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2011 Fiscal Year Annual Research Report

分裂酵母の遺伝的DNA再編成の分子メカニズムの解析

Research Project

Project/Area Number 21247027
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

岩崎 博史  東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (60232659)

Keywords相同組換え / DNA二重鎖切断 / DNA修復 / DNA鎖交換反応 / 分裂酵母
Research Abstract

相同組換えは、基本的に3つの反応過程(前・中・後期)に分かれる。本申請研究では、分裂酵母を実験モデル系として、申請代表者のグループによって独自に発見された因子(Nip1/Ctp1、Swi5-Sfr1複合体など)を中心に、それぞれの反応過程の詳細な分子機構の解明を目指した。特に、下記の3つのサブテーマについて解析し、当該年度は次の結果を得た。
1、初期過程の再構成系の構築と反応機構…解析(MRN-Nip1/Ctp1複合体の機能解析を中心に)
遺伝学的手法を用いて、Ctp1(別名Nip1、以下Ctp1として統一)がリン酸化されることがDNA修復における活性型であることを証明した。さらに、Ctp1のin vitroリン酸化反応系を確立した。これを用いて、Ctp1がリン酸化されるとNbs1と結合することを証明した。
2、初期-中期過程の再構成系を用いた反応機構解析(リコンビナーゼの反応機構を中心に)
Rad51やDmc1リコンビナーゼの活性化因子であるSwi5-Sfr1の構造解析を行い、N末を欠いたSfr1とSwi5とのタンパク質複合体のX線立体構造を高分解能で決定した。さらに、全体構造については、SAXSによって決定した。また、Swi5-sfr1複合体の構造機能相関について解析した。
3、中期-後期過程の再構成系の構築と反応機構解析(Fbh1ヘリケースの機能とその制御機構を中心に)Fbh1と機能的差異を解析する目的で、Rad54ヘリケースやRqh1ヘリケースの発現・精製系を構築した。
現在、これらのヘリケースとFbh1との生化学的特徴の差違について調べている。

  • Research Products

    (10 results)

All 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Mechanistic insights into the activation of Rad51-mediated strand exchange from the structure of a recombination activator, the Swi5-Sfr1 complex2012

    • Author(s)
      Kuwabara N, Murayama Y, Hashimoto H, Kokabu Y, Ikeguchi M, Sato M, Mayanagi K, Tsutsui Y, Iwasaki H, Shimizu T
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 20 Pages: 440-449

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The fission yeast Swi5-Sfr1 complex, an activator of Rad51 recombinase, forms an extremely elongated Dogleg-shaped structure2011

    • Author(s)
      Kokabu Y, Murayama Y, Kuwabara N, Oroguchi T, Hashimoto H, Tsutsui Y, Nozaki N, Akashi S, Unzai S, Shimizu T, Iwasaki H, Sato M, Ikeguchi M
    • Journal Title

      J Biol Chem.

      Volume: 286 Pages: 43569-76

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An in vitro assay for monitoring the formation and branch migration of Holliday junctions mediated by a eukaryotic recombinase2011

    • Author(s)
      Murayama Y, Iwasaki H
    • Journal Title

      Methods Mol.Biol.

      Volume: 745 Pages: 385-405

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Reconstitution of two DNA strand exchange reactions during homologous recombination2011

    • Author(s)
      岩崎博史
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(招待講演)
    • Year and Date
      20111213-20111216
  • [Presentation] 相同組換えにおけるDNA鎖交換反応の制御機構2011

    • Author(s)
      岩崎博史
    • Organizer
      日本遺伝学会第83回大会
    • Place of Presentation
      京都大学農学部・農学研究科(招待講演)
    • Year and Date
      20110920-20110923
  • [Presentation] 組換え修復の分子機構2011

    • Author(s)
      岩崎博史
    • Organizer
      生化学若い研究者の会
    • Place of Presentation
      八王子セミナーハウス(招待講演)
    • Year and Date
      20110902-20110904
  • [Presentation] Differential effects of Rad22 on the Rad51- and Dmc1-mediated DNA strand exchange reactions2011

    • Author(s)
      Iwasaki, H
    • Organizer
      6^<th> international fission yeast meeting
    • Place of Presentation
      Harvard Medical School, Boston, USA(招待講演)
    • Year and Date
      20110625-20110630
  • [Presentation] Molecular mechanism of DNA strand exchange reaction, a central reaction of homologous recombination mediated by recombinases2011

    • Author(s)
      Iwassaki, H
    • Organizer
      China-Japan Symposium on Cancer Research
    • Place of Presentation
      Shinzhen, China(招待講演)
    • Year and Date
      20110519-20110520
  • [Presentation] Regulation of Rad51 and Dmc1 recombinases in fission yeast2011

    • Author(s)
      Iwasaki, H
    • Organizer
      New frontier of the research in Rad51 recombinase and its accessory proteins
    • Place of Presentation
      Institut de Biologie Physico Chimique, Paris(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-28
  • [Book] Human CtIP and its homologs : Team players in DSB resection games. in DNA Repair-On the pathways to Fixing DNA Damage and Errors(Ed Storici)2011

    • Author(s)
      Tsutsui Y, Kawasaki A, Iwasaki, H
    • Total Pages
      169-184
    • Publisher
      InTech

URL: 

Published: 2013-06-26  

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