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2012 Fiscal Year Annual Research Report

巨大炭素鎖を持つ特異な天然有機分子の化学

Research Project

Project/Area Number 21221009
Research InstitutionKanagawa University

Principal Investigator

上村 大輔  神奈川大学, 理学部, 教授 (00022731)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大野 修  慶應義塾大学, 理工学部, 助教 (20436992)
有本 博一  東北大学, 生命科学研究科, 教授 (60262789)
末永 聖武  慶應義塾大学, 理工学部, 准教授 (60273215)
宮本 憲二  慶應義塾大学, 理工学部, 准教授 (60360111)
Project Period (FY) 2009-05-11 – 2014-03-31
Keywords巨大炭素鎖有機分子 / 生物活性 / 海洋生物共生鞭毛藻 / 生物学的存在意義 / 生体内動態 / メタゲノム / バックライブラリー
Research Abstract

推定分子量 5148の巨大炭素鎖有機分子は、NMR 解析から多数のオレフィン構造を有することが判った。エチレン雰囲気下グラブス触媒によるオレフィン開裂反応を行い、分解断片混合物が生成した。HPLC分離を繰返して、その一つ(mw=398)の単離に成功し、二次元 NMR、ESI-MSの情報、アセチル化物の NMR スペクトル解析により構造を明らかにした。他に19個の部分構造が判っている。他の分解断片の単離・構造解析を進めている。シアノバクテリア由来の細胞毒性化合物、リングビアシクラミドの相体立体構造を確定した。
クロイソカイメン共生微生物のメタゲノムから、100kb以上のゲノムDNAを形質転換可能なBACをベクターとしたバックライブラリーを構築するための予備検討を行い、遠心分離条件、高分子量ゲノムDNAの抽出方法を開発した。
海綿共生微生物のメタゲノム由来フォスミドライブラリーを用い、各種酵素について機能ベーススクリーニングを行ない、ラッカーゼとプロテアーゼ活性を見出した。フォスミドベクターに含まれる40 kbp程のインサート配列を次世代シークエンサーで解読、ラッカーゼ及びプロテアーゼ候補遺伝子を同定した。サブクローニングと発現を検討中である。
海洋天然物ハリクロリンと抗生物質ケンドマイシンの全合成に成功した。合成研究の過程で新規の減炭反応を発見し、反応条件や機構の検討をおこなった。シアノバクテリアより、新規18員環マクロリド、ビセリングビオライド類とビセリングビアサイド類を単離・構造を決定した。HeLa細胞に対して強い増殖阻害活性を示し、HeLa細胞内では小胞体に局在することが示唆された。
微細藻類より、種々のヒトがん細胞に対して細胞生存率の低下を伴わず顕著な増殖抑制活性を示す新規化合物トムルリンを単離した。2個のチアゾール環とアクリルアミド構造を有する新規物質である。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (53 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (16 results) (of which Peer Reviewed: 16 results) Presentation (34 results) (of which Invited: 10 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Apoptosis-inducing activity of the actin-depolymerizing agent aplyronine A and its side-chain derivatives2013

    • Author(s)
      Osamu Ohno, Maho Morita, Kazuhiro Kitamura, Toshiaki Teruya, Kozo Yoneda, Masaki Kita, Hideo Kigoshi Kiyotake Suenaga
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters

      Volume: 23 Pages: 1467-1471

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.12.052

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total Synthesis, Structural Elucidation, and Structure–Cytotoxic Activity Relationship of (–)-Gummiferol2013

    • Author(s)
      Hiroyoshi Takamura, Hiroko Wada, Nan Lu, Osamu Ohno, Kiyotake Suenaga, Isao Kadota
    • Journal Title

      The Journal of Organic Chemistry

      Volume: 78 Pages: 2443-2454

    • DOI

      10.1021/jo302665c

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Allelopathy is involved in the formation of pure colonies of the fern Gleichenia japonica2013

    • Author(s)
      Hisashi Kato-Noguchi, Yoshihumi Saito, Osamu Ohno, Kiyotake Suenaga
    • Journal Title

      Journal of Plant Physiolog

      Volume: 170 Pages: 577-582

    • DOI

      10.1016/j.jplph.2012.11.015

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bisebromoamide, an extract from Lyngbya species, induces apoptosis through ERK and mTOR inhibitions in renal cancer cells2013

    • Author(s)
      K. Suzuki, R. Mizuno, K. Suenaga, T. Teruya, N. Tanaka, T. Kosaka, M. Oya
    • Journal Title

      Cancer Medicine

      Volume: 2 Pages: 32-39

    • DOI

      10.1002/cam4.53

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of a Metagenomic Library for the Marine Sponge Halichondria okadai2012

    • Author(s)
      T. Abe, F. P. Sahin, K. Akiyama, T. Naito, M. Kishigami, K. Miyamoto, Y.Sakakibara, D. Uemura
    • Journal Title

      Biosci. Biotechnol. Biochem.

