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2011 Fiscal Year Annual Research Report

赤外分光法による光合成水分解反応の分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 21370063
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

野口 巧  名古屋大学, 理学研究科, 教授 (60241246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 千尋  神奈川県産業技術センター, 化学技術部, 主任研究員 (50233804)
Keywords光合成 / 水分解 / 酸素発生 / 振動分光学 / 赤外分光
Research Abstract

光合成による水分解・酸素発生反応のメカニズムを時間分解赤外分光法を用いて調べた。好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus elontgatusより単離・精製した光化学系IIコア蛋白質複合体に、連続した閃光照射(2Hz)を与え、その際の赤外吸収変化をマイクロ秒からミリ秒オーダーで追跡した。1400cm^<-1>の赤外吸収変化によって蛋白質中のAsp,Glu由来のカルボキシル基(COO^-)の動きを、また、2500cm^<-1>の吸収変化によって、水素結合ネットワークにおける高いプロトン分極を持つ水素原子の動きを検出した。その結果、酸素が放出されるS_3→S_0遷移において、マンガンクラスターからチロシンラジカル(Y_z^-)への電子移動に先立つ約200μsのいわゆる"lag time"(他の分光法では何も変化が観測されない時間領域)においてプロトン放出を示唆する大きなプロトンの動きが観測された。また、S_1→S_2遷移においては、共役したプロトン移動と電子移動が、S_2→S_3遷移においてはマンガンクラスターからY_Z^-への電子移動よりも速いプロトン移動が観測された。一方、S_0-S_1遷移では、カルボキシル基の約1msのゆっくりとした構造変化が観測され、S_1状態における蛋白質の緩和過程を示すと解釈された。本研究は水分解反応における蛋白質及びプロトンの動きを時間分解赤外法で示した初めての研究であり、この手法が水分解機構の解明に極めて有効であることを示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでの赤外分光法を用いた研究によって、水分解反応の分子機構について、(1)新たな水の赤外バンドの検出、(2)プロトン検出、(3)カルボキシル配位子及びアルギニン側鎖の反応、(4)アンモニア阻害のメカニズムなど、さまざまな知見が得られている。さらに、本研究課題で最も大きな目標としていた、時間分解赤外分光による水分解反応の際の蛋白質およびプロトンのダイナミクスの検出に成功した。これらのことから、研究計画はおおむね順調に進んでいると考えている。

Strategy for Future Research Activity

赤外分光法を用いて光合成水分解反応のメカニズムを明らかにするため、これまでの研究で開発した手法および明らかにした知見に基づき、(1)Ca^<2+>をSr^<2+>やBa^<2+>などの他の金属イオンに置換することによりCaに配位する基質水分子の反応を調べる、(2)アンモニウイオンやメタノールなどの阻害剤の各中間状態遷移への効果を調べる、(3)マンガンクラスターを安定化する表在性蛋白質の役割を調べる、(4)時間分解赤外分光法を用いて、C^<2+>やCl^-の役割や水の反応過程を調べる、等の研究を行う。

  • Research Products

    (27 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (20 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Time-resolved infrared detection of the proton and protein dynamics during photosynthetic oxygen evolution2012

    • Author(s)
      T. Noguchi, H. Suzuki, M. Tsuno, M. Sugiura, and C. Kato
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 3205-3214

    • DOI

      DOI:10.1021/bi300294n

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The PsbQ protein stabilizes the functional binding of the PsbP protein to photosystem II in higher plants2012

    • Author(s)
      S. Kakiuchi, C. Uno, K. Ido, T. Nishimura, T. Noguchi, K. Ifuku, and F. Sato
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1817 Pages: 1346-1351

    • DOI

      DOI:10.1016/j.bbabio.2012.01.009

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photosystem II-gold nanoparticle conjugate as a nano-device for the development of artificial light-driven water-splitting systems2011

    • Author(s)
      T. Noji, H. Suzuki, T. Gotoh, M. Iwai, M. Ikeuchi, T. Tomo, and T. Noguchi
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. Lett.

      Volume: 2 Pages: 2448-2452

    • DOI

      DOI:10.1021/jz201172y

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] How does the Q_B site influence propagate to the Q_A site in Photosystem II?2011

    • Author(s)
      H.Ishikita, K.Hasegawa, T.Noguchi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 50 Pages: 5436-5442

    • DOI

      10.1021/bi102023x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Herbicide effect on the photodamage process of photosystem II : Fourier transforminfrared study2011

    • Author(s)
      I.Idedan, T.Tomo, T.Noguchi
    • Journal Title

      Biochim.Biophys.Acta

      Volume: 1807 Pages: 1214-1220

    • DOI

      10.1016/j.bbabio.2011.06.006

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Acaryochloris marinaの光化学系IIにおけるクロロフィル三重項状態の赤外分光検出2012

    • Author(s)
      佐野裕子、大久保辰則、遠藤嘉一郎、鞆達也、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120316-20120318
  • [Presentation] 光合成酸素発生系における表在性蛋白質PsbPの機能発現機構:FTIR法による解析2012

    • Author(s)
      宇野千尋、井戸邦夫、垣内秀介、西村大志、佐藤文彦、伊福健太郎、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20120316-18
  • [Presentation] 光合成πナノ電極による水分解機構と人工光水分解デバイスへの応用2012

