2010 Fiscal Year Annual Research Report
長鎖非翻訳RNAを介したクロマチン/染色体機能の制御
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21241046
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
太田 邦史 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 教授 (90211789)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
山田 貴富 東京大学, 大学院・総合文化研究科, 助教 (30451850)
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| Keywords | クロマチン / エビゲノム / ノンコーディングRNA / ヒストン修飾 / 転写 / ストレス応答 / グルコース代謝 |
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| Research Abstract |
分裂酵母のストレス応答遺伝子上流の遺伝子間領域や、減数分裂期組換えホットスポットに見出されるM26/CRE配列周辺から、mRNA型のタンパク質に翻訳されない長鎖RNA(mlonRNA)が合成されている。たとえば、この配列を有するfbpl^+遺伝子上流の遺伝子間領域では、グルコース飢餓時にmlonRNAの転写が生じるとともに、多段階のクロマチン再編成が誘発され、fbpl^+遺伝子の大規模な活性化に至る。これは、mlonRNAのカスケード転写とそれによってもたらされるクロマチン再編成により、fbpl^+遺伝子プロモーター周辺への転写活性化因子が促進されるからであると考えられている(廣田ら、Nature,2008)。
本研究ではmlonRNAの普遍性を網羅的転写物解析により検証するほか、クロマチン構造・エピゲノム修飾などとの関係、RNAとしての安定性の制御機構を解析する。本年度は、昨年度に見出したfbpl^+遺伝子上流領域のピストン修飾(ピストンH3K9のアセチル化)について、mlonRNA転写による制御を解析した。転写集結配列を挿入することでmlonRNA転写を中断した場合、その下流でピストンH3K9のアセチル化やピストン脱離が著しく阻害されることを見出した。また、次世代シーケンサーを用いて、野生型およびM26/CRE配列結合因子Atf1の欠損株で、全ゲノムレベルのストランド特異的RNA解析を実施し、ストレス遺伝子などで類似のRNAの合成を確認したほか、グルコース存在時にfbpl^+遺伝子上流域でアンチセンスRNAの顕著な合成を始めて検出した。さらにmlonRNAがエクソソーム構成因子Rrp6の分解制御を部分的に受けることを明らかにした。
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Research Products
(28 results)
