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2011 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌における小分子RNAの作動原理の解明

Research Project

Project/Area Number 21247025
Research InstitutionSuzuka University of Medical Science

Principal Investigator

饗場 弘二  鈴鹿医療科学大学, 薬学部, 教授 (20025662)

Keywords小分子RNA / Hfq / 翻訳抑制 / 塩基対形成 / mRNA分解 / RNaseE / 転写終結シグナル / polyU tail
Research Abstract

解糖系の阻害が大腸菌グルコーストランスポーター遺伝子(ptsG)のの発現を転写後段階で抑制することの発見を契機とした一連の研究により、この制御にRNA結合タンパク質HfqとsRNAの1つSgrSが関与していること、SgrSはHfqを介してRNase Eと複合体を形成しptsG mRNAとの塩基対形成により翻訳の抑制とRNase Eに依存したmRNA分解を引き起こすことなどを明らかにし、原核生物におけるsRNAによる遺伝子発現制御の原理を理解するための研究を先導してきた。本研究の目的は、(1)SgrSが標的であるptsG mRNAを特異的に認識する機構、(2)Hfqが塩基対形成を促進する分子機構、(3)SgrS/Hfq/RNase E複合体によるptsG mRNA分解の分子機構と生理機能、(4)代謝ストレスがSgrSの転写を誘導する機構に焦点を当てsRNAの作動原理の解明を目指すことである。平成23年度は、主に目的(2)に沿った研究を行い、Hfq結合部位の解明を目指した。SgrSをモデルとして、一連の変異体解析からsRNAのHfq機能的結合に十分な最小領域の決定を行った。その結果、3'領域に存在するRho因子非依存性ターミネーター、及びU塩基に富む配列が直前に存在する内部ヘアピン構造を含む49塩基のRNAがHfqとの機能的な結合に必要であることを証明した。また、U塩基に富む配列がターミネーターヘアピンの直前にあれば、内部ヘアピン構造はHfqとの機能的な結合に不用であることも示し、H鉤結合モジュールには2つのタイプがあることを明らかにした。既存のsRNAは2つのタイプのいずれかのHfq結合モジュールをもつことから、本研究の意義は、Hfq結合モジュールの実体を初めて解明したことにある。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

(1)SgrSが標的であるptsG mRNAを特異的に認識する機構については、塩基対形成に必要な最小の領域の決定に成功した。(2)Hfqが塩基対形成を促進する分子機構については、Hfq結合モジュールの実体を解明した。(3)SgrS/Hfq/Rnase E複合体によるptsG mRNA分解の分子機構と生理機能については、Rnase E上のHfq結合部位の同定に成功した。

Strategy for Future Research Activity

今後の課題の1つはHfq結合モジュールの最適化をめざすことである。また、最適化したHfq結合モジュールの上流に種々のmRNAの翻訳開始領域に相補的な配列を持つ人工的sRNAの解析を通して大腸菌における任意の遺伝子ノックダウン系を確立したい。Hfq結合モジュールの実体を解明したことはHfqによる塩基対形成促進機構の理解への大きなステップとなったが、さらなる展開のために、構造生物学の専門家と共同してsRNA/Hfq複合体の構造解析を目指したい。予備実験から、hfq遺伝子を多コピー存在させても、合成されるHfqタンパク質量は一定に保たれることを見出している。すなわち、Hfqはタイトに自己制御されている。この自己制御のメカニズムとその生理的意義を明らかにすることは本研究課題の今後の推進にとっても重要である。したがって、当初の研究計画には記載していないが、Hfq遺伝子の自己制御機構とその生理的意義の理解する研究も展開したい。

  • Research Products

    (14 results)

All 2012 2011

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (12 results)

  • [Journal Article] 原核生物の制御RNA2011

    • Author(s)
      森田鉄兵、饗場弘二
    • Journal Title

      医学のあゆみ

      Volume: 238(5) Pages: 394-399

  • [Journal Article] PolyU tail of rho-independent terminator of bacterial small RNAs is essential for Hfq action2011

    • Author(s)
      Hironori Otaka, Hirokazu Ishikawa, Teppei Morita, Hiroji Aiba
    • Journal Title

      Proc.Natl.Acad.Sci.USA

      Volume: 108(32) Pages: 13059-13064

    • DOI

      10.1073/pnas.1107050108

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Functional organization of bacterial Hfq-biading small RNA2012

    • Author(s)
      饗場弘二
    • Organizer
      Furano Conference on "Advanced Bioregulation and RNA"
    • Place of Presentation
      ニュー富良野ホテル(北海道)
    • Year and Date
      20120304-20120308
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAの3'末端の役割2011

    • Author(s)
      森田鉄兵、大鷹弘紀、石川博一、饗場弘二
    • Organizer
      第5回日本ゲノム微生物学会若手の会
    • Place of Presentation
      ろうきん研修所富士センター(静岡)
    • Year and Date
      20110929-20110930
  • [Presentation] Functional organization of Hfq-binding regulatory RNA2011

    • Author(s)
      饗場弘二
    • Organizer
      IUMS2011 The Unlimited world Microbes-国際微生物学連合2011-
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      20110906-20110910
  • [Presentation] 遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割2011

    • Author(s)
      大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2011
    • Place of Presentation
      あいち健康プラザ(愛知)
    • Year and Date
      20110830-20110901
  • [Presentation] 遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割2011

    • Author(s)
      大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第5回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      桂浜荘(高知)
    • Year and Date
      20110808-20110810
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAのHfq作用領域の解析:塩基対形成領域と転写終結領域間の役割2011

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第5回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      桂浜荘(高知)
    • Year and Date
      20110808-20110810
  • [Presentation] Poly tail of rho-independent terminator of bacterial small RNA acts an essential Hfq-binding site for riboregulation2011

    • Author(s)
      大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      20110614-20110618
  • [Presentation] Identification of Hfq binding sites on RNase E in E. coli2011

    • Author(s)
      池田幸樹、八木美江子、森田鉄兵、金井昭夫、饗場弘二
    • Organizer
      The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      20110614-20110618
  • [Presentation] Both polyU tail and the upstream region of rho-independent terminator are required for the functional interaction of SgrS with Hfq2011

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      20110614-20110618
  • [Presentation] Generation of functional E. coli DicF small RNA and the role of the 3'polyU stretch in Hfq binding2011

    • Author(s)
      森田鉄兵、飯田芳文、饗場弘二
    • Organizer
      The 16^<th> Annual meeting of the RNA society,第13回日本RNA学会総会合同会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場(京都)
    • Year and Date
      20110614-20110618
  • [Presentation] 遺伝子発現制御機構における大腸菌低分子RNA3'末端ポリU配列の役割2011

    • Author(s)
      大鷹弘紀、石川博一、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第8回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      ホテル木曽路(長野)
    • Year and Date
      20110518-20110519
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAのHfq作用領域の解析:塩基対形成領域と転写終結領域間の役割2011

    • Author(s)
      石川博一、大鷹弘紀、森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      第8回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      ホテル木曽路(長野)
    • Year and Date
      20110518-20110519

URL: 

Published: 2013-06-26  

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