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2009 Fiscal Year Annual Research Report

赤外分光法による光合成水分解反応の分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 21370063
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

野口 巧  University of Tsukuba, 大学院・数理物質科学研究科, 准教授 (60241246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 千尋  神奈川県産業技術センター, 化学技術部, 主任研究員 (50233804)
Keywords光合成 / 酸素発生 / 水分解 / 赤外分光 / 振動分光学
Research Abstract

1.光合成水分解反応におけるFTIR法によるプロトン放出検出:
水分解反応の光駆動中間状態サイクルにおけるプロトン放出過程を調べるため、フーリエ変換赤外(FTIR)法を用いた新たなプロトン検出法を開発した。高濃度のMes緩衝液に水分解によるプロトンをトラップさせそのMesのプロトン化反応をFTIR差スペクトルで観測した。その結果、水分解過程におけるプロトン放出パターンは4つの中間状態遷移でほぼ1:0:1:2となることが示された。
2.光化学系IIにおけるPsbPの酸素発生系との直接的相互作用:
FTIR法を用いて表在性蛋白質の酸素発生反応への関与について調べた。表在性蛋白質PsbP,PsbQ,PsbOを除去、または再構成した光化学系II試料を用いて、酸素発生系のFTIR差スペクトルを測定した。その結果、PsbPの脱着によってのみ酸素発生系の蛋白質コンフォメーションが変化することが示された。このPsbPの直接的相互作用が、そのCa^<2+>・Cl^-保持能の発言に関与していると考えられる。
3.光合成酸素発生系におけるCP43-354位グルタミン酸のFTIRによる構造解析:
酸素発生MnクラスターへのCP43-E354配位構造を調べるため、シアノバクテリアSynechocystis sp.PCC 6803のCP43-E354Q部位特異変異体を用いて酸素発生系のFTIR差スペクトルを測定した。その結果、カルボキシル基の対称および逆対称伸縮振動領域に大きなスペクトル変化が観測された。これらのことから、CP43-E354はMn原子への配位子の一つであることが示された。
4.酸素発生系における過渡的中間体の時間分解赤外測定:
光合成酸素発生反応における酸素分子形成直前の反応中間体の構造を調べるため、時間分解赤外測定を行った。その結果、カルボキシル配位子の対称伸縮振動領域(1400cm^<-1>)、及び水素結合構造由来の極性プロトンの振動領域(2500cm^<-1>)について、各中間状態遷移における赤外吸収の時間変化を観測することができた。今後、S/Nを向上させ、過渡的中間状態の構造及び反応について、より詳細な解析を行う予定である。

  • Research Products

    (38 results)

All 2010 2009

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (29 results)

  • [Journal Article] Hydrogen bond interactions of the pheophytin electron acceptor and its radical anion in photosystem II as revealed by Fourier transform infrared difference spectroscopy2010

    • Author(s)
      Y.Shibuya, R.Takahashi, T.Okubo, H.Suzuki, M.Sugiura, 野口巧
    • Journal Title

      Biochemistry 49

      Pages: 493-501

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fourier transform infrared spectroscopy of special pair bacteriochlorophylls in homodimeric reaction centers of heliobacteria and green sulfur bacteria2010

    • Author(s)
      野口巧
    • Journal Title

      Photosynth.Res. (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of the D_0→D_1 transition of β-carotene radical cation photoinduced in photosystem II2009

    • Author(s)
      T.Okubo, T.Tomo, 野口巧
    • Journal Title

      Photochem.Photobiol.Sci. 8

      Pages: 157-161

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 共鳴ラマン分光法2009

    • Author(s)
      野口巧
    • Journal Title

      「光合成研究法」低温科学 67

      Pages: 491-496

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 光誘起フーリエ変換赤外差スペクトル法2009

    • Author(s)
      野口巧
    • Journal Title

      「光合成研究法」低温科学 67

      Pages: 483-489

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Monitoring proton release during photosynthetic water oxidation in photosystem II by means of isotope-edited infrared spectroscopy2009

    • Author(s)
      H.Suzuki, M.Sugiura, 野口巧
    • Journal Title

      J.Am.Chem.Soc. 131

      Pages: 7849-7857

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Effect of a Single Amino Acid Substitution of the 43kDa Chlorophyll-protein on the oxygen-evolving reaction of the cyanobacterium Synechocystis sp.PCC 6803 : Analysis of the Glu354Gln mutation2009

    • Author(s)
      Y.Shimada, H.Suzuki, T.Tsuchiya, T.Tomo, 野口巧, M.Mimuro
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 6095-6103

