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2009 Fiscal Year Annual Research Report

ニューロン活動依存的転写応答の差異に関与するクロマチンダイナミクス変動解析

Research Project

Project/Area Number 21300123
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

中島 欽一  Nara Institute of Science and Technology, バイオサイエンス研究科, 教授 (80302892)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 滝沢 琢己  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教 (30531115)
Keywordsクロマチンダイナミクス / エピジェネティクス / ニューロン / 転写応答 / Bdnf
Research Abstract

マウス海馬ニューロンの培養系を用いて、グルタミン酸受容体刺激後発現誘導される遺伝子をマイクロアレイにて網羅的に解析したところ、刺激後速やかに転写量が増加する早期転写型遺伝子群と刺激後緩やかに増加する遅延型遺伝子群に分類されることが分かった。それぞれの群のクロマチン修飾の差異をクロマチン免疫沈降法にて検討した結果、遅延型遺伝子群でピストンH3の9番目リジンのメチル化(H3K9me)が高かった。ヘテロクロマチンタンパク質HP1はH3K9meに結合しヘテロクロマチン形成に寄与しているが、細胞分裂期にH3の10番目セリンのリン酸化(H3S10p)に伴い解離することが知られている。HP1のクロマチンからの解離がニューロンでの転写制御にも関与している可能性が考えられた。遅延型遺伝子群ではグルタミン酸受容体刺激後にH3S10pが増加し、HP1βの結合が減少することが分かった。しかし、H3K9meの低い早期群でも刺激前にHP1β結合が認められたことから、H3K9me修飾とは独立した現象であることが示唆された。現在、HP1βの標的遺伝子に関し、ゲノムワイドな解析を計画している。さらに、別のクロマチン関連分子としてリシカーヒストシH1のダイオナミクスをFRAP法にて検討したとこち、H1は神経活動に依存してハイパーダイナミックな挙動を示すことが分かった。これに関与する機構としてH1のポリADPリボシル化を想定し、責任酵素であるPARPの阻害薬にて検討した結果、H1のハイパーダイナミックな挙動は抑制された。
これらの結果は、ニューロンの細胞核内では神経活動に依存してダイナミックなクロマチン制御が行われていることを示すものである。今後、どの遺伝子がこのダイナミックな制御下にあるか、ゲノムワイドな検討を予定している。

  • Research Products

    (40 results)

All 2010 2009

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (33 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] BMP-induced REST regulates the establishment and maintenance of2010

    • Author(s)
      Kohyama J, Sanosaka T, Tokunaga A, Takatsuka E, Tsujimura K, Okano H, Nakashima K
    • Journal Title

      Jouranl of Cell Biology (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Epigenetic regulation in neural stem cell differentiation2010

    • Author(s)
      Juliandi B, Abematsu M, Nakashima K
    • Journal Title

      Development, Growth & Differentiation 189(In press)

      Pages: 15A-17D

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Neuronal differentiation of neural precursor cells is promoted by the methyl-CpG-binding protein MeCP2.2009

    • Author(s)
      Tsujimura K, Abematsu M, Kohyama J, Namihira M, Nakashima K
    • Journal Title

      Experimental neurology 219

      Pages: 104-111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Astrocyte differectiation of neural precursor cells in enhanced by retinoic acid through a change in epigenetic modification.2009

    • Author(s)
      Asano H, Aonuma M, Sanosaka T, Kohyama J, Namihira M, Nakashima K
    • Journal Title

      Stem cells (Dayton, Ohio) 27

      Pages: 2744-2752

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Wnt-mediated activation of NeuroD1 and retro-elements during adult neurogenesis.2009

    • Author(s)
      Kuwabara T, Hsieh J, Muotri A, Yeo G, Warashina M, Lie DC, Moore L, Nakashima K, Asashima M, Gage FH
    • Journal Title

      Nature neuroscience 12

      Pages: 1097-1105

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Rett症候群原因遺伝子産物MeCP2の機能解析2010

    • Author(s)
      辻村啓太, 鈴木暁也, 中島欽一
    • Organizer
      第4回神経発生討論会
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      2010-03-19
  • [Presentation] ニューロン活動依存的に発現する遺伝子の核内空間配置解析2009

    • Author(s)
      高木美智, 滝沢琢己, 笹岡寛敏, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Analysis of chromatin modifications and trascriptional regulations of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2009

    • Author(s)
      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 木村宏, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] A source of astrocyte-inducing cytokines in the developing mouse brain2009

