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2009 Fiscal Year Annual Research Report

ロドプシン群の構造と機能分化

Research Project

Project/Area Number 21370070
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

神山 勉  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (30170210)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 村上 縁  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助教 (20324387)
井原 邦夫  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教 (90223297)
岩佐 達郎  室蘭工業大学, 工学部, 教授 (00133926)
Keywordsバクテリオロドプシン / アーキロドプシン / イカロドプシン / X線結晶構造解析 / イオンポンプ / Gタンパク質共役レセプター / ハロロドプシン / レチナールタンパク質
Research Abstract

(1)好アルカリ性好塩菌(N.pharaonis)のハロロドプシン(pHR)の結晶構造を2.0オングストロームの分解能で決定した。
(2)タコ・ロドプシンの結晶化に適したタンパク質の精製法の開発研究を行った。
(3)光駆動プロトンポンプの光反応中間体(M中間体)の構造のpH依存性を調べ、プロトン放出基の実態を明らかにした。
(4)視物質イカロドプシンのバソ中間体の構造を決定した。
(5)phRの構造から、塩素イオンの取り込みを制御する構造が見つかった。それから、塩素イオン濃度が青一紫の遷移スペクトルのKm値である1.7mMより十分濃度の高いLB培地中で培養している大腸菌でphRを発現させた時に、なぜ塩素イオンを結合していないフォームになるのか?が推論でき、実際に取り込み制御を行うB-Cループの構造を欠失したphRを発現させた所、塩素イオンを結合しているフォームになる事が確認できた。

  • Research Products

    (23 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (12 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Crystal structure of the light-driven chloride pump halorhodopsin from Natronomonas pharaonis2010

    • Author(s)
      T.Kouyama, M.Murakami
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 396 Pages: 564-579

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Spectroscopic studies of a sensory rhodopsin I homologue from the archaeon Haloarcula vallismortis.2010

    • Author(s)
      Yagasaki J, Suzuki D, Ihara K, Inoue K, Kikukawa T, Sakai M, Fujii M, Homma M, Kandori H, Sudo Y.
    • Journal Title

      Biochemistry.

      Volume: 49 Pages: 1183-90

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Halorubrum chaoviator sp.nov., a haloarchaeon isolated from sea salt in Baja California, Mexico, Western Australia and Naxos, Greece.2010

    • Author(s)
      Mancinelli RL, Landheim R, Sanchez-Porro C, Dornmayr-Pfaffenhuemer M, Gruber C, Legat A, Ventosa A, Radax C, Ihara K, White MR, Stan-Lotter H.
    • Journal Title

      Int J Syst Evol Microbiol.

      Volume: 59 Pages: 1908-13

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] ラマン分光法による磁性細菌のマグネタイト合成過程の研究2009

    • Author(s)
      渡辺真吾、山中正春、酒井彰、澤田研、岩佐達郎
    • Journal Title

      日本金属学会誌

      Volume: 73 Pages: 334-339

  • [Journal Article] Structure of squid rhodopsin2009

    • Author(s)
      Murakami M, Kouyama T
    • Journal Title

      Spring-8 Research Frontiers

      Volume: 2008 Pages: 30-31

  • [Journal Article] Crystal structures of different substates of bacteriorhodopsin's M Intermediate at various pH levels2009

    • Author(s)
      Yamamoto M, Hayakawa N, Murakami M, Kouyama T
    • Journal Title

      J.Mol.Biol.

      Volume: 393 Pages: 559-573

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Gene cloning and localization of G-proteins in the olfactory and vomeronasal epithelium of the Japanese newt, Cynops pyrrohogaster2009

    • Author(s)
      M.Takashima, K.Sawada, T.Iwasa
    • Journal Title

      Jpn.J.Taste Smell Res.

      Volume: 16 Pages: 533-536

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Modification of the newt electro-olfactograms by lipocalon2009

    • Author(s)
      Y.Noumi, T.Takahashi, K.Sawada, T.Iwasa, T.Nakamura
    • Journal Title

      Jpn.J.Taste Smell Res.

      Volume: 16 Pages: 545-548

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A ferromagnetic resonance study of iron complexes as biologically synthesized in magnetic bacteria2009

    • Author(s)
      S.Watanabe, S.Akutagawa, K.Sawada, T.Iwasa, Y.