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2009 Fiscal Year Annual Research Report

工学的展開を目指す天然変性蛋白質の構造・機能解析

Research Project

Project/Area Number 21360398
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

津本 浩平  The University of Tokyo, 大学院・新領域創成科学研究科, 准教授 (90271866)

Keywords蛋白質 / 分子認識 / 生物・生体工学 / ナノバイオ / 天然変性
Research Abstract

(1)各種欠損体の構築
Tob1:各ドメインを1つ以上欠損させた欠損体について、Flagペプチドの融合蛋白質として構築した。可溶性分子としての調製が可能であった。Elastin binding protein of Staphylococcus aureus (EbpS):構造・機能に重要なドメインならびにアミノ酸残基を同定するため、アミノ酸配列の特徴に基づいて3つのブロックに分割し、各ドメインを1つ以上欠損させた欠損体の発現・調製系を構築した。
(2)複合体の物性解析
Tob1、EbpS双方について、全長蛋白質ならびに欠損体の溶液構造を円二色性や蛍光スペクトルを用いて評価した。N末端ドメインを有する分子種を中心に、熱安定性や化学安定性を、示差去査型熱量測定(DSC)ならびに変性剤滴定による構造変化から熱力字的に評価した。
(3)環境制御に基づいた天然変性蛋白質の自己集積構造への誘導と構造解析:EbpS
Zn,Cu,Co,Fe,Mnについて、pHおよびイオン強度など溶媒の変化に伴う会合形成の変化を見た。蛋白質の表面状態によって親和性が変化するアルギニンのような添加剤の添加が会合形成能に及ぼす影響を考察した。(1)で構築した欠損体について(1)~(3)についての考察を行い、ドメインの特徴を明らかにした。
(4)表面プラズモン測定(SPR)滴定型熱量計(ITC)を用いた解析:Tob1
Tob1と標的蛋白質との複合体形成における結合速度と解離速度についてbiacoreT100を用いて測定した。EbpSと各種金属イオンの相互作用、Tob1と各種標的蛋白質の相互作用について、VT-ITCを用いて、複合体の形成に伴い発生する熱量を測定し、その特徴を明らかにした。

  • Research Products

    (43 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (25 results) (of which Peer Reviewed: 22 results) Presentation (14 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Screening of effective column rinse solvent for Protein-A chromatography.2010

    • Author(s)
      Yumioka R
    • Journal Title

      Protein Exp.Purif. 70

      Pages: 218-223

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Temperature and salt concentration alter base-sequence selectivity of a duplex DNA-binding protein.2010

    • Author(s)
      Nagatoishi S
    • Journal Title

      Mol.Biosyst. 6

      Pages: 98-101

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] MEP HyperCel chromatography II : Binding, washing and elution.2010

    • Author(s)
      Arakawa T
    • Journal Title

      Protein Expr Purif. 71

      Pages: 168-173

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Antigen-antibody Binding2010

    • Author(s)
      Kumagai I., 津本浩平
    • Journal Title

      Encyclopedia of Life Sciences (掲載確定, 印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contribution of asparagine residues to the stabilization of a proteinaceous antigen-antibody complex : HyHEL-10-HEL2010

    • Author(s)
      Yokota A.
    • Journal Title

      J.Biol.Chem. 285

      Pages: 7686-7696

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Signal peptide design for improving recombinant protein secretion in the baculovirus expression vector system2010

    • Author(s)
      Futatsumori-Sugai M
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 391

      Pages: 931-935

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Direct and Selective Immobilization of Proteins by Means of an Inorganic Material-Binding Peptide :2010

    • Author(s)
      Yokoo N
    • Journal Title

      J.Phys.Chem.B. 114

      Pages: 480-486

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contribution of the flexible loop region to the function of Staphylococcal enterotoxin B(SEB)2010

    • Author(s)
      Yanaka S
    • Journal Title

      Protein Eng.Des.Select. (掲載確定, 印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solubilization of Membrane Proteins with Novel N-Acylamino Acid Detergents.2010