    • Author(s)
      佐野坂司, 犬伏浩規, 神山淳, 滝沢琢己, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Analysis of DNA methylation-independent regulatory mechanisms of astrocyte specific gene expression2009

    • Author(s)
      裏山悟司, 滝沢琢己, 堀由貴奈, 神山淳, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Astrocyte-specific genes are generally demethylated in neural precursor cells prior to astrocytic differentiation2009

    • Author(s)
      畑田出穂, 波平昌一, 森田純代, 堀居拓郎, 木村美香, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] レチノイン酸誘導製ヒストンアセチル化による神経幹細胞のアストロサイト分化促進機構2009

    • Author(s)
      浅野弘嗣, 青沼真, 佐野坂司, 神山淳, 波平昌一, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] The Role of Histone Acetylation on Cortical Development2009

    • Author(s)
      Berry J, Tsujimura K, Abematsu M, Kohyama J, Nakashima K
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] Mechanism in sequential differentiation of neural stem cells mediated by neuron-stem cell interaction2009

    • Author(s)
      Nakashima K
    • Organizer
      The 1st International Global COE Symposium
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2009-12-07
  • [Presentation] The spatio-temporal regulation of activity-dependent genes in post-mitotic neurons2009

    • Author(s)
      Takizawa T, Sasaoka H, Takagi M, Kimura H, Nakashima K.
    • Organizer
      The 4th International Workshop on Cell Regulations in Division and Arrest
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2009-11-29
  • [Presentation] ニューロンでの遺伝子発現におけるエピジェネティック修飾の解析2009

    • Author(s)
      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 木村宏, 中島欽一
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] ニューロン活動依存的に発現する遺伝子の核内空間配置解析2009

    • Author(s)
      高木美智, 笹岡寛敏, 滝沢琢己, 中島欽一
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2009-10-23
  • [Presentation] 神経幹細胞のアストロサイト分化能獲得を制御するエピジェネティクス機構2009

    • Author(s)
      Sanosaka T, Namihira M, Kohyama J, Semi K, Taga T, Nakashima K
    • Organizer
      第32回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] 移植神経幹細胞のエピジェネティック制御による損傷脊髄再生治療2009

    • Author(s)
      あべ松昌彦, 辻村啓太, 山野真利子, 斉藤美知子, 河野憲二, 神山淳, 波平昌一, 小宮節郎, 中島欽一
    • Organizer
      第32回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] 脊髄損傷に対するエピジェネティック治療2009

    • Author(s)
      Nakashima K
    • Organizer
      第32回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      名古屋市
    • Year and Date
      2009-09-16
  • [Presentation] 胎仔期HDAC阻害剤暴露によるマウス脳内環境変化で誘発される成体期行動以上と原因解明2009

    • Author(s)
      中島欽一
    • Organizer
      シンポジウム「脳を巡る環境-遺伝子相互作用の分子基盤」
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-08-29
  • [Presentation] Mechanism for sequential acquisition of differentiation potential of neural stem cells2009

    • Author(s)
      Nakashima K
    • Organizer
      The 22th Biennial Meeting of the ISN/APSN 2009
    • Place of Presentation
      Busan, Korea
    • Year and Date
      2009-08-23
  • [Presentation] Sequencial differentiation of neural stem cells into neuron first and then astrocyte2009

    • Author(s)
      蝉克憲, 波平昌一, 神山淳, 佐野坂司, 中島欽一
    • Organizer
      第4回Notchシグナル研究会
    • Place of Presentation
      三島市
    • Year and Date
      2009-07-30
  • [Presentation] Epigenetic Regulations for Neural Cell Differentiation and Plasticity2009

    • Author(s)
      Nakashima K
    • Organizer
      Lasker/IRRF Intiative for Innovation in Vision Research
    • Place of Presentation
      Woods Hole, USA
    • Year and Date
      2009-07-13
  • [Presentation] REGULATION OF NEURAL CELL DIFFERENTIATION PLASTICITY IN ADULT CENTRAL NERVOUS SYSTEM2009

    • Author(s)
      Kohyama J, Tsujimura K, Kirikae I, Abematsu M, Takebayashi H, Nakashima K
    • Organizer
      ISSCR 7th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2009-07-08
  • [Presentation] COMMITTED NEURONAL PRECURSORS CONFER ASTROCYTE-DIFFERENTIATION POTENTIAL ON NEURAL STEM CELLS THROUGH NOTCH SIGNAL MEDIATED DNA DEMETHYLATION DURING MOUSE BRAIN DEVELOMENT2009

