2010 Fiscal Year Annual Research Report
集団特異的形態形成に関与する遺伝子群の多型検索および機能解析
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21249046
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| Research Institution | Kurume University |
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Principal Investigator |
神田 芳郎 久留米大学, 医学部, 教授 (90231307)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
副島 美貴子 久留米大学, 医学部, 助教 (80279140)
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| Keywords | 多因子遺伝形質 / 隆線数 / ゲノムワイド多型解析 / 関連解析 |
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| Research Abstract |
当該研究計画では、総隆線数の決定に関与する遺伝子多型を同定し、その機能差を明らかにすることを最終的な目標としており、当該年度では前年度に実施した日本人集団(男性)約600サンプルの中で隆線数が多い群と少ない群それぞれ24サンプルのゲノムワイドな-遺伝子多型(SNPs)解析(GWAS解析)データについて統計解析処理をおこない、両グループ間の比較から総隆線数の決定に関与する候補遺伝子多型の絞込みをおこなった。さらに、当該年度では、女性ボランティアについても指紋ならびにDNAソースとしての唾液、血液の採取を実施した。(なお、総隆線数には性差が認められている。)また、並行して男性検体についても収集を継続しておこなった。
しかしながら、統計解析の結果、グループ間で分布が異なる上位の遺伝子多型でも統計的に有意な差異を認めなかったこと、多検体(GWAS解析をおこなっていない他のサンプル)について実施した隆線数とこれら上位多型との関連解析のデータからも総隆線数と強い関係を示す遺伝子座は同定できなかった。この理由として多因子遺伝による量的形質においては、関与する遺伝子数が多く各遺伝子多型の影響が小さいことに起因するものと考えられ、解決法として網羅的多型解析サンプルの更なる追加が有効である。したがって収集サンプルから対象検体をピックアップし(27サンプル)GWAS解析を実施した。最終年度となる次年度では、本データの統計解析の実施、さらに、独立した集団(女性群)での解析を進め、総隆線数の決定に関与する遺伝子多型を同定し、その機能差を明らかにする予定である。
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[Journal Article] Functional and genetic survey of all known single-nucleotide polymorphisms within the human deoxyribonuclease I gene in wide-ranging ethnic groups.2011
Author(s)
Fujihara J, Ueki M, Yasuda T, Iida R, Soejima M, Koda Y, Kimura-Kataoka K, Kato H, Panduro A, Tongu M, Takeshita H.
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Journal Title
DNA Cell Biol.
Volume: 30(in press)
Peer Reviewed
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[Journal Article] A biochemical and genetic study on all non-synomntous single nucleotide polymorphisms of the gene encoding human dcoxyribonuclease I potentially relevant to autoimmunity.2010
Author(s)
Yasuda T, Ueki M, Takeshita H, Fujihara J, Kimura-Kataoka K, Iida R, Tsubota E, Soejima M, Koda Y, Kato H, Panduro A.
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Journal Title
Int J Biochem CellBiol.
Volume: 42
Pages: 1216-1225
Peer Reviewed
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[Presentation] Y染色体のハプログループを利用した民族推定法の開発2010
Author(s)
室友紀, 今村真二, 渡部有希菜, 中村博明, 藤原純子, 飯田礼子, 安田年博, 木村かおり, 湯浅勲, 副島美貴子, 神田芳郎, 竹下治男
Organizer
日本DNA多型学会第19回学術集会
Place of Presentation
三島市(静岡県)
Year and Date
2010-11-18
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