    • Author(s)
      Abe R
    • Journal Title

      Mol.BioSyst. 6

      Pages: 677-679

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Non-Denaturing Solubilization of Inclusion Bodies.2010

    • Author(s)
      津本浩平
    • Journal Title

      Curr Pharm Biotechnol. (掲載確定, 印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Step-Wise Refolding of Recombinant Proteins.2010

    • Author(s)
      津本浩平
    • Journal Title

      Curr Pharm Biotechnol. (掲載確定, 印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reactive oxygen species induced by Streptococcus pyogenes invasion trigger apoptotic cell death in infected epithelial cells.2010

    • Author(s)
      Aikawa C
    • Journal Title

      Cell Microbiol. (掲載確定, 印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Glues Carrying Multiple Guanidinium Ion Pendants via an Oligoether Spacer : Stabilization of Microtubules against Depolymerization.2009

    • Author(s)
      Okuro K.
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 131

      Pages: 1626-1627

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Immobilized metal affinity chromatography in the presence of arginine.2009

    • Author(s)
      Abe R
    • Journal Title

      Biochem.Biophys.Res.Commun. 381

      Pages: 306-310

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Contributions of interfacial residues of human Interleukin15 to the specificity and affinity for its private alpha-receptor.2009

    • Author(s)
      Sakamoto S
    • Journal Title

      J.Mol.Biol. 389

      Pages: 880-894

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Impact of intrinsic cooperative thermodynamics of peptide-MHC complexes on antiviral activity of HIV-specific cytotoxic T lymphocytes2009

    • Author(s)
      Motozono C
    • Journal Title

      J.Immunol. 182

      Pages: 5528-5536

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The interaction of hyperthermophilic TATA-box binding protein with single-stranded DNA is entropically favorable and exhibits a large negative heat capacity change at high salt concentration.2009

    • Author(s)
      Nagatoishi S
    • Journal Title

      Mol.BioSyst. 5

      Pages: 957-961

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Utilization of an arginine-elution method for FLAG-tag chromatography2009

    • Author(s)
      Futatsumori-Sugai M
    • Journal Title

      Protein Expr Purif. 67

      Pages: 148-155

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] To be excluded or to bind, that is the question : Arginine effects on proteins2009

    • Author(s)
      Nakakido M
    • Journal Title

      Curr.Pharm.Biotechnol. 10

      Pages: 415-420

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Observation of the membrane-binding activity and domain structure of gpV, which comprises the tail spike of bacteriophage P2.2009

    • Author(s)
      Kageyama Y
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 10129-10135

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Manipulation of protein-complex function by using an engineered heterotrimeric coiled-coil switch.2009

    • Author(s)
      Mizuno T
    • Journal Title

      Org.Biomol.Chem. 7

      Pages: 3102-3111

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] アルギニンによる蛋白質ハンドリング2009

    • Author(s)
      工藤基徳
    • Journal Title

      ペプチドニュースレター 72

      Pages: 9-11

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 抗体による環状ポリエーテル系毒素シガトキシンの認識と識別2009

    • Author(s)
      宇井美穂子
    • Journal Title

      蛋白質核酸酵素 54

      Pages: 1182-1189

  • [Journal Article] 抗原抗体相互作用の熱力学的解析:特異性と親和性2009

    • Author(s)
      津本浩平
    • Journal Title

      熱測定 36

      Pages: 205-215

  • [Journal Article] 相互作用の熱力学情報に基づく低分子リガンド設計2009

    • Author(s)
      津本浩平
    • Journal Title

      薬学雑誌 (掲載確定, 印刷中)

  • [Presentation] ヒト主要組織適合複合体の安定性が細胞障害性T細胞活性に及ぼす影響2009

    • Author(s)
      谷中冴子
    • Organizer
      第47回 日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島文理大学
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] 黄色ブドウ球菌由来膜表面蛋白質EbpSの物性・機能解析2009