    • Author(s)
      Sanosaka T, Namihira M, Kohyama J, Semi K, Benjamin D, Taga T, Nakashima K
    • Organizer
      ISSCR 7th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2009-07-08
  • [Presentation] RETINOIC ACID-INDUCED CHROMATIN REMODELING PROMOTES ASTROCYTE DIFFERENTIATION OF NEURAL STEM CELLS2009

    • Author(s)
      Asano H, Namihira M, Kohyama J, Aonuma M, Sanosaka T, Nakashima K
    • Organizer
      ISSCR 7th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2009-07-08
  • [Presentation] DYNAMIC CHANGES IN DNA METHYLATION AND SPATIAL POSITIONING OF AN ASTROCYTE SPECIFIC CENE, GFAP DURING ASTROCYTE DIFFERENTIATION2009

    • Author(s)
      Takizawa T, Taga T, Misteli T, Nakashima K
    • Organizer
      ISSCR 7th Annual Meeting
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2009-07-08
  • [Presentation] Allele-specific nuclear positioning of the monoallelically expressed astrocyte marker GFAP2009

    • Author(s)
      Takizawa T, Nakashima K, Gudla RP, Lockett S, Misteli T.
    • Organizer
      第24回内藤コンファレンス
    • Place of Presentation
      札幌市
    • Year and Date
      2009-06-23
  • [Presentation] Committed nueronal precursors confer astrocyte-differentiation potential on neural stem cells through Notch-signal mediated DNA demethylation during mouse brain development2009

    • Author(s)
      Semi K, Namihira M, Kohyama J, Sanosaka T, Nakashima K
    • Organizer
      第24回内藤コンファレンス
    • Place of Presentation
      札幌市
    • Year and Date
      2009-06-23
  • [Presentation] アストロサイト特異的遺伝子GFAP発現制御に関するDNAメチル化と遺伝子座核内配置2009

    • Author(s)
      滝沢琢己
    • Organizer
      第52回日本神経化学会大会
    • Place of Presentation
      渋川市
    • Year and Date
      2009-06-22
  • [Presentation] 神経幹細胞が生み出す細胞の順番付けの仕組み2009

    • Author(s)
      中島欽一
    • Organizer
      第52回日本神経化学会大会
    • Place of Presentation
      渋川市
    • Year and Date
      2009-06-22
  • [Presentation] メチル化DNA結合タンパク質による神経系細胞の分化・可塑性制御2009

    • Author(s)
      中島欽一
    • Organizer
      神経組織の成長・再生・移植研究会 (GRT) 第24回学術集会
    • Place of Presentation
      渋川市
    • Year and Date
      2009-06-21
  • [Presentation] Neuro-to-gliogenic switch triggered by Notch-induced demethylation in neural stem cells2009

    • Author(s)
      Nakashima K
    • Organizer
      CREST Neuroscience International Symposium
    • Place of Presentation
      淡路市
    • Year and Date
      2009-06-02
  • [Presentation] ニューロンでの遺伝子発現におけるエピジェネティック修飾の解析2009

    • Author(s)
      笹岡寛敏, 滝沢琢己, 中島欽一
    • Organizer
      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-05-22
  • [Presentation] アストロサイト特異的遺伝子GFAPの核内配置と転写活性2009

    • Author(s)
      滝沢琢己, Tom Misteli, 中島欽一
    • Organizer
      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-05-22
  • [Presentation] メチル化DNA結合タンパク質MeCP2によるニューロン分化誘導機構と中枢神経系2009

    • Author(s)
      辻村啓太, 松昌彦, 神山淳, 波平昌一, 中島欽一
    • Organizer
      第3回日本エピジェネティクス研究会年会
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-05-22
  • [Presentation] Committed nueronal precursors confer astrocyte-differentiation potential on neural stem cells through Notch-signal mediated DNA demethylation during mouse brain development2009

    • Author(s)
      Semi K, Namihira M, Kohyama J, Sanosaka T, Nakashima K
    • Organizer
      第7回幹細胞シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京都
    • Year and Date
      2009-05-15
  • [Book] The new molecular and medical genetics2010

    • Author(s)
      Juliandi B, Abematsu M, Nakashima K
    • Publisher
      Elsevier(In press)
  • [Book] Regulatory networks in stem cells2009

    • Author(s)
      Suzuki A, Raya A, Kawakami Y, Morita M, Matsui T, Nakashima K, Gage FH, Rodriguez-Esteban C, Izpisua Belmonte JC
    • Total Pages
      21
    • Publisher
      Humana Press(In press)

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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