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] FTIR evidence that the PsbP extrinsic protein induces protein conformational changes around the oxygen-evolving Mn cluster in photosystem II2009

    • Author(s)
      M.Tomita, K.Ifuku, F.Sato, 野口巧
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 6318-6325

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural coupling of a tyrosine side chain with the non-heme iron center in photosystem II as revealed by light-induced Fourier transform infrared difference spectroscopy2009

    • Author(s)
      R.Takahashi, A.Boussac, M.Sugiura, 野口巧
    • Journal Title

      Biochemistry 48

      Pages: 8994-9001

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 除草剤効果による光化学系IIの光傷害機構の解析2010

    • Author(s)
      井手段一聖、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-21
  • [Presentation] 光化学系IIにおけるチロシンYzとD1-H190の相互作用2010

    • Author(s)
      高橋亮太、杉浦美羽、Alain Boussac、野口巧
    • Organizer
      日本植物生群会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-20100321
  • [Presentation] 高等植物のPsbPタンパク質におけるC末端側ドメインの機能解析2010

    • Author(s)
      垣内秀介、富田めぐみ、井戸邦夫、伊福健太郎、野口巧、佐藤文彦
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      20100318-20100321
  • [Presentation] π共役カルボニル基への水素結合によるフェオフィチン電子受容体の酸化還元電位制御機構2010

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      「高次π空間の創発と機能開発」第3回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター
    • Year and Date
      20100315-20100316
  • [Presentation] FTIR study of the hydrogen-bond structure of the quinone electron accepter Q_A in photosystem II2010

    • Author(s)
      梢雄多, 高野晃, 鈴木博行, 野口巧
    • Organizer
      Joint Conference of NIMS International Workshop on Photocatalysis and Environmental Remediation Materials 2010 & 3rd Japan-China Symposium on Advanced Photocatalytic Materials
    • Place of Presentation
      NIMS, Tsukuba
    • Year and Date
      20100221-20100224
  • [Presentation] Polarized ATR-FTIR analysis of the orientations of the carboxylate ligands to the photosynthetic oxygen-evolving Mn cluster2010

    • Author(s)
      飯笹充裕, 鈴木博行, 野口巧
    • Organizer
      Joint Conference of NIMS International Workshop on Photocatalysis and Environmental Remediation Materials 2010 & 3rd Japan-China Symposium on Advanced Photocatalytic Materials
    • Place of Presentation
      NIMS, Tsukuba
    • Year and Date
      20100221-20100224
  • [Presentation] Herbicide effect on the photodamage to photosystem II as studied by FTIR spectroscopy2010

    • Author(s)
      井手段一聖, 野口巧
    • Organizer
      Joint Conference of NIMS International Workshop on Photocatalysis and Environmental Remediation Materials 2010 & 3rd Japan-China Symposium on Advanced Photocatalytic Materials
    • Place of Presentation
      NIMS, Tsukuba
    • Year and Date
      20100221-20100224
  • [Presentation] カロテノイドの励起移動と電子移動2010

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      嶋田敬三先生退職記念シンポジウム-光合成細菌:色素タンパク質からの広がり-
    • Place of Presentation
      首都大学東京
    • Year and Date
      2010-03-13
  • [Presentation] Molecular mechanism of photosynthetic water oxidation2010

    • Author(s)
      Takumi Noguchi
    • Organizer
      1st Symposium of the Innovative Center of Nanomaterials Science for Environment and Energy
    • Place of Presentation
      NIMS, Tsukuba
    • Year and Date
      2010-02-09
  • [Presentation] Structural Couplings of π-Amino Acids with the Iron-Quinone Electron Acceptor in Photosystem II2009

    • Author(s)
      高橋亮太, 野口巧
    • Organizer
      1st International Symposium on Emergence of Highly Elaborated π-Space and Its Function
    • Place of Presentation
      Osaka
    • Year and Date
      20091218-20091219
  • [Presentation] Interactions of herbicides in the QB binding site in photosystem II : Analysis by Fourier transform infrared spectroscopy2009

    • Author(s)
      高橋亮太, 野口巧
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] Molecular interaction of the primary quinone electron acceptor Q_A in photosystem II as studied by Q_A reconstitution and FTIR analysis2009

    • Author(s)
      Yuta Kozue, Akira Takano, Ikuyo Sugimoto, 鈴木博行, 杉浦美羽, Yuichiro Takahashi, 野口巧
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] The mechanism of photodamage of phososystem II as revealed by herbicide effects and FTIR difference spectroscopy2009