    • Author(s)
      中木戸誠
    • Organizer
      第82回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] 構造情報を基盤とした黄色ブドウ球菌由来莢膜合成蛋白質の機能解析2009

    • Author(s)
      宮房孝光
    • Organizer
      第82回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] 高機能化IL11改変体の特性解析2009

    • Author(s)
      谷中冴子
    • Organizer
      第82回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] 黄色ブドウ球菌由来鉄取り込み蛋白質におけるヘム輸送機構解析2009

    • Author(s)
      安部良太
    • Organizer
      第82回 日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      20091021-20091024
  • [Presentation] 黄色ブドウ球菌膜表面由来天然変性蛋白質EbpSの物性解析2009

    • Author(s)
      中木戸誠
    • Organizer
      第24回 生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      20090913-20090915
  • [Presentation] 化膿レンサ球菌由来ヒアルロン酸分解酵素群の構造特性評価2009

    • Author(s)
      宮房孝光
    • Organizer
      第24回 生体機能関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学医系キャンパス・百年記念講堂
    • Year and Date
      20090913-20090915
  • [Presentation] Structure-based analysis reveals hydration changes of Lysozyme and Glucose isomerase induced by Arginine hydrochloride2009

    • Author(s)
      中木戸誠
    • Organizer
      Protein Society 23^<rd> annual symposium
    • Place of Presentation
      Boston Marriott Copley Place
    • Year and Date
      20090725-20090729
  • [Presentation] Structural Basis for Multimeric Heme Complexation through a Specific Protein-Heme Interaction2009

    • Author(s)
      Masato Watanabe
    • Organizer
      Protein Society 23^<rd> annual symposium
    • Place of Presentation
      Boston Marriott Copley Place
    • Year and Date
      20090725-20090729
  • [Presentation] Characterization of Interleukin 11 agonist & antagonist2009

    • Author(s)
      谷中冴子
    • Organizer
      Protein Society 23^<rd> annual symposium
    • Place of Presentation
      Boston Marriott Copley Place
    • Year and Date
      20090725-20090729
  • [Presentation] Three Hot-Spot Regions Define the High Affinity of Human Interleukin 15 for its Private alpha-Receptor2009

    • Author(s)
      Caaveiro, J.M.M.
    • Organizer
      Protein Society 23^<rd> annual symposium
    • Place of Presentation
      Boston Marriott Copley Place
    • Year and Date
      20090725-20090729
  • [Presentation] 創薬開発を目指したインターロイキン11改変体の物性解析2009

    • Author(s)
      谷中冴子
    • Organizer
      第74回 日本インターフェロン・サイトカイン学会
    • Place of Presentation
      芝覧会館(京都大学)
    • Year and Date
      20090626-20090627
  • [Presentation] 黄色ブドウ球菌膜表面由来機能未知蛋白質EbpSの機能解析2009

    • Author(s)
      中木戸誠
    • Organizer
      第9回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Presentation] HLA-HIV由来抗原ペプチド複合体の熱安定性と抗原性2009

    • Author(s)
      谷中冴子
    • Organizer
      第9回 日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • Year and Date
      20090520-20090522
  • [Book] 酵素利用技術体系2010

    • Author(s)
      小宮山眞監修
    • Total Pages
      1500
    • Publisher
      エヌティーエス
  • [Remarks]

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/phys-biochem

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 抗体改変による疾患部位特異的な診断薬・治療薬の集積法2009

    • Inventor(s)
      浜窪隆雄、津本浩平, 他
    • Industrial Property Rights Holder
      東大TLO
    • Industrial Property Number
      特願平
    • Filing Date
      2009-04-09
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 抗体改変による疾患部位特異的な診断薬・治療薬の集積法2009

    • Inventor(s)
      浜窪隆雄、津本浩平, 他
    • Industrial Property Rights Holder
      東大TLO
    • Industrial Property Number
      特願平
    • Filing Date
      2009-04-09
    • Overseas

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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