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2010 Fiscal Year Annual Research Report

ニトリルヒドラターゼファミリー酵素の触媒中心形成と触媒機構の解明

Research Project

Project/Area Number 21350089
Research InstitutionTokyo University of Agriculture and Technology

Principal Investigator

尾高 雅文  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 准教授 (20224248)

Keywords酵素反応 / 構造生物学 / 中性子 / 生物・生体工学 / バイオリアクター / X線結晶構造解析 / 翻訳後修飾 / タンパク質成熟化
Research Abstract

ニトリルヒドラターゼ(NHase)はアクリルアミドの工業生産に利用される重要な酵素であるが、その触媒反応機構は未解明である。本研究では、NHaseと類縁酵素であるチオシアネート加水分解酵素(SCNase)を材料に、その触媒反応機構と翻訳後修飾を含む金属触媒中心形成機構を明らかにすることを研究目的とする。今年度は以下の3つの研究を行った。1.NHase活性を1/1000程度に低下させたβR56K変異体を用いて、基質であるtert-butylnitrile水和反応の時間分割構造解析を行った。その結果、反応開始後3時間の測定データにおいて、酵素基質複合体と思われる構造を得ることに成功した。2.SCNase基質ポケットに存在する2つのアルギニン残基βArg90,γArg136をNHaseにおいて相当するアミノ酸残基であるフェニルアラニンとトリプトファンに置換した変異体を作製し、それらの置換の影響を調べた。いずれの変異体もSCNase活性を消失し、NHase活性を示した。γR136W変異体の結晶構造を決定したところ、基質ポケット表面の正電荷が大きく減少し、基質ポケットの容積が増大していた。これらの結果より、NHaseとSCNaseの触媒機構は本質的に同じであり、基質ポケットの電荷とサイズが基質選択性の決定に重要であることが示唆された。3.SCNase成熟化機構に関しては、金属結合サブユニットであるγと活性化タンパク質P15K複合体にコバルトを結合させたところ、複合体の解離は起こらないことがわかった。この結果は、γ-P15K複合体の解離を引き起こすドライビングフォースは金属の結合ではないことを示している。

  • Research Products

    (12 results)

All 2010

All Presentation (12 results)

  • [Presentation] 変異体酵素によるニトリルヒドラターゼファミリー酵素の基質特異性解明2010

    • Author(s)
      山中保明
    • Organizer
      酵素工学研究会第64回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(東京都)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] Rhodococcus erythropolis N771由来-酸化窒素合成酵素遺伝子の発現及び精製2010

    • Author(s)
      前田悠貴
    • Organizer
      酵素工学研究会第64回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(東京都)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] Bacillus pallidus RAP8 由来コバルト型ニトリルヒドラターゼの大量発現系構築とキャラクタリゼーション2010

    • Author(s)
      佐藤雅
    • Organizer
      酵素工学研究会第64回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(東京都)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] Thiobacillus thioparus THI115 由来硫化カルボニル分解酵素COSaseの結晶構造2010

    • Author(s)
      高橋翔平
    • Organizer
      酵素工学研究会第64回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(東京都)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] チオシアネート加水分解酵素の成熟化過程におけるコバルト挿入機構2010

    • Author(s)
      中西拓也
    • Organizer
      酵素工学研究会第64回講演会
    • Place of Presentation
      東京大学山上会館(東京都)
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] Thiobacillus thioparus THI115 由来硫化カルボニル分解酵素の触媒機構2010

    • Author(s)
      高橋翔平
    • Organizer
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学豊中キャンパス(大阪府)
    • Year and Date
      2010-09-25
  • [Presentation] ニトリルヒドラターゼにおけるセリン配位子と近傍にある保存されたチロシン残基の機能の構造生物学的解析2010

    • Author(s)
      山中保明
    • Organizer
      第4回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学豊中キャンパス(大阪府)
    • Year and Date
      2010-09-25
  • [Presentation] Structural Basis for Catalytic Activation of Thiocyanate Hydrolase Involvine Metal-Ligated Cysteine Modification2010

    • Author(s)
      Masafumi Odaka
    • Organizer
      10th European Biological Inorganic Chemistry Conference
    • Place of Presentation
      Aristotle University of Thessaloniki (Thessaloniki)
    • Year and Date
      2010-06-22
  • [Presentation] Biochemical and structural studies on roles of the serine ligand and a strictly conserved tyrosine residue in Nitril Hydratase2010

    • Author(s)
      Yasuaki Yamanaka
    • Organizer
      10th European Biological Inorganic Chemistry Conference
    • Place of Presentation
      Aristotle University of Thessaloniki (Thessaloniki)
    • Year and Date
      2010-06-22
  • [Presentation] Bacillus pallidus RAPc8 由来コバルト型ニトリルヒドラターゼの大量発現系構築とキャラクタリゼーション2010

    • Author(s)
      佐藤雅
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] 鉄型ニトリルヒドラタニゼ活性中心におけるセリン配位子と近傍に存在するチロシン残基の機能の構造生物学的解析2010

    • Author(s)
      山中保明
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-16
  • [Presentation] チオシアネート加水分解酵素の成熟化過程におけるロバルト挿入機構2010

    • Author(s)
      中西拓也
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2010-06-16

URL: 

Published: 2012-07-19  

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