2010 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
21249013
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
萩原 正敏 京都大学, 医学研究科, 教授 (10208423)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大野 欽次 名古屋大学, 医学系研究科, 教授 (80397455)
武内 章英 京都大学, 医学研究科, 助教 (90436618)
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Keywords | スプライシング / 神経発生 / mRNA / 大脳皮質 / 発現パターン |
Research Abstract |
大脳皮質形成過程を規定するスプライシング暗号の全容解明と神経発生・大脳形成メカニズムの解明を目指して以下の研究を実施した。1)in vivoで選択的スプライシングを可視化できるトランスジェニックマウスを樹立した。また培養細胞にレポーター遺伝子ベクターを導入して分化を促すことにより、分化や外部の刺激によるスプライシング制御の変化を観察した。2)エクソンアレーにより、スプライシング制御をうけてアイソフォームの変化する遺伝子を同定した。また神経分化過程で発現の変化するRNA結合タンパク(スプライシング制御因子)のデータを取得し、スプライシング・パターンの変化する遺伝子とRNA結合タンパクの発現パターンを比較することにより、スプライシング制御候補因子を同定した。3)CLIP法によってスプライシング制御を受ける遺伝子を同定し、その特定のアイソフォームごとのRNAi発現ベクターおよびcDNAの発現ベクターを作成して、loss of function study(RNAi技術による機能欠失)およびgain of function study(強制発現による機能増強解析)を行った。4)本研究の途上で、脳内に発現する遺伝子のmRNA解析中に、スプライシングが途中までで留まっている遺伝子を発見した。しかも温度など条件を変えることにより遺伝子のスプライシングが途中から再開するが判明した。ストレス条件からの回復に重要な働きをすることから、この新しい細胞内メカニズムをReSCUEと名付けた。
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Research Products
(22 results)
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[Journal Article] WT1 mutants reveal SRPK1 to be a downstream angiogenesis target by altering VEGF splicing2011
Author(s)
Amin EM, Hua J, Cheung MK, Ni L, Kase S, Ren-nel ES, Gammons M, Nowak DG, Saleem MA, Hagiwara M, Schumacher VA, Harper SJ, Hinton D, Bates DO, Ladomery MR
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Journal Title
Cancer Cell
Volume: 20
Pages: 768-780
Peer Reviewed
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[Journal Article] Leucettines, a class of potent inhibitors of cdc2-like kinases and dual specificity, tyrosine phosphorylation regulated kinases derived from the marine sponge leucettamine B : modulation of alternative pre-RNA splicing2011
Author(s)
Debdab M, Carreaux F, Renault S, Soundararajan M, Fedorov O, Filippakopoulos P, Lozach O, Babault L, Tahtouh T, Baratte B, Ogawa Y, Hagiwara M, Eisenreich A, Rauch U, Knapp S, Meijer L, Bazureau JP
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Journal Title
J Med Chem
Volume: 54(12)
Pages: 4172-4186
Peer Reviewed
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[Journal Article] Chemical treatment enhances skipping of a mutated exon in the dystrophin gene2011
Author(s)
Nishida A, Kataoka N, Takeshima Y, Yagi M, Awano, H, Ota, M, Itoh K, Hagiwara M, Matsuo M
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Journal Title
Nature communications
Volume: 2:308
Peer Reviewed
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