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2011 Fiscal Year Annual Research Report

DNA高次構造を応用する重金属イオン検出・除去システムの開発

Research Project

Project/Area Number 21350105
Research InstitutionKanagawa University

Principal Investigator

小野 晶  神奈川大学, 工学部, 教授 (10183253)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岡本 到  神奈川大学, 工学部, 特別助教 (40460133)
Keywords重金属イオン / 金属イオンセンサー / DNA / オリゴヌクレオチド / チミン結合高分子 / Ag(I)イオン / Hg(II)イオン / チオウラシル
Research Abstract

本研究はDNAの構造と機能を利用して新規機能物質を創製するものである。高感度かつ簡便にオンサイトで重金属イオンを検出する方法論、更には水溶液中から任意の重金属イオンを選択的に除去するための機能分子を開発する目的で、以下の研究を遂行した。
1.水溶液中の金属イオンを検出する蛍光性センサーを開発する目的で、環拡張型ピリミジン塩基対を有するDNA二重鎖を合成した。即ち、既報(A.Okamoto et al.,J.Am.Chem.Soc.,2003,125,4972-4973)に準じてbenzopyridopyrimidine(BPP)ヌクレオシドー3'-アミダイトユニットを合成し、DNA鎖に導入した。
Benzopyridopyrimidine(BPP)塩基は蛍光性である。DNA二重鎖中のBPP―BPPペアに金属イオンが結合すると蛍光強度が弱まると予想される。即ち、蛍光強度が変化する(弱まる)ことで金属イオンを検出するセンサーとなると期待した。平成23年度はBPP―BPPペアを有するDNA二重鎖を合成した。金属イオン存在下での蛍光測定、BBP塩基の化学修飾による金属イオン結合性の改変は24年度の課題である。
2.2-チオチミン(2S)、4-チオチミン(4S)を有するDNA鎖を化学合成し、2S―2Sペア、4S―4Sペアを有するDNA二重鎖を得た。チオチミンペアに二つのAg(1)イオンが結合し安定な金属含有塩基対が形成された。
3.金属イオンと選択的に結合するDNA模倣人工高分子の合成:チミン残基を結合した人工高分子の合成研究を遂行した。Hg(II)イオンはチミン塩基対に結合する。即ち、2残基のチミンに1つのHg(II)イオンが結合する。そこで、適当なリンカーで結合したチミンダイマーを合成し高分子に結合することで、高選択的かつ高効率的にHg(II)を結合する高分子が合成されると期待した。22年度はウラシルダイマー(ウラシルはチミンと同様にHg(II)イオンを結合する)を合成したが、23年度はチミンダイマーを有する高分子の合成に着手し、高分子合成用のチミンダイマーユニットの合成に成功した。チミンダイマーを有する高分子の合成とHg(II)イオン結合能の評価は今後の課題である。

  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Metal ion-binding properties of DNA duplexes containing thiopyrimidine base pairs2012

    • Author(s)
      Itaru Okamoto, Takashi Ono, Rimi Sameshima, Akira Ono
    • Journal Title

      Chem.Commun.

      Volume: 48 Pages: 4347-4349

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Raman spectroscopic detection of the T-HgII-T base pair and the ionic characteristics of mercury2012

    • Author(s)
      Tomomi Uchiyama, Takashi Miura, Hideo Takeuchi, Takenori Dairaku, Tomoyuki Komuro, Takuya Kawamura, Yoshinori Kondo, Ladislav Benda, Vladimir Sychrovsky, Petr Bour, Itaru Okamoto, Akira Ono, Yoshiyuki Tanaka
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 40 Pages: 5766-5774

    • DOI

      doi:10.1093/nar/gks208

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Positive cooperativity of the specific binding between Hg2+ ion and T:T mismatched base pairs in duplex DNA2012

    • Author(s)
      Hidetake Torigoe, Yukako Miyakawa, Akira Ono, Tetsuo Kozasa
    • Journal Title

      Thermochimica Acta

      Volume: 532 Pages: 28-35

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Binding of metal ions by pyrimidine base pairs in DNA duplexes2011

    • Author(s)
      Akira Ono, Hidetaka Torigoe, Yoshiyuki Tanaka, Itaru Okamoto
    • Journal Title

      Chem.Soc.Rev.

      Volume: 40 Pages: 5855-5866

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of Covalently Linked Parallel and Antiparallel DNA Duplexes Containing the Metal-Mediated Base Pairs T-Hg(II)-T And C-Ag(I)-C2011

    • Author(s)
      Takashi Ono, Yuko Saotome, Rei Sakabe, Itaru Okamoto, Akira Ono
    • Journal Title

      Chem.Commun.

      Volume: 47 Pages: 1542-1544

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Metal ion mediated thiopyrimidine base pairs in DNA duplexes2011

    • Author(s)
      Itaru Okamoto, Takashi Ono, Rimi Sameshima, Akira Ono
    • Organizer
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] Synthesis of oligodeoxyribonucleotides carrying metal ion binding residue2011

    • Author(s)
      Kaoru Arakawa, Itaru Okamoto, Akira Ono
    • Organizer
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] Synthesis and metal ion binding of polymers carrying uracil/thymine residue2011

    • Author(s)
      Hiroyuki Yabe, Syunichi Takasaki, Itaru Okamoto, Akira Ono
    • Organizer
      The 38th International Symposium on Nucleic Acid Chemistry
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2011-11-10
  • [Presentation] Synthesis of Metal Ion Sensors Based on DNA-Metal Interactions2011

    • Author(s)
      Akira Ono, Kumiko Sugiyama, Yuko Koyama, Yusuke Yamoto, Takashi Yazawa, Itaru Okamoto
    • Organizer
      12th International Symposium on Biotechnology Metal Complexes and Catalysis
    • Place of Presentation
      内モンゴル大学、中国(招待公演)
    • Year and Date
      2011-08-19
  • [Presentation] リンカーで結合したチミンダイマーの合成と反応2011

    • Author(s)
      高崎俊一、矢部裕之、岡本到、小野晶
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      2011-03-25
  • [Presentation] ウラシル結合高分子によるHg(II)イオンの除去2011

    • Author(s)
      矢部裕之、岡本到、小野晶
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      2011-03-25
  • [Presentation] 金属イオン結合性側鎖を有する短鎖DNA二重鎖の合成2011

    • Author(s)
      荒川薫、岡本到、小野晶
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      2011-03-25
  • [Presentation] 重金属イオンと5-フルオロウラシルを含むミスマッチ塩基対の相互作用解析2011

    • Author(s)
      福士京、小野晶、鳥越秀峰
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      2011-03-25
  • [Remarks]

    • URL

      http://kenkyu.kanagawa-u.ac.jp/kgdb/KgApp?kyoinId=ymkdgeooggg&keyword=%E5%B0%8F%E9%87%8E+%E6%99%B6+

  • [Remarks]

    • URL

      http://apchem2.kanagawa-u.ac.jp/~onolab/welcome.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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