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2011 Fiscal Year Annual Research Report

単一バイオ分子解析に向けたナノチャネル構造体の創成

Research Project

Project/Area Number 21241032
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

川合 知二  大阪大学, 産業科学研究所, 特任成就(常勤) (20092546)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 谷口 正輝  大阪大学, 産業科学研究所, 教授 (40362628)
田中 裕行  大阪大学, 産業科学研究所, 助教 (20314429)
Keywords1分子科学 / 単一バイオ分子 / ナノチャネル構造
Research Abstract

プロセスインテグレーションで開発した人工認識サイトとナノ電極・ナノチャネル構造を融合したナノ構造体を形成し、そのナノ構造体を用いて、人工生体膜の電気化学計測による分子認識の実証、および認識サイトの電流-電圧特性変化による分子認識の実証を行い、モルグラフィーにおける単一分子認識機能の実現や、自己組織化ナノワイヤーとナノ電極・ナノチャネル構造を融合させた。このプロセスインテグレーションにより形成される分子認識機能ナノチャネル構造体を用いて、モルグラフィーを行った。単一生体分子の種類・形態から単一生体分子の認識、DNAの種類・形態・電子状態に基づくシーケンシング、原子間力顕微鏡を組み合わせた分子認識力のフォース測定を行った。上記の計測から得られる情報と、電気伝導シュミレーション・電界シュミレーション・流体シュミレーションの結果を比較・検討し、得られる電流値の起源と物性量を明らかにし、モルグラフィーの学理・技術を確立した。密度汎関数法に基づく一般化密度勾配近似にファン・デル・ワールス(vdW)相互作用補正を加えた第一原理電子状態計算によって特徴的な電子状態を、特にそのエネルギーレベルの精度を良く再現することに成功したが、さらに、それで得られた最適化構造から、vdw相互作用補正なしに、再度、最適化を行い、結果を比較解析することに成功した。DNA塩基分子のうち、プリン塩基(6員環と5員環をからなる)のアデニンとグアニンでは、vdw相互作用補正のあるなしに限らず、平面的な吸着構造をもつ最適化構造が得られた。一方、ピリミジン塩基(6員環のみからなる)のチミンとシトシンでは、酸素原子の部分で基板にアンカーされるように、やや、斜めになった最適化構造が得られた。

  • Research Products

    (30 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (26 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Electrical Detection of Single Methylcytosines in a DNA Oligomer2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 133 Pages: 9124-9128

    • DOI

      10.1021/ja203839e

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Single-Molecule Sensing Electrode Embedded in-plane Nanopore2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 1 Pages: 1-6

    • DOI

      10.1038/srep00046

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spatial Nonuniformity in Resistive Switching Memory Effects of NiO2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society

      Volume: 133 Pages: 12482-12485

    • DOI

      10.1021/ja206063m

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ゲーティングナノポアによる1分子DNAシークエンシング2012

    • Author(s)
      川合知二
    • Organizer
      平成23年度中部地区ナノネット報告会
    • Place of Presentation
      自然科学研究機構・岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-31
  • [Presentation] Innovative Nano-Biodevices for DNA and related molecules : STM and Gating Nanopore2012

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      DNA Nanotechnology : From Structure to Function
    • Place of Presentation
      中国科学院上海応用物理研究所, Astor House Hotel(Shanghai・China)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-18
  • [Presentation] DNA sequencing by Nanopore devices and its application to Health Science2012

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      タイ・チェンマイ大学、the Health Science Seminar
    • Place of Presentation
      チェンマイ大学(Chiang Mai・Thailand)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-02-27
  • [Presentation] Gating-Nanopores for Single Molecule DNA Sequencing2012

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      Nanopores Conference 2012-Zing conferences
    • Place of Presentation
      Hesperia Lanzarote (Lanzarote・Spain)(招待講演)(Plenary speakers)
    • Year and Date
      2012-02-08
  • [Presentation] Research on the Detection of DNA single molecule using Nano Pore2012

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      Seminar on Hoseo University BK21
    • Place of Presentation
      Hoseo University (Chungcheongnam-do・Korea)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-01-17
  • [Presentation] 単一分子DNAのナノポアシークエンシング2012

    • Author(s)
      田中裕行
    • Organizer
      JSTさきがけ「界面の構造と制御」研究領域公開シンポジウム界面科学のフロンティア~計測・デバイス・生体界面の分野横断と新展開~
    • Place of Presentation
      東北大学片平キャンパス(宮城県・仙台市)
    • Year and Date
      2012-01-05
  • [Presentation] Molecular Rotation in Self-Assembled Multidecker Porphyrin Complexes2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Tanaka
    • Organizer
      19th International Colloquium on Scanning Probe Microscopy
    • Place of Presentation
      北海道洞爺湖万世閣(北海道・虻田郡)
    • Year and Date
      2011-12-19
  • [Presentation] Fabrication Method of Plastic Micropores for Artificial Lipid Bilayer Formation2011

    • Author(s)
      田中裕行
    • Organizer
      19th International Colloquinum on Scanning Probe Microscopy (ICSPM19)(第25回特別研究会「走査型プローブ顕微鏡」)
    • Place of Presentation
      北海道洞爺湖万世閣(北海道・虻田郡)
    • Year and Date
      2011-12-19
  • [Presentation] Innovative Nano-Biodevices for DNA and related molecules : STM and Gating Nanopore2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      北海道大学電子科学研究所国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      Chateraise Gateaux Kingdom Sapporo(北海道・札幌市)(招待講演)(Keynote Lecture)
    • Year and Date
      2011-11-22
  • [Presentation] Nanotechnology for Single Molecular DNA Sequencing-STM and Gating Nanopore-2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      33rd International Symposium on Dry Process (DPS2011)
    • Place of Presentation
      ホテル京都ガーデンパレス(京都府・京都市)(招待講演)(Plenary Speaker)
    • Year and Date
      2011-11-11
  • [Presentation] Nanotechnology for Single Molecular DNA Sequencing-STM and Gating Nanopore-2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      7th Handai Nanoscience and Nanotechnology International Symposium-Nanoscience and Nanotechnology in the Next Ten Years-
    • Place of Presentation
      大阪大学銀杏会館(大阪府・吹田市)(招待講演)(Plenary Lecture)
    • Year and Date
      2011-11-11
  • [Presentation] 核酸塩基分子の単分子識別-3世代DNAシーケンサーに向けて-2011