      Volume: 76 Pages: 633-639

    • DOI

      10.1271/bbb.110533

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and Structure of a Novel Biindole Pigment Substituted with an Ethyl Group from a Metagenomic Library Derived from the Marine Sponge Halichondria okadai2012

    • Author(s)
      T. Abe, A. Kukita, K. Akiyama,T. Naito, D. Uemura
    • Journal Title

      Chem. Lett.

      Volume: 41 Pages: 728-729

    • DOI

      10.1246/cl.2012.728

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stereoselective synthesis of the C94-C104 fragment of symbiodinolide2012

    • Author(s)
      H. Takamura, K. Tsuda, Y. Kawakubo, I. Kadota, D. Uemura
    • Journal Title

      Tetrahedron Letters

      Volume: 53 Pages: 4317-4319

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2012.06.005

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mapping of a Lipoglycopeptide Antibiotic Binding Site on Staphylococcus aureus Penicillin-Binding Protein 2 Using a Vancomycin Photoaffinity Analogue2012

    • Author(s)
      J. Nakamura, R. Ichikawa, H. Yamashiro, T. Takasawa, X. Wang, Y. Kawai, S. Xu, H. Maki, H. Arimoto
    • Journal Title

      Med. Chem. Commun.

      Volume: 3 Pages: 691-695

    • DOI

      10.1039/C2MD20005H

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ternatin, a cyclic peptide isolated from mushroom, and its derivative suppress hyperglycemia and hepatic fatty acid synthesis in spontaneously diabetic KK-Ay mice2012

    • Author(s)
      M. Kobayashi, H. Kawashima, K. Takemori, H. Ito, A. Murai, S. Masuda, K. Yamada, D. Uemura, F. Horio
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun.

      Volume: 427 Pages: 299-304

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2012.09.045

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Elucidation of the active conformation of vancomycin dimers with antibacterial activity against vancomycin-resistant bacteria2012

    • Author(s)
      J. Nakamura, H. Yamashiro, S. Hayashi, M. Yamamoto, K. Miura, S. Xu, T. Doi, H. Maki, O. Yoshida, H. Arimoto
    • Journal Title

      Chem. Eur. J.

      Volume: 18 Pages: 12681-12689

    • DOI

      10.1002/chem.201201211

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nitric oxide promotes recycling of 8-nitro-cGMP, a cytoprotective mediator, into intact cGMP in cells2012

    • Author(s)
      Saito,Y.; Sawa,T.; Yoshitake,J.; Ito,C.; Fujii,S.; Akaike, T.; Arimoto, H.
    • Journal Title

      Mol. BioSyst

      Volume: 8 Pages: 2909-2915

    • DOI

      10.1039/c2mb25189b

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and structures of biselyngbyasides B, C, and D from the marine cyanobacterium Lyngbya sp., and the biological activities of biselyngbyasides2012

    • Author(s)
      M. Morita, O. Ohno, T. Teruya, T. Yamori, T. Inuzuka, K. Suenaga
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 68 Pages: 5984-5990

    • DOI

      10.1016/j.tet.2012.05.038

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation of allelopathic substance from Piper sarmentosum Roxb2012

    • Author(s)
      P. Piyatida, K. Suenaga, O. Ohno, H. Kato-Noguchi
    • Journal Title

      Allelopathy Journal

      Volume: 30 Pages: 93-102

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fluorescent Aplyronine A: Intracellular Accumulation and Disassembly of Actin Cytoskeleton in Tumor Cells2012

    • Author(s)
      Masaki Kita, Kozo Yoneda, Yuichiro Hirayama, Kota Yamagishi, Yuki Saito, Yuka Sugiyama, Yoshihiro Miwa, Osamu Ohno, Maho Morita, Kiyotake Suenaga, Hideo Kigoshi
    • Journal Title

      Chem. Bio. Chem.

