さらに大きな分子の構築が可能である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予想以上の成果が出ていると評価できるが、若干の生物的な研究課題の進展が遅れており、上記の自己評価とした。これは、1)残された時間の有効な活用と重点的な研究集約、2)新たな共同研究者(分担者としてではない)の参入、によって解決できる内容であると理解している。

Strategy for Future Research Activity

分子量8,000以上巨大炭素鎖分子については、未知を切り拓きつつ前進する必要があり苦労を強いられているが、培養法の圧倒的な進展と巨大炭素鎖有機分子の物質量確保を遂行して解決する。ポリクロナール抗体を用いる分子局在解明に当っては、共焦点顕微鏡での分子直接観察法の開拓を検討する。分子の形のためにはSAXS法を適用する予定である。また、合成遺伝子取得では共生バクテリアの除去が重要と考える。さらに、メタゲノム研究では、対応するバックライブラリーの構築に全力を尽くす。
これらの問題を解決し、「巨大炭素鎖有機分子の化学」の完成へ向けて進める。

  • Research Products

    (56 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (14 results) (of which Peer Reviewed: 12 results) Presentation (32 results) Book (7 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Recent Insights into Natural Venoms2012

    • Author(s)
      D.Uemura, C-G.Han, N.Hanif, T.Inuzuka, N.Maru, H.Arimoto
    • Journal Title

      Pure Appl.Chem.

      Volume: 84(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mapping of a Lipoglycopeplide Antibiolic Binding Site on Staphylococcus aureus Penicillin-Binding Protein 2 Using a Vancomycin Photoaffinity Analogue2012

    • Author(s)
      J.Nakamura, R.Ichikawa, H.Yamashiro, T.Takasawa, X.Wung, Y.Kawai, S.Xu, H.Maki, H.Arimoto
    • Journal Title

      Med.Chem.Commun.

      Volume: 3(掲載確定)

    • DOI

      10.1039/C2MD20005H

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biselyngbyaside, isolated from marine cyanobacteria, inhibits osteoclastogenesis and induces apoptosis in mature osteoclasts2012

    • Author(s)
      T.Yonezawa, N.Mase, H.Sasaki, T Teruya, S.Hasegawa, B.-Y.Cha, K.Yagasaki, K.Suenaga, K.Nagai, J-T.Woo
    • Journal Title

      J.Cell.Biochem.

      Volume: 113 Pages: 440-448

    • DOI

      10.1002/jcb.23213

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biselyngbyolide A, a Novel Cytotoxic Macrolide from the Marine Cyanobacterium Lyngbya sp2012

    • Author(s)
      M.Morita, O.Ohno, K.Suenaga
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 41 Pages: 165-167

    • DOI

      10.1246/cl.2012.165

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Aplyronines D-H from the sea hare Aplysia kurodai : isolation, structures, and cytotoxicity2012

    • Author(s)
      M.Ojika, H.Kigoshi, K.Suenaga, Y.Imamura, K.Yoshikawa, T.Ishigaki, A.Sakakura, T.Mutou, K.Yamada
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 68 Pages: 982-987

    • DOI

      10.1016/j.tet.2011.11.095

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of a Metagenomic Library for the Marine Sponge Halichondriao kadai2012

    • Author(s)
      T.Abe, F.P.Sahin, K.Akiyama, T.Naito, M.Kishigami, K.Miyamoto, Y.Sakakibara, D.Uemura
    • Journal Title

      Biosci.Biotechnol.Biochem.

      Volume: 76(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation of 9-Hydroxy-10E, 12Z-octadecadienoic Acid, an Inhibitor of Fat Accumulation from Valeriana fauriei2012

    • Author(s)
      K.Yuki, M.Ikeda, K.Miyamoto, O.Ohno, K.Yamada, D.Uemura
    • Journal Title

      Biosci.Biotechnol.Biochem.