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      「高次π空間の創発と機能開発」第7回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      松山(招待講演)
    • Year and Date
      20120313-20120314
  • [Presentation] 光化学系IIにおけるキノン電子受容体の酸化還元制御機構2012

    • Author(s)
      芦沢竜壮、野口巧
    • Organizer
      生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大
    • Year and Date
      2012-03-19
  • [Presentation] 光化学系IIの水分解機構解析と人工光合成への応用2012

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      フォーラム:人工光合成
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2012-01-27
  • [Presentation] Photosystem II-gold nanoparticle conjugate as a π-space nano-device for the development of artificial light-driven water-splitting systems2011

    • Author(s)
      Takumi Noguchi
    • Organizer
      3rd International symposium on emergence of highly elaborated π-space and its function
    • Place of Presentation
      Tsukuba
    • Year and Date
      20111118-20111119
  • [Presentation] 密度汎関数法によるポリオキシメチレンの振動解析2011

    • Author(s)
      高橋亮太、廣田晋一、野口巧
    • Organizer
      高分子討論会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20110928-20110930
  • [Presentation] 光化学系IIの酸素発生系に関与するアルギニン残基の同位体標識赤外分光による検出2011

    • Author(s)
      嶋田友一郎、鈴木博行、土屋徹、三室守、野口巧
    • Organizer
      日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      京都国際会議場
    • Year and Date
      20110921-20110924
  • [Presentation] Formation of photosystem II-gold nanoparticle conjugates2011

    • Author(s)
      Tomoyasu Noji, Kousuke Kawahara, Hiroyuki Suzuki, Toshiaki Goto, Tatsuya Tomo, Masako Iwai, Masahiko Ikeuchi, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Energetic comparison of Thermosynechococcus elongatus Photosystem II composed of either PsbA1 or PsbA32011

    • Author(s)
      Miwa Sugiura, Fabrice Rappaport, Yuki Kato, Takumi Noguchi, Alain Boussac
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      20110916-20110918
  • [Presentation] Interaction and function of the PsbP extrinsic protein in the oxygen evolving center of photosystem II2011

    • Author(s)
      Chihiro Uno, Shusuke Kakiuchi, Fumihiko Sato, Kentaro Ifuku, and Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学
    • Year and Date
      20110916-18
  • [Presentation] In vitro reconstitution and FTIR analysis of cyanobacteriochrome AnPixJ using ^<13>C- and ^<15>N-labeled p hy cocy anobilin2011

    • Author(s)
      Rei Narikawa, Yusuke Tomita, John Hughes, Markus Knipp, Takumi Noguchi, Wolfgang Gaertner, Masahiko Ikeuchi
    • Organizer
      International Conference on Tetrapyrrole Photoreceptors of Photosynthetic Organisms 2011
    • Place of Presentation
      Berlin
    • Year and Date
      20110724-20110728
  • [Presentation] 光合成水分解系におけるアルギニン由来π系グアニジル基の相互作用と機能2011

    • Author(s)
      嶋田友一郎、鈴木博行、土屋徹、三室守、野口巧
    • Organizer
      「高次π空間の創発と機能開発」第6回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      岡崎
    • Year and Date
      20110714-20110715
  • [Presentation] 光化学系IIの水分解反応に関与するアルギニン残基検出系の構築2011

    • Author(s)
      嶋田友一郎、鈴木博行、土屋徹、三室守、野口巧
    • Organizer
      光合成の色素系と反応中心に関するセミナー
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      20110709-20110710
  • [Presentation] 光合成酸素発生反応におけるアンモニア阻害のメカニズム2011

    • Author(s)
      津野将弥、鈴木博行、野口巧
    • Organizer
      生体分子科学討論会
    • Place of Presentation
      筑波大
    • Year and Date
      20110623-24
  • [Presentation] 光合成酸素発生反応におけるアンモニア阻害の分子機構2011

    • Author(s)
      津野将弥、鈴木博行、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20110603-20110604
  • [Presentation] 光化学系ITにおける13C同位体置換による第二キノン電子受容体Q_Bの赤外分光解析2011

    • Author(s)
      岩佐拓也、鈴木博行、杉浦美羽、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20110603-20110604
  • [Presentation] 光化学系II蛋白質の金ナノ粒子への結合2011

    • Author(s)
      野地智康、鈴木博行、五藤俊明、鞆達也、岩井雅子、池内昌彦、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20110603-20110604
  • [Presentation] 光合成酸素発生系における表在性タンパク質PsbPの相互作用と機能2011

    • Author(s)
      宇野千尋、垣内秀介、佐藤文彦、伊福健太郎、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      20110603-04
  • [Presentation] 赤外分光で探る光合成水分解反応の分子メカニズム2011

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      理研シンポジウム「生物を律する揺らぎのメカニズムを追い求めて-光合成と生体信号-」
    • Place of Presentation
      和光(招待講演)
    • Year and Date
      20110419-20110421
  • [Book] Photosynthetic O_2 Evolution, in Molecular Solar Fuels (T.Wydrzynski and W.Hillier, Eds.) Chapter 72011

    • Author(s)
      J.Messinger, T.Noguchi, J.Yano
    • Total Pages
      163-207
    • Publisher
      RSC Publishing, Cambridge UK
  • [Remarks]

    • URL

      http://glab.phys.nagoya-u.ac.jp/index.html

URL: 

Published: 2013-06-26  

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