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2013 Fiscal Year Annual Research Report

極低温電子顕微鏡による細菌べん毛モーターと蛋白質輸送装置の像構造解析

Research Project

Project/Area Number 21227006
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

難波 啓一  大阪大学, 生命機能研究科, 教授 (30346142)

Project Period (FY) 2009-05-11 – 2014-03-31
Keywords細菌 / 蛋白質 / ナノバイオ / ナノマシン / 分子モーター
Research Abstract

細菌べん毛は回転モーターとらせん繊維型プロペラなどで構成される超分子ナノマシンである。本研究は、回転モーターでタンパク質輸送装置でもあるべん毛基部体で、未だに多くが不明な構成タンパク質の立体構造と配置と相互作用を解明し、基部体の動作機構を明らかにするのが目的である。
加速電圧300 kVの電子線には直径1ミクロンのサルモネラ菌は厚すぎて透過しづらいため、クライオ電子線トモグラフィーの解像度は10 nm以下に留まり、基部体の詳細な構造を見ることができない。そこで、FtsZの大量発現により直径0.4ミクロン程のミニ細胞を効率よく作成する条件を確立し、分解能を4 nm程度にまで向上させた。それぞれのミニ細胞には1~2本のべん毛と共に病原性因子分泌装置が複数見られた。両者はその構成蛋白質のアミノ酸配列相同性の高さと立体構造の類似性により、ともにIII型蛋白質輸送装置と呼ばれている。数多くのミニ細胞のトモグラムからべん毛基部体と病原性因子分泌装置の立体像を数十個抽出してそれぞれの平均像を求めた結果、これまで誰も見たことのなかったIII型蛋白質輸送に関わる複合体装置の細胞質側の立体構造が詳細に見え、両者の共通性と違いが明らかになった。
また、大量発現系から精製したべん毛構成蛋白質のX線結晶解析により、べん毛蛋白質輸送に関わるFliH/I複合体とFliPのペリプラズムドメイン、そしてべん毛基部体ロッド蛋白質FlgGの結晶構造解析が完了した。

Current Status of Research Progress
Reason

25年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

25年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2013 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Na+ conductivity of Na+-driven flagellar motor complex composed of unplugged wild-type or mutant PomB with PomA.2013

    • Author(s)
      Takekawa, N., et al
    • Journal Title

      J. Biochem.

      Volume: 153 Pages: 441-451

    • DOI

      doi: 10.1093/jb/mvt011.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression, purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of a core fragment of FlgG, a bacterial flagellar rod protein.2013

    • Author(s)
      Saijo-Hamano, Y., et al
    • Journal Title

      Acta Cryst.

      Volume: F69 Pages: 547-550

    • DOI

      doi:10.1107/S1744309113007392

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effects of Chain Length of an Amphipathic Polypeptide Carrying the Repeated Amino Acid Sequence (LETLAKA)(n) on α-Helix and Fibrous Assembly Formation.2013

    • Author(s)
      Takei T., et al
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 52 Pages: 2810-2820

    • DOI

      doi: 10.1021/bi400001c

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Conservation of two distinct types of 100S ribosome in bacteria.2013

    • Author(s)
      Ueta, M., et al
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 18 Pages: 554-574

    • DOI

      doi: 10.1111/gtc.12057. Epub

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Common evolutionary origin for the rotor domain of rotary ATPases and Flagellar protein export apparatus.2013

    • Author(s)
      Kishikawa, J., et al
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 8 Pages: e64695

    • DOI

      doi:10.1371/journal.pone.0064695

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Role of the Dc domain of the bacterial hook protein FlgE in hook assembly and function.2013

    • Author(s)
      Moriya, N., et al
    • Journal Title

      BIOPHYSICS

      Volume: 9 Pages: 63-72

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structures and functions of macromolecular assemblies by electron cryomicroscopy -the potential for biological sciences-

    • Author(s)
      Namba, K.
    • Organizer
      Medicine & Life Science seminar, Kumamoto University
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県)
    • Invited
  • [Book] 生体超分子ナノマシンとしての細菌べん毛モーター2013

    • Author(s)
      加藤貴之, et al
    • Total Pages
      Vol66-5
    • Publisher
      化学と工業
  • [Remarks] 大阪大学大学院生命機能研究kプロトニックナノマシン研究室研究成果

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/jpn/general/lab/02/result/

URL: 

Published: 2015-05-28  

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