      Volume: 76(掲載確定)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 特集日本の化学:その元気度は?(天然物化学)そこに「オリジナリティー」はあるか?!2012

    • Author(s)
      上村大輔
    • Journal Title

      化学

      Volume: 67 Pages: 28-30

  • [Journal Article] サイエンス・インタビュー科学の今、そして未来「生物が作りだす毒から探る知られざる生命のしくみ」2012

    • Author(s)
      上村大輔
    • Journal Title

      自然と科学の情報誌ミルシル(国立科学博物館)

      Volume: 5 Pages: 3-5

  • [Journal Article] Amdigenol A, a Long Carbon-backbone Polyol Compound Produced by the Marine Dinoflagellate Amphidinium sp2011

    • Author(s)
      T. Inuzuka, H. Yamamoto, D. Uemura
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett

      Volume: 239-302

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2011.11.033

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Melanin Biosynthesis Inhibitors from Tarragon Artemisia dracunculus2011

    • Author(s)
      M.Yamada, K.Nakamura, T.Watabe, O.Ohno, M.Kawagoshi, N.Maru, N.Uotsu, T.Chiba, K.Yamaguchi, D.Uemura
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry

      Volume: 75巻 Pages: 1628-1630

    • DOI

      10.1271/bbb.110306

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Grubbs carbene complex-catalyzed cleavage of allyl vic-diols to aldehydes with a co-oxidant : application to the selective cleavage of huge marine molecules2011

    • Author(s)
      C-G.Han, Y.Yamamoto, F.Kakiuchi, K.Nakamura, D.Uemura
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 67 Pages: 9622-9626

    • DOI

      10.1016/j.tet.2011.09.002

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Halichonines A, B, and C, Novel Sesquiterpene Alkaloids from the Marine Sponge Halichondria okadai Kadota2011

    • Author(s)
      O.Ohno, T.Chiba, S.Todoroki, H.Yoshimura, N.Maru, K.Maekawa, H.Imagawa, K.Yamada, A.Wakamiya, K.Suenaga, D.Uemura
    • Journal Title

      Chem.Commun.

      Volume: 47 Pages: 12453-12455

    • DOI

      10.1039/C1CC15557A

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of Isotopically Labeled Fusarium Mycotoxin ^<13>C_2-Moniliformin [1-Hydroxy cyclo-but-1-ene-3,4-dione]2011

    • Author(s)
      L.Lohrey, T.Murata, D.Uemura, H.-U.Humpf
    • Journal Title

      Synlett.

      Volume: 22 Pages: 2242-2244

    • DOI

      10.1055/s-0030-1261189

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 創薬リードとしての天然物を考える2012

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      日本薬学会132年会シンポジウム
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2012-03-31
  • [Presentation] アクチン脱重合活性物質レイジスポンジオリドAの合成研究2012

    • Author(s)
      鈴木一司、鳥居原英輔、秋山聡史、照屋俊明、大野修、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-28
  • [Presentation] タコクラゲに由来する紫外線吸収物質の探索2012

    • Author(s)
      田中彩奈、宮本憲二、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-28
  • [Presentation] カノコソウに由来する新規脂肪蓄積阻害物質の探索と構造決定2012

    • Author(s)
      結城慧仁、池田麻里子、宮本憲二、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-28
  • [Presentation] クロイソカイメン由来新規セスキテルペンアルカロイドhalichonine類の構造と生物活性2012

    • Author(s)
      大野修、轟星児、吉村英明、丸範人、前川健、今川洋、若宮淳志、末永聖武、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来の新規マクロリドLeptolyngbyolide類の生物活性2012

    • Author(s)
      森田真布、大野修、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来のマクロリドBiselyngbyaside類の単離と構造2012

    • Author(s)
      森田真布、大野修、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] 抗菌性デプシペプチドMiuraenamide Aの合成研究2012

    • Author(s)
      遠山洸・徳住啓太・伊藤嘉昌子・鳥居原英輔・末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-27
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来新規環状デプシペプチドの単離と構造決定2012

    • Author(s)
      梶山雄司、大野修、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-26
  • [Presentation] Bisebromoamide類の合成研究2012

    • Author(s)
      清水裕人、渡邊敦、轟星児、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-26
  • [Presentation] 感染症の制御に向けた化学からのアプローチ2012

    • Author(s)
      有本博一
    • Organizer
      中西シンポジウム2012(主催:日本化学会、中西シンポジウム実行委員会)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-25
  • [Presentation] The Search for Bioactive Natural Products with a Focus on Biological Phenomena2012