    • Author(s)
      Issei Idedan, Yuichi Shibuya, 野口巧
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] FTIR study on the structure of CP43-E354 in the photosynthetic oxygen-evolving center2009

    • Author(s)
      Hiroyuki Suzuki Yuichiro Shimada, Tohru Tsuchiya, Tatsuya Tomo, Mamoru Mimuro and Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-1101
  • [Presentation] 光合成蛋白質における高次π空間による光誘起電子移動反応の分子制御機構2009

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      「高次π空間の創発と機能開発」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      京都テルサ
    • Year and Date
      20090827-20090828
  • [Presentation] Influence of D1-H332, a ligand to the Mn4Ca-cluster, in the water oxidation mechanism of the oxygen-evolving Photosystem II enzyme2009

    • Author(s)
      杉浦美羽, Yohei Ohno, Fabrice Rappaport, 鈴木博行, 野口巧, Hidenori Hayashi, Alain Boussac
    • Organizer
      14th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20090725-20090730
  • [Presentation] Hydrogen Bond Network around the Non-Heme Iron in Photosystem II2009

    • Author(s)
      高橋亮太, 杉浦美羽, Alain Boussac, 野口巧
    • Organizer
      14th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20090725-20090730
  • [Presentation] FTIR Detection of the DOD Bending Vibrations of Water Molecules Involved in the Photosynthetic Water Oxidation2009

    • Author(s)
      鈴木博行, 杉浦美羽, 野口巧
    • Organizer
      14th International Conference on Biological Inorganic Chemistry
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20090725-20090730
  • [Presentation] 保存されたヒスチジン残基を置換した光化学系II PsbPタンパク質の機能解析2009

    • Author(s)
      垣内秀介、冨田めぐみ、井戸邦夫、伊福健太郎、野口巧、佐藤文彦
    • Organizer
      光合成の色素系と反応中心に関するセミナー
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20090711-20090712
  • [Presentation] 光化学系IIの酸素発生系におけるCP43の関与とその鍵構造2009

    • Author(s)
      嶋田友一郎、鈴木博行、土屋徹、鞆達也、野口巧、三室守
    • Organizer
      光合成の色素系と反応中心に関するセミナー
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20090711-20090712
  • [Presentation] 光化学系IIにおける除草剤とQ_B部位の相互作用2009

    • Author(s)
      高橋亮太、野口巧
    • Organizer
      光合成の色素系と反応中心に関するセミナー
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20090711-20090712
  • [Presentation] Hydrogen bond network around the non-heme iron in photosystem II2009

    • Author(s)
      高橋亮太, 杉浦美羽, Alain Boussac, 野口巧
    • Organizer
      Gordon Research Conferences on Photosynthesis
    • Place of Presentation
      Bryant College in Smithfield, Rhode Island, USA
    • Year and Date
      20090628-20090703
  • [Presentation] 光合成水分解反応のFTIR解析:DOD変角振動による水分子の検出2009

    • Author(s)
      鈴木博行、杉浦美羽、野口巧
    • Organizer
      生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      北海道大
    • Year and Date
      20090619-20090620
  • [Presentation] Evolutionary aspects of the special pair chlorophyll P680 in photosystem II : How was the extremely high oxidation potential achieved?2009

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      15th International Congress on Photobiology
    • Place of Presentation
      Dusseldorf, Germany
    • Year and Date
      20090618-20090623
  • [Presentation] シアノバクテリオクロムTePixJの光可逆変換機構の解明2009

    • Author(s)
      石塚量見、鈴木博行、神谷歩、成川礼、野口巧、猪股勝彦、池内昌彦
    • Organizer
      日本光合成研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      20090529-20090530
  • [Presentation] 光化学II蛋白質におけるキノン電子受容体Q_Aの再構成と相互作用構造2009

    • Author(s)
      梢雄多, 高野晃, 鈴木博行, 杉浦美羽, 野口巧
    • Organizer
      日本光合成研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      20090529-20090530
  • [Presentation] 除草剤効果を用いた植物の光傷害メカニズムの解明2009

    • Author(s)
      井手段一聖、渋谷勇一、野口巧
    • Organizer
      日本光合成研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      20090529-20090530
  • [Presentation] 偏光FTIR法による酸素発生Mnクラスターの配位子構造の解析2009

    • Author(s)
      飯笹充裕、鈴木博行、野口巧
    • Organizer
      日本光合成研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      20090529-20090530
  • [Presentation] 光合成水分解反応に関与する水素結合ネットワーク:FTIR法による解析2009

    • Author(s)
      津田稔也、鈴木博行、渋谷勇一、野口巧
    • Organizer
      日本光合成研究会シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      20090529-20090530

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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