      Volume: 13 Pages: 1754-1758

    • DOI

      10.1002/cbic.201200385

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure-Activity Studies on the Spiroketal Moiety of a Simplified Analog of Debromoaplysiatoxin with Antiproliferative Activity2012

    • Author(s)
      M. Kikumori, R. Yanagita, H. Tokuda, N.Suzuki, H.Nagai, K. Suenaga, K. Irie
    • Journal Title

      J. Med. Chem.

      Volume: 55 Pages: 5614-5626

    • DOI

      10.1021/jm300566h

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total synthesis and biological evaluation of auripyrones A and B2012

    • Author(s)
      I. Hayakawa, T. Takemura, E. Fukasawa, Y. Ebihara, N.Sato, T. Nakamura, K. Suenaga H. Kigoshi
    • Journal Title

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      Volume: 85 Pages: 1077­1092

    • DOI

      10.1246/bcsj.20120162

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 創薬シーズを海に求めて

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      静岡大学理学部JST「未来の科学者養成講座」、 「静岡サイエンススクール」
    • Place of Presentation
      静岡
    • Invited
  • [Presentation] クロイソカイメンとハリコンドリンB

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      エーザイ乳腺フォーラム  - ハラヴェンのル-ツを探る -
    • Place of Presentation
      東京(虎ノ門病院)
    • Invited
  • [Presentation] クロイソカイメンとハリコンドリンB

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      エーザイ化学療法カンファレンス  - ハラヴェンのル-ツを探る -
    • Place of Presentation
      東京(がん研究会がん研究所「吉田講堂」)
    • Invited
  • [Presentation] 天然医薬リードを海に求めて

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      有機合成化学協会関東支部ミニシンポジウム千葉2012
    • Place of Presentation
      千葉
    • Invited
  • [Presentation] Intriguing Natural Products from Marine Sources

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      International Symposium of Natural Products Chemistry and Chemical Biology
    • Place of Presentation
      中国 杭州
    • Invited
  • [Presentation] Lovely Natural Products in the Marine Chest

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      3rd International Symposium on Creation of Functional Materials -Coordination Chemistry at the Front-(Strategic Initiative (A), University of Tsukuba)
    • Place of Presentation
      筑波
    • Invited
  • [Presentation] ハリコンドリンBの発見

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      エーザイ主催「ハラヴェン発売1周年記念講演会」
    • Place of Presentation
      横浜
    • Invited
  • [Presentation] ハリコンドリンBの発見

    • Author(s)
      上村大輔
    • Organizer
      エーザイ主催「Meet The Expert 第1報」
    • Place of Presentation
      名古屋(名古屋大学医学部)
    • Invited
  • [Presentation] Structure and Biological Activity of Biselyngbyasides, Novel Macrolides Isolated from Marine Cyanobacteria

    • Author(s)
      末永聖武
    • Organizer
      The 1st Mini-Symposium Between Keio University and National Tsing Hua University
    • Place of Presentation
      台湾
    • Invited
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来マクロリドの単離構造決定と生物活性

    • Author(s)
      末永聖武
    • Organizer
      微生物化学研究所セミナー
    • Place of Presentation
      東京
    • Invited
  • [Presentation] サンゴ幼生変態誘導活性物質luminaolideの立体構造

    • Author(s)
      山本啓太、丸範人、犬塚俊康、北村誠、Peter J. Schupp、 上村大輔
    • Organizer
      新規素材探索研究会第11回セミナー
    • Place of Presentation
      横浜
  • [Presentation] クロイソカイメン由来メタゲノムライブラリーから単離した新規色素化合物の構造決定

    • Author(s)
      阿部孝宏、久木田彬、秋山清隆、内藤隆之、上村大輔
    • Organizer
      新規素材探索研究会第11回セミナー
    • Place of Presentation
      横浜
  • [Presentation] 脂肪蓄積阻害活性物質テルナチンのケミカルバイオロジー研究

    • Author(s)
      増田駿、田中陽子、上村大輔
    • Organizer
      新規素材探索研究会第11回セミナー
    • Place of Presentation
      横浜
  • [Presentation] クロイソカイメン由来新規セスキテルペンアルカロイドhalichonine類の構造と生物活性

    • Author(s)
      大野修、千葉建彦、轟星児、吉村英明、丸範人、前川健、今川洋、山田薫、若宮淳志、末永聖武、上村大輔
    • Organizer
      新規素材探索研究会第11回セミナー
    • Place of Presentation
      横浜
  • [Presentation] アクチン脱重合活性物質レイジスポンジオリドAの合成研究

    • Author(s)
      鈴木一司、秋山聡志、鳥居原英輔、照屋俊明、大野修、末永聖武
    • Organizer
      新規素材探索研究会第11回セミナー
    • Place of Presentation
      横浜
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来新規マクロリドbiselyngbyaside類の構造と生物活性