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      中西シンポジウム2012(主催:日本化学会、中西シンポジウム実行委員会)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-03-25
  • [Presentation] The Search for Bioactive Natural Products with a Focus on Biological Phenomena2012

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      7^<th> International Symposium on the Kanagawa University-National Taiwan University Exchange Program 2012
    • Place of Presentation
      平塚
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] 感染症の理解と制御のための化学的アプローチ2011

    • Author(s)
      有本博一
    • Organizer
      日本化学会会員増強のための講演会:いま伝えたい化学の新しい魅力
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2011-11-25
  • [Presentation] Structures and Bioactivities of Novel Macrolides Leptolyngbyalides from Marine Cyanobacteria2011

    • Author(s)
      Morita, M, Ohno, O., Teruya, T., Kita, M., Kigoshi, H., Kitamura, K., Hirata, K., Suenaga, K.
    • Organizer
      10th International Symposium on Organic Reactions (ISOR10)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-11-23
  • [Presentation] Halichonines A, B, and C, Novel Cytotoxic Alkaloids from the Marine Sponge Halichondria okadai Kadota2011

    • Author(s)
      Ohno, O., Todoroki, S., Yoshimura, H., Wakamiya, A., Suenaga, K., Uemura, D.
    • Organizer
      10th International Symposium on Organic Reactions (ISOR10)
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-11-22
  • [Presentation] Topics in the Research Institute of Natural Drug-leads at Kanagawa University2011

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      International Symposium of Natural Products Chemistry and Chemical Biology
    • Place of Presentation
      杭州(中国)
    • Year and Date
      2011-11-20
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来の新規マクロリドLeptolyngbyalide類の構造と生物活性2011

    • Author(s)
      森田真布、大野修、照屋俊明、北将樹、木越英夫、北村和大、平田川生、末永聖武
    • Organizer
      第25回海洋生物活性談話会
    • Place of Presentation
      三浦
    • Year and Date
      2011-10-08
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来の新規マクロリドLeptolyngbyalide類の構造と生物活性2011

    • Author(s)
      森田真布、大野修、照屋俊明、北将樹、木越英夫、北村和大、平田邦生、末永聖武
    • Organizer
      第53回天然物有機化合物討諭会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2011-09-27
  • [Presentation] 化学プローブを駆使したニトロ化ヌクレオチドの動態解明2011

    • Author(s)
      有本博一
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会シンポジウム「活性酸素種の可視化と情報伝達系解明への応用」
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-09-24
  • [Presentation] 化学生態学とタンパク毒2011

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      第16回日本病態プロテアーゼ学会学術集会
    • Place of Presentation
      豊中
    • Year and Date
      2011-08-26
  • [Presentation] Melanin Biosynthesis Inhibitors from Plant Resources2011

    • Author(s)
      Nakamura, K., Ohno, O., Yamada, M., Watabe, T., Kawagoshi M., Maru, N., Uotsu, N., Chiba, T., Yamaguchi, K., Uemura D.
    • Organizer
      27th International Symposium on Natural Products and the 7th Intemationul Conference on Biodiversity (ISCNP-27 & ICOB-7)
    • Place of Presentation
      Brisbane, Australia
    • Year and Date
      2011-07-14
  • [Presentation] Recent Topics of Natural Venoms2011

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      27^<th> International Symposium on the Chemistry of Natural Products (ISCNP27)
    • Place of Presentation
      ブリスベン(オーストラリア)
    • Year and Date
      2011-07-13
  • [Presentation] 細胞応答を制御する新規生物活性天然物の探索研究2011

    • Author(s)
      大野修
    • Organizer
      第46回天然物化学談話会
    • Place of Presentation
      熱川
    • Year and Date
      2011-07-08
  • [Presentation] 環状ヘプタペプチド及びその用途2011

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      第10回バイオテクノロジー国際会議バイオアカデミックフォーラム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-06-29
  • [Presentation] Structures and Bioactivities of Novel Macrolide Glycosides from Marine Cyanobacteia2011

