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2012 Fiscal Year Annual Research Report

大腸菌における小分子RNAの作動原理の解明

Research Project

Project/Area Number 21247025
Research InstitutionSuzuka University of Medical Science

Principal Investigator

饗場 弘二  鈴鹿医療科学大学, 薬学部, 教授 (20025662)

Project Period (FY) 2009-05-11 – 2013-03-31
Keywords小分子RNA / Hfq / サイレンシング / 転写後制御 / 大腸菌
Research Abstract

解糖系の阻害が大腸菌グルコーストランスポーター遺伝子(ptsG)の発現を転写後段階で抑制することの発見を契機とした一連の研究により、この制御にRNA結合タンパク質HfqとsRNAの1つSgrSが関与していること、SgrSはHfqを介してRNase E と複合体を形成しptsG mRNAとの塩基対形成により翻訳の抑制とRNase Eに依存したmRNA分解を引き起こすことなどを明らかにしてきた。本研究の目的は、①SgrSが標的であるptsG mRNAを特異的に認識する機構、②Hfqが塩基対形成を促進する分子機構、③SgrS/Hfq/RNase E複合体によるptsG mRNA分解の分子機構と生理機能、④代謝ストレスがSgrS の転写を誘導する機構に焦点を当て原核生物におけるsRNAによる遺伝子発現制御の原理を解明することである。昨年度までの研究から、sRNAのHfq結合モジュールの実体を解明した。すなわち、典型的なHfq結合モジュールは長いpolyU配列を持つターミネーターヘアピン とU-rich配列に先導された内部ヘアピン構造からなる。また、U-rich配列がターミネーターヘアピンの直前にある場合にはターミネーターヘアピンのみでHfq結合モジュールとして機能できる。平成24年度は、以下の点を明らかにした。1)Hfq結合モジュールとして効果的なpolyU配列の長さは8以上が必要である。2)polyU配列の一部の他のヌクレオチドへの置換してもHfq結合モジュールとしての活性は保持される。3)Hfq結合モジュールの上流に種々のmRNAの翻訳開始領域に相補的な配列を持つ人工的sRNAを利用した大腸菌における任意の遺伝子ノックダウン系の構築に成功した。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (5 results)

All 2013 2012

All Journal Article (1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] The functional Hfq-binding module of bacterial sRNAs consists of a double or single hairpin preceded by a U-rich sequence and followed by a 3’ polyU tail.2012

    • Author(s)
      Ishikawa, H., Otaka, H., Maki, K., Morita, T., and Aiba, H.
    • Journal Title

      RNA

      Volume: 18 Pages: 1062-1074

  • [Presentation] Functional organization of Hfq-binding small RNAs2013

    • Author(s)
      饗場弘二
    • Organizer
      第86回 日本細菌学会総会
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(東京)
    • Year and Date
      20130318-20130320
    • Invited
  • [Presentation] Structural entity of functional hfq-binding module of bacterial base-piaring small rnas2012

    • Author(s)
      森田鉄兵、饗場弘二
    • Organizer
      Cell Symposia Functional RNAs
    • Place of Presentation
      Hotel Melia Sitges (Spain)
    • Year and Date
      20121202-20121204
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAの機能的Hfq結合モジュールの決定2012

    • Author(s)
      森田鉄兵、石川博一、大鷹弘紀、牧貴美香、饗場弘二
    • Organizer
      第14回 日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学百周年記念会館(宮城)
    • Year and Date
      20120718-20120720
  • [Presentation] 大腸菌小分子RNAにおける機能的Hfq結合モジュールの決定2012

    • Author(s)
      森田鉄兵、石川博一、大鷹弘紀、牧貴美香、饗場弘二
    • Organizer
      第9回 21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      長浜ロイヤルホテル(滋賀)
    • Year and Date
      20120621-20120622

URL: 

Published: 2014-07-24  

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