    • Author(s)
      大野修、森田真布、矢守隆夫、末永聖武
    • Organizer
      第16回日本がん分子標的治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      北九州
  • [Presentation] サンゴの生態に関与する特異な天然有機分子の多様性

    • Author(s)
      丸範人、増田駿、山本啓太、 鈴木祐太郎、北村誠、 Schupp Peter J.、山田薫、 上村大輔
    • Organizer
      第54回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] アクチン脱重合活性物質レイジスポンジオリドAの合成研究

    • Author(s)
      鈴木一司、秋山聡志、 鳥居原英輔、深澤英悟、大野修、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      第54回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] Lyngbyacyclamide Aの合成研究

    • Author(s)
      増田駿、鈴木祐太郎、丸範人、上村大輔
    • Organizer
      第2回CSJ化学フェスタ2012
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] 脂肪蓄積阻害活性物質テルナチンのケミカルバイオロジー研究

    • Author(s)
      田中陽子、増田駿、川添嘉徳、上村大輔
    • Organizer
      第2回CSJ化学フェスタ2012
    • Place of Presentation
      東京
  • [Presentation] クロイソカイメンメタゲノムからの色素生合成に関わる mono- oxygenase 遺伝子のクローニング

    • Author(s)
      阿部孝宏、久木田彬、秋山清隆、内藤隆之、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 脂肪蓄積阻害活性物質テルナチンのケミカルバイオロジー

    • Author(s)
      田中陽子、片桐佳祐、斉藤直紀、川添嘉徳、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 環状ドデカペプチドlyngbyacyclamide Aの合成研究

    • Author(s)
      増田駿、丸範人、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 海洋産細胞毒性ペプチドBisebromoamide類の合成研究

    • Author(s)
      清水裕人、永松祐美、渡邊敦、轟星児、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] ミウラエナミド A の全合成

    • Author(s)
      遠山洸、安井彩乃、徳住啓太、伊藤嘉昌子、鳥居原英輔、 末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 海洋微細藻類由来新規チアゾール化合物tomurulineの構造と生物活性

    • Author(s)
      大野修、佐名恭平、照屋俊明、清水史郎、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 海洋産マクロリドBiselyngbyaside類の構造と生物活性

    • Author(s)
      森田真布、大野修、照屋俊明、佐々木宏明、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 海洋シアノバクテリア由来のマクロリドbiselyngbyolide Bの単離と構造

    • Author(s)
      渡邊絢音、森田真布、大野修、照屋俊明、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] アクチン脱重合活性物質レイジスポンジオリドAの合成研究

    • Author(s)
      鈴木一司、秋山聡史、 鳥居原英輔、照屋俊明、大野修、末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] Biselyngbyaside類の合成研究

    • Author(s)
      田辺由利香、佐藤英祐、 中島修弥、大久保哲史、 末永聖武
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] サンゴ幼生変態誘引物質ルミナオライドの立体構造

    • Author(s)
      丸範人、山本啓太、北村誠、Schupp Peter J.、犬塚俊康、 山田薫、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] クロイソカイメン由来の微量生物活性物質

    • Author(s)
      山本啓太、丸範人、川添嘉徳、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] 渦鞭毛藻の大量培養とシンビオイミンの生理活性

    • Author(s)
      横田佳祐、川添嘉徳、上村大輔
    • Organizer
      日本化学会第93春季年会
    • Place of Presentation
      滋賀
  • [Presentation] リングビアシクラミドがもつがん細胞に対する強い細胞増殖抑制活性

    • Author(s)
      五十鈴川和人、丸範人、大野修、山田薫、上村大輔
    • Organizer
      日本薬学会第133年会
    • Place of Presentation
      横浜
  • [Remarks] 神奈川大学理学部化学科 上村研究室 天然医薬リード探索研究所

    • URL

      http://www.chem.kanagawa-u.ac.jp/~uemura/

  • [Remarks] 慶應義塾大学理工学部化学科 天然物化学研究室

    • URL

      http://www.educ.cc.keio.ac.jp/~suenaga

  • [Patent(Industrial Property Rights)] リングビアシクラミドを有効成分とする試薬、及び医薬2012

    • Inventor(s)
      上村大輔、丸範人、 大野修、 五十鈴川和人、山田薫
    • Industrial Property Rights Holder
      上村大輔
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2012-180264
    • Filing Date
      2012-07-31

URL: 

Published: 2014-07-24  

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