    • Author(s)
      Morita, M., Teruya, T., Ohno, O., Suenaga, K.
    • Organizer
      6th Korea-Japan Young Scientists Meeting on Bioorganic and Natural Products Chemistry
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2011-06-23
  • [Presentation] Isolation and Structure Determination of a Novel Thiazole Compound from an Okinawan Marine Cyanobacterium2011

    • Author(s)
      Same, K., Ohno, O., Teraya, T., Suenaga, K.
    • Organizer
      6th Korea-Japan Young Scientists Meeting on Bioorganic and Natural Products Chemistry
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2011-06-23
  • [Presentation] アクチン脱重合物質が有する腫瘍細胞へのアポトーシス誘導活性の解析2011

    • Author(s)
      大野修、森田真布、北将樹、木越英夫、北村和大、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      平成23年度新規素材探索研究会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-06-10
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来新規鎖状ペプチドbisebromoamide類縁体の単離と構造決定2011

    • Author(s)
      梶山雄司、照屋俊明、大野修、末永聖武
    • Organizer
      平成23年度新規素材探索研究会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-06-10
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来新規チアゾール化合物の単離・構造決定2011

    • Author(s)
      佐名恭平、大野修、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      平成23年度新規素材探索研究会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2011-06-10
  • [Presentation] Chemical Approaches for Understanding and Controlling Infectious Diseases2011

    • Author(s)
      有本博一
    • Organizer
      The Uehara Memorial Foundation Synposium-2011 : Chembiomolecular Science : at the Frontier of Chemistry and Biology
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-06-08
  • [Presentation] アクチン脱重合物質による腫瘍細胞へのアポトーシス誘導活性の解析2011

    • Author(s)
      大野修、森田真布、北将樹、木越英夫、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2011-05-24
  • [Book] Chapter 10, Sea-Originated Cytotoxic Substances in Advances in Food and Nutrition Research, in Marine Medicinal Foods Implications and Applications : Animals and Microbes, Vol.65, pp.171-184(Ed.Se-Kwon Kim)2012

    • Author(s)
      N.Mara, D.Uemura
    • Total Pages
      523
    • Publisher
      Elsevier
  • [Book] Chapter 11, Secondary Metabolites with New Medicinal Functions from Marine Organisms in Advances in Food and Nutrition Research, in Marine Medicinal Foods Implications and Applications : Animals and Microbes, Vol.65, pp.185-193(Ed.Se-Kwon Kim)2012

    • Author(s)
      O.Ohno, K.Suenaga, D.Uemura
    • Total Pages
      523
    • Publisher
      Elsevier
  • [Book] Chapter 12, Bioactive Molecules from Symbiotic Marine Dinoflagellates, in Marine Pharmacognosy : Trends and Applications(Ed.Kim)2012

    • Author(s)
      M.Kita, T.Inuzuka, N.Maru, D.Uemura
    • Publisher
      CRC Press(未刊)(印刷中)
  • [Book] 農学・生命科学のための学術情報リテラシー2011

    • Author(s)
      有本博一(共著)斎藤忠夫編著
    • Total Pages
      122
    • Publisher
      朝倉書店
  • [Book] 天然物合成で活躍した反応:実験のコツとポイント(有機合成化学協会編)2011

    • Author(s)
      有本博一分担執筆
    • Total Pages
      224
    • Publisher
      化学同人
  • [Book] メタセシス反応(化学の要点シリーズ)2011

    • Author(s)
      上村大輔(担当編集委員)
    • Total Pages
      96
    • Publisher
      共立出版
  • [Book] 酸化還元反応(化学の要点シリーズ)2011

    • Author(s)
      上村大輔(担当編集委員)
    • Total Pages
      163
    • Publisher
      共立出版
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.chem.kanagawa-u.ac.jp/~uemura/

  • [Remarks]

    • URL

      http://www.educ.cc.keio.ac.jp/~suenaga

  • [Patent(Industrial Property Rights)] マクロジオライド化合物及びその用途2012

    • Inventor(s)
      上村大輔、北村誠、P.J.Schupp、中野義勝、丸範人、渡部多恵子
    • Industrial Property Rights Holder
      上村大輔
    • Industrial Property Number
      特願2012-82263
    • Filing Date
      2012-03-14

URL: 

Published: 2013-06-26  

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