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2012 Fiscal Year Annual Research Report

赤外分光法による光合成水分解反応の分子メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 21370063
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

野口 巧  名古屋大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60241246)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 加藤 千尋  神奈川県産業技術センター, 化学技術部, 研究員 (50233804)
Project Period (FY) 2009-04-01 – 2013-03-31
Keywords光合成 / 水分解 / 酸素発生 / 振動分光学 / 赤外分光
Research Abstract

1.閃光誘起フーリエ変換赤外(FTIR)差スペクトル法を用いて、人工電子受容体として添加したフェリシアン化物イオンの反応を追跡し、光化学系II蛋白質中の電子移動反応の量子効率を調べた。その閃光数依存性から、光合成水分解反応の各中間状態遷移(S0→S1,S1→S2,S2→S3,S3→S0)のミスファクター(次の中間状態に遷移しなかった水分解中心の割合)を見積もる新たな手法を開発した。この手法を用いてシアノバクテリア及びホウレンソウの水分解反応を解析した結果、ミスファクターはS0→S1; S1→S2 < S2→S3 < S3→S0 の順に大きくなり、酸素が放出されるS3→S0遷移において最大となることが示された。
2.高等植物の光化学系IIに結合する表在性蛋白質(PsbO,PsbP,PsbQ)が水分解反応を制御するメカニズムを明らかにするため、様々な部位特異的変異を施したPsbP蛋白質を光化学系IIに再構成し、その相互作用部位および水分解系の構造への効果をFTIR法を用いて調べた。その結果、PsbPのN末端及びH144近傍がコア蛋白質への結合に関与すること、PsbPが適切に結合することにより、水分解系の蛋白質二次構造が変化し、水分解系の構成要素であるCa2+および Cl-の結合を安定化することが明らかとなった。また、PsbQは単独では水分解能に寄与しないが、PsbPの結合を補助する役割を持ち、それによって水分解反応を制御していることが示された。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (31 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (24 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Monitoring the reactions of photosynthetic water oxidation using infrared spectroscopy2013

    • Author(s)
      T. Noguchi
    • Journal Title

      Biomedical Spectroscopy and Imaging

      Volume: 2 Pages: 115-128

    • DOI

      DOI:10.3233/BSI-130040

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular interactions of the quinone electron acceptors QA, QB and QC in photosystem II as studied by the fragment molecular orbital method2013

    • Author(s)
      K. Hasegawa and T. Noguchi
    • Journal Title

      Photosynth. Res.

      Volume: in press Pages: in press

    • DOI

      10.1007/s11120-012-9787-9

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Determination of the miss probabilities of individual S-state transitions during photosynthetic water oxidation by monitoring electron flow in photosystem II using FTIR spectroscopy2012

    • Author(s)
      H. Suzuki, M. Sugiura, and T. Noguchi
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 6776-6785

    • DOI

      DOI:10.1021/bi300708a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure around conserved His144 and Asp165 in the PsbP protein is important for the interaction between its N-terminus and the Cyt b559 subunit of photosystem II2012

    • Author(s)
      K. Ido, S. Kakiuchi, C. Uno, T. Nishimura, Y. Fukao, T. Noguchi, F. Sato, and K. Ifuku
    • Journal Title

      J. Biol. Chem

      Volume: 287 Pages: 26377-26387

    • DOI

      DOI:10.1074/jbc.M112.385286

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Time-resolved infrared detection of the proton and protein dynamics during photosynthetic oxygen evolution2012

    • Author(s)
      T. Noguchi, H. Suzuki, M. Tsuno, M. Sugiura, and C. Kato
    • Journal Title

      Biochemistry

      Volume: 51 Pages: 3205-3214

    • DOI

      DOI:10.1021/bi300294n

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The PsbQ protein stabilizes the functional binding of the PsbP protein to photosystem II in higher plants2012

    • Author(s)
      S. Kakiuchi, C. Uno, K. Ido, T. Nishimura, T. Noguchi, K. Ifuku, and F. Sato
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta

      Volume: 1817 Pages: 1346-1351

    • DOI

      DOI:10.1016/j.bbabio.2012.01.009

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 赤外光で探る光合成水分解メカニズム2013

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20130321-23
  • [Presentation] 光化学系Iおよび光化学系IIの金ナノ粒子への結合による人工光合成ナノデバイスの開発2013

    • Author(s)
      河原弘典、井上名津子、加藤祐樹、中西華代、鞆達也、菓子野康浩、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20130321-23
  • [Presentation] 光合成水分解反応に関与する水分子および水素結合ネットワークの赤外分光解析2013

    • Author(s)
      大田該、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20130321-23
  • [Presentation] 部位特異的変異導入によるホモダイマー型光合成反応中心の構造改変2013

    • Author(s)
      浅井智広、佐野裕子、加藤祐樹、野口巧、大岡宏造
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20130321-20130323
  • [Presentation] 紅藻の酸素発生系における表在性蛋白質の相互作用と機能発現機構:赤外分光法による解析2013

    • Author(s)
      宇野千尋、鈴木博行、長尾遼、鞆達也、野口巧
    • Organizer
      日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      20130321-20130323
  • [Presentation] 光合成水分解系の赤外分光解析と人工光合成への応用2012