    • Author(s)
      Masateru Taniguchi
    • Organizer
      SCE2011第31回キャピラリー電気泳動シンポジウムin TSURUOKA
    • Place of Presentation
      鶴岡メタボロームキャンパス(山形県・鶴岡市)
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] Innovative Nano-Biodevices for DNA and related molecules : STM and Gating Nanopore2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      ASIASENSE 2011 (The 5th International Conference on sensors)
    • Place of Presentation
      The Shilla (Jeju・Korea)(招待講演)(Keynote Speakers)
    • Year and Date
      2011-10-26
  • [Presentation] Scanning Probe Microscope for DNA Sequencing and Cell Surgery2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      2011〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓(2011年秋季物理学会会議学術論文発表会及び臨時総会)The Korean Physical Society Autumn Meeting 2011
    • Place of Presentation
      BEXCO (Busan・Korea)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-20
  • [Presentation] Gating Nanopores for Single-Molecule DNA Electrical Sequencing2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      IEEE Nanotechnology Materials and Devices Conference 2011 (IEEE NMDC 2011)
    • Place of Presentation
      The Shila (Jeju・Korea)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-19
  • [Presentation] Mechanical Controlled Break Junction to Gating Nanopore for Single Biomolecule Electrical Sequencing2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      11th International Conference on Atomically Controlled Surfaces, Interfaces and Nanostructures (ACSIN 2011)
    • Place of Presentation
      Sokos Hotel Olympia Garden (St.Petersburg・Russia)
    • Year and Date
      2011-10-04
  • [Presentation] Development of Gating Nanopores for Next-Next DNA Sequencing using Mechanically Controllable Break-Junctions2011

    • Author(s)
      Masateru Taniguchi
    • Organizer
      ASME-JSME-KSME Jpint Fluids Engineering Conference 2011
    • Place of Presentation
      ACTY CITY Congress Center(静岡県・浜松市)(招待講演)(Keynote Lecture)
    • Year and Date
      2011-07-26
  • [Presentation] 次々々世代シークエンサー開発の最先端:ナノポアデバイス開発2011

    • Author(s)
      川合知二
    • Organizer
      ゲノムコンファレンス
    • Place of Presentation
      大阪大学テクノアライアンス棟(大阪府・吹田市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-20
  • [Presentation] Gating Nanopores for Single-Molecule DNA Electrical Sequencing2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      GeneExpression Systems & Appasani Research Conferences (AECEI.ORG) Jointly Presents, Fourth International Epigenomics, Sequencing & SNiPs-2011
    • Place of Presentation
      The Joseph B.Martin Conference Center at Harvard Medical School (Boston・USA)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-07-12
  • [Presentation] 次々世代シークエンサー開発の最前線:ナノポアデバイス開発2011

    • Author(s)
      川合知二
    • Organizer
      ゲノムコンファレンス次n世代シークエンス技術がもたらす新潮流
    • Place of Presentation
      東京ガーデンパレス(東京都・文京区)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-30
  • [Presentation] 最新のナノフィジックス2011

    • Author(s)
      川合知二
    • Organizer
      JEMIMA関西支部第32回平成23年第二回戦略的基盤技術検討委員会
    • Place of Presentation
      新コスモス電機(株)(大阪府・大阪市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-23
  • [Presentation] Partial Sequencing of a Single DNA Molecule with a Scanning Tunnelling Microscope2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Tanaka
    • Organizer
      Osaka University-RUG symposium entitled "Bio-inspired Materials and Functionalities"
    • Place of Presentation
      Hampshire Hotel Plaza (Groningen・Netherlands)
    • Year and Date
      2011-06-21
  • [Presentation] Gating Nanopores for Single-Molecule DNA Electrical Sequencing2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      ISMM 2011 in Conjunction with the KBCS Spring Meeting
    • Place of Presentation
      GaYaGeum Hall in the Hotel Seoul Kyoyuk Munhwa Hoekwan (Seoul・Korea)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-03
  • [Presentation] 1分子計測技術でDNAを観る2011

    • Author(s)
      川合知二
    • Organizer
      日本学術会議・科学技術振興機構公開シンポジウム観る、測る、そして知る-最先端計測・分析技術が拓く世界-
    • Place of Presentation
      日本学術会議講堂(東京都・港区)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-05-20
  • [Presentation] Gating Nanopores for Single-Molecule DNA Electrical Sequencing2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      〓〓〓〓〓〓〓2011〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓〓(2011年韓国陶磁器学会)
    • Place of Presentation
      〓〓〓〓〓京畿大学校(韓国・水原市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-04-21
  • [Presentation] Development of Gating Nanopores for Single-Molecule DNA Electrical Sequencing2011

    • Author(s)
      Tomoji Kawai
    • Organizer
      NHGRI Advanced Sequencing Technology Development Meeting
    • Place of Presentation
      Catamaran Eesort/Hotel (San Diego・USA)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-04-07
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.sanken.osaka-u.ac.jp/jp/organization/da/da_02.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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