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2009 Fiscal Year Annual Research Report

里湖湖岸域希少植物のユビキタスモニタリング/ジェノタイピングによる生物多様性評価

Research Project

Project/Area Number 21310152
Research InstitutionLake Biwa Environmental Research Institute

Principal Investigator

金子 有子  Lake Biwa Environmental Research Institute, 総合解析部門, 専門研究員 (90280817)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高田 壮則  北海道大学, 大学院・地球環境科学研究院, 教授 (80206755)
瀬戸口 浩彰  京都大学, 大学院・人間・環境学研究院, 准教授 (70206647)
練 春蘭  東京大学, アジア生物資源環境研究センター, 准教授 (40376695)
Keywords植物 / 遺伝構造 / レッドリスト / GIS / 生物多様性 / 絶滅確率
Research Abstract

本研究では、琵琶湖湖岸域に生息する絶滅危惧植物についで、1)全残存地域集団の遺伝構造または全残存個体の遺伝子型を明らかにすると共に、2)全残存個体・全株の位置情報をGISデータ化し、個体数または生息面積の増減をモニタリングすることによって、3)遺伝情報を加味した絶滅確率の推定や多様性の評価を行うことを目的としている。
平成21年度は、以下の研究を実施した。
1.遺伝解析
(1)ノウルシ、ハマエンドウ、ハマゴウ、オニナルコスゲ、タコノアシ、オオマルバノホロシの6種について、マイクロサテライトマーカーの開発を進め、それぞれ28座、20座、8座、10座、4座、19座の遺伝子座について、地域集団内における遺伝的変異の有無を検出中である。ノウルシ、ハマエンドウ、オニナルコスゲでは、それぞれ5座、3座、4座について、遺伝構造の解析に有効なプライマーが完成している。
(2)開発した遺伝マーカーを用いて集団遺伝構造を解明するため、ノウルシでは全生育パッチについて株サイズおよび位置情報の測定と遺伝試料の採取を行った。ハマエンドウでは全残存開花個体について個体サイズおよび位置情報の測定と遺伝試料採取を行うと共に、開花調査や種子採取を開始した。ハマゴウ、オニナルコスゲについても全残存地域集団からの遺伝試料採取を行った。
2.数理解析
(1)研究対象の多年生草本および低木種の約20種について、分布確認地点の位置情報および生息量を整理し、GISデータ化を完了した。また、集団動態推定に必要な不足情報とその調査方法等を明らかにするため、各植物種の生活史や繁殖生態に関する文献調査を行い、資料収集を行った。
(2)クローン植物における絶滅確率推定の準備として、遺伝的多様性と絶滅確率の関係において重要な病気の伝播モデルに関する基礎的研究を行った。

  • Research Products

    (13 results)

All 2010 2009

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Phylogeography of Japanese horse chestnut(Aesulus turbinata)in the Japanese archipelago based on chloroplast DNA haplotypes2010

    • Author(s)
      菅原可奈子、金子有子、瀬戸口浩彰
    • Journal Title

      Journal of Plant Research (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Derivation of a yearly transition probaility matrix for land-use dynamics and its applications2010

    • Author(s)
      高田壮則
    • Journal Title

      Landscape Ecology 25

      Pages: 561-572

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Geographical differentiation in leaf thickness in the coastal plant Calystegia soldanella(Convolvulaceae): a comparison between coastal and freshwater lakeshore populations2010

    • Author(s)
      瀬戸口浩彰
    • Journal Title

      Journal of Phytogeography and Taxonomy 57

      Pages: 89-93

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Leaf blade thickness differentiation between coastal and freshwater populations of the coastal plant Vitex rotundifolia(Verbenaceae).2010

    • Author(s)
      瀬戸口浩彰
    • Journal Title

      Bulletin of the National Science Museum of Nature and Science Series B 36

      Pages: 39-42

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 湖岸生態系の保全・修復および管理に関する研究2009

    • Author(s)
      金子有子
    • Journal Title

      滋賀県琵琶湖環境科学研究センター試験研究報告 第4号

      Pages: 55-85

  • [Journal Article] 琵琶湖西岸流域におけるタブノキ個体群の分布と保全2009

    • Author(s)
      前迫ゆり、金子有子
    • Journal Title

      大阪産業大学人間環境論集 8

      Pages: 39-55

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and characterisation of microsatellite loci in Calystegia soldanella(Convolvulaceae), an endangered coastal plant isolated in Lake Biwa, Japan2009

    • Author(s)
      Asuka Noda、瀬戸口浩彰
    • Journal Title

      Conservation Genetics 10

      Pages: 1077-1079

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      金子有子
    • Journal Title

      とりもどせ!琵琶湖淀川の原風景-琵琶湖・淀川の生物多様性保全に向けて-(サンライズ出版)

      Pages: 31-48

  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      金子有子
    • Journal Title

      日本樹木誌1巻(日本林業調査会)

      Pages: 353-386

  • [Presentation] 海岸と琵琶湖岸に生育するハマエンドウの分子系統地理2010

    • Author(s)
      瀬戸口浩彰、金子有子
    • Organizer
      日本植物分類学会第9回大会
    • Place of Presentation
      愛知教育大学(愛知県)
    • Year and Date
      2010-03-26
  • [Presentation] 近畿地方内陸部タブノキ林の保全生態学的研究:地理変異と繁殖特性2010

    • Author(s)
      金子有子
    • Organizer
      日本生態学会第57回大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-16
  • [Presentation] コンタクトプロセスを用いたクローナル植物における病原菌伝搬モデル2010

    • Author(s)
      高田壮則
    • Organizer
      日本生態学会第57回大会
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都)
    • Year and Date
      2010-03-16
  • [Book] 琵琶湖湖辺域の貴重植物と外来植物2010

    • Author(s)
      金子有子
    • Total Pages
      52
    • Publisher
      滋賀県琵琶湖環境科学研究センター

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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