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2010 Fiscal Year Annual Research Report

新時代の要求に対応できる革新的RNA合成法の開拓

Research Project

Project/Area Number 21241053
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

関根 光雄  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (40111679)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 大窪 章寛  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教 (60376960)
KeywordsRNA合成 / 固相合成法 / 2'水酸某の保護基 / RNA医薬 / Michael反応 / シアノエチル基 / アミダイトユニット / 塩基部無保護
Research Abstract

本研究では、高効率合成を可能とする世界最小の2'水酸基の保護基を用いるRNAの新規化学合成法の開発を行う。この際、RNAを医薬品あるいは遺伝子診断ツールとして活用する際の最大の問題点である酵素学的不安定性を克服した新規RNA誘導体も同じRNA合成モノマーユニットから創出できる画期的な新規RNA合成法の開発を行うものである。本年度では、シアノエチル基を2'-水酸基の保護基として用いるRNA合成法の確立のため、GとAの合成ユニットについて詳細に検討した。その結果、両者のモノマーユニットであるアミダイト誘導体の短工程合成法に成功した。Gのユニットは、塩基部位を2-アミノアデニンに置き換えることによって、塩基部位が無保護でも2'水酸基に高収率で導入することができた。塩基部上の6アミノ基はデアミナーゼによってG塩基に簡単に変換することができることがわかった。Aに関しても、塩基部無保護で直接2'水酸基にMichael反応によって高収率で導入が可能であることも明らかにした。このモノマーから固相合成法によって、2'水酸基がシアノエチル化されたオリゴヌクレオチドを収率よく合成することができた。このシアノエチル基はBu_4NFで簡単に除去することができるため、実質上は新しいRNAの合成法を確立することができた。つぎに、2'水酸基に2-(N-メチルカルバモイル)エチル(MCE)基を導入した酵素耐性能をもつ新規RNAの合成法を検討した。その結果、塩基部位を無保護で、アデニンや2-アミノアデニンへのアクリル酸アルキルとメチルアミンを連続的に反応させることによって、2'水酸基にMCE基を高収率で導入することができた。この反応を用いて、4種類の合成モノマーユニットの合成法を確立し、さらに、このMCE基で修飾されたRNA誘導体を数多く合成することができた。

  • Research Products

    (12 results)

All 2011 2010

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (9 results)

  • [Journal Article] Synthesis and Hybridization Properties of 2'-0-Methylated Oligoribonucleotides Incorporating 2'-0-Naphthyluridines2011

    • Author(s)
      M.Sekine, et al.
    • Journal Title

      Org.Biomol.Chem.

      Volume: 76 Pages: 210-218

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of 2'-0-[2-(N-Methylcarbamoyl) ethyl] riboncleosides Using Oxa-Michael Reaction and Chemical and Biological Properties of Oligonucleotide Derivatives Incorporating These Modified Ribonucleosides2011

    • Author(s)
      T.Yamada, et al.
    • Journal Title

      J.Org.Chem.

      Volume: 9(in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of 6-N-(benzothiazol-2-yl) deoxyadenosine and its exciton-coupled circular dichroism2010

    • Author(s)
      Y.Masaki, et al.
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.(B)

      Volume: 114 Pages: 2517-2524

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Synthesis and Properties of Modified Oligonucleotides Capable Triplex Formation with DNA Duplexes under Neutral Conditions2010

    • Author(s)
      M. Sekine
    • Organizer
      2010環太平洋国際化学会議
    • Place of Presentation
      Hawaii, Convention Center, USA
    • Year and Date
      2010-12-15
  • [Presentation] 2'-0-MCEオリゴヌクレオチドの合成と性質2010

    • Author(s)
      山田剛史, et al.
    • Organizer
      第20回アンチセンスシンポジウム
    • Place of Presentation
      甲南大学ポートアイランドキャンパス
    • Year and Date
      2010-12-02
  • [Presentation] Synergetic effects of 2-thiolation and 5-propynylation of the uracil base on the stability of RNA duplexes2010

    • Author(s)
      R. Miyasaka, Y. Masaki, H. Tsunoda, A. Ohkubo, K. Seio, and M. Sekine
    • Organizer
      第37回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      よこはま・はまぎんホール
    • Year and Date
      2010-11-10
  • [Presentation] Synthesis and Properties of 2'-0-[2-(N-methyl) carbamoyl] ethyl-RNAs2010

    • Author(s)
      T.Yamada, et al.
    • Organizer
      第37回国際核酸化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      よこはま・はまぎんホール
    • Year and Date
      2010-11-10
  • [Presentation] 新規核酸医薬の創成を指向した合成研究2010

    • Author(s)
      関根光雄
    • Organizer
      第54回日本薬学会関東支部大会
    • Place of Presentation
      東京薬科大学
    • Year and Date
      2010-10-02
  • [Presentation] RELATIONSHIP BETWEEN THERMAL STABILITY AND DEFORMABILITY OF MODIFIED RNA2010

    • Author(s)
      正木慶昭, et al.
    • Organizer
      XIX International round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
    • Place of Presentation
      クロードベルナールリヨン第一大学
    • Year and Date
      2010-09-01
  • [Presentation] 2'水酸基修飾アンチセンスオリコヌクレオチトの合成と筋シストロフィーを対象としたエキソンスキッヒンク評価2010

    • Author(s)
      岡庭夏己, et al.
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      一橋記念講堂:学術総合センター
    • Year and Date
      2010-07-28
  • [Presentation] New Triplex Forming Oligonucleotides Capable of Binding to DNA Duplexes under Neutral Conditions2010

    • Author(s)
      M. Sekine
    • Organizer
      Heidelberg University-Tokyo Institute of Technology Joint Symposium on
    • Place of Presentation
      Wroclaw University, Poland
    • Year and Date
      2010-07-16
  • [Presentation] Triplex Forming Oligonucleotides Containing Thiolated Nucleobases2010

    • Author(s)
      M.Sekine
    • Organizer
      ICPC2010-Symposium on Biophosphates
    • Place of Presentation
      Wroclaw University, Poland
    • Year and Date
      2010-07-13

URL: 

Published: 2012-07-19  

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