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      「人工光合成による太陽光エネルギーの物質変換:実用化に向けての異分野融合」第一回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20121217-20121218
    • Invited
  • [Presentation] 光合成による光駆動水分解反応のメカニズム2012

    • Author(s)
      野口巧
    • Organizer
      第43回中部化学関係学協会支部連合秋季大会
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学
    • Year and Date
      20121110-11
  • [Presentation] Infrared Studies on the Molecular Mechanism of Photosynthetic Water Oxidation2012

    • Author(s)
      Takumi Noguchi
    • Organizer
      Okayama University International Symposium, “Structure and Dynamics of Photosynthetic Systems”
    • Place of Presentation
      Okayama, Japan
    • Year and Date
      20121022-20121023
    • Invited
  • [Presentation] Development of artificial light-driven water splitting nanodevice using gold nanoparticles and photosystem II2012

    • Author(s)
      Kousuke Kawahara, Tatsuya Tomo, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-24
  • [Presentation] Mechanism of controlling the redox potentials of the quinone electron acceptors in photosystem II2012

    • Author(s)
      Ryota Ashizawa, Takuya Iwasa, Miwa Sugiura, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] Mechanism of NH4+ inhibition in the S-state cycle of photosynthetic oxygen evolution2012

    • Author(s)
      Takashi Kobayashi, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] Local Structural Modifications around the Primary Electron Donor of the Green Sulfur Bacterial Photosynthetic Reaction Center2012

    • Author(s)
      Chihiro Azai, Yuko Sano, Takumi Noguchi, Hirozo Oh-oka
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] FTIR analysis of the hydrogen bonding network around the O2-evolving Mn4CaO5 cluster2012

    • Author(s)
      Kai Ota, Takumi Noguchi
    • Organizer
      日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      20120922-20120924
  • [Presentation] FTIR study on the functional mechanism of the extrinsic proteins in the oxygen evolving complex of photosystem II2012

    • Author(s)
      Chihiro Uno, Kunio Ido, Shusuke Kakiuchi, Fumihiko Sato, Kentaro Ifuku, Takumi Noguchi
    • Organizer
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2012
    • Place of Presentation
      Nagoya Univ.
    • Year and Date
      20120903-20120904
  • [Presentation] Effect of hydrogen bonds on the redox potential and vibrations of plastoquinone as studied by density functional theory calculations2012

    • Author(s)
      Ryota Ashizawa, Takumi Noguchi
    • Organizer
      IGER International Symposium on Science of Molecular Assembly and Biomolecular Systems 2012
    • Place of Presentation
      Nagoya Univ.
    • Year and Date
      20120903-20120904
  • [Presentation] Infrared monitoring of reactions in photosystem II2012

    • Author(s)
      Takumi Noguchi
    • Organizer
      Gordon Research Conference: Photosynthesis
    • Place of Presentation
      Davidson College, Davidson, NC, USA
    • Year and Date
      20120708-13
  • [Presentation] 緑色硫黄細菌の一次電子供与体P840の周辺構造の部位特的変異導入による改変2012

    • Author(s)
      浅井智広、佐野裕子、野口巧、大岡宏造
    • Organizer
      光合成色素系と反応中心に関するセミナー
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      20120630-20120701
  • [Presentation] 緑色硫黄細菌の光合成反応中心の部位特異的変異体:一次電子供与体 P840周辺の水素結合構造の改変を例として2012

    • Author(s)
      浅井智広、佐野裕子、野口巧、大岡 宏造
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20120601-20120602
  • [Presentation] 光化学系IIと金ナノ粒子の結合による人工光合成ナノデバイスの開発2012

    • Author(s)
      河原弘典、鞆達也、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20120601-20120602
  • [Presentation] 光合成酸素発生の中間状態遷移におけるNH4+阻害のメカニズム2012

    • Author(s)
      小林聖、津野将弥、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20120601-20120602
  • [Presentation] 光化学系IIにおけるキノン電子受容体の酸化還元電位制御機構2012

    • Author(s)
      芦沢竜壮、岩佐拓也、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20120601-20120602
  • [Presentation] 光合成酸素発生マンガンクラスターに配位する水分子の構造と反応2012

    • Author(s)
      大田該、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20120601-02
  • [Presentation] 光合成酸素発生系における表在性タンパク質の機能発現機構のFTIR解析2012

    • Author(s)
      宇野千尋、井戸邦夫、垣内秀介、西村大志、佐藤文彦、伊福健太郎、野口巧
    • Organizer
      日本光合成学会年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学
    • Year and Date
      20120601-02
  • [Presentation] 酸素発生系における表在性蛋白質の相互作用と機能発現機構:赤外分光法による解析

    • Author(s)
      宇野千尋、鈴木博行、長尾遼、鞆達也、野口巧
    • Organizer
      生物物理学会中部支部講演会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
  • [Book] π系生体ナノ電極における光合成電子移動反応の分子制御機構、「高次π空間の創発と機能開発」2013

    • Author(s)
      野口巧
    • Total Pages
      229-232
    • Publisher
      シーエムシー出版、東京

URL: 

Published: 2014-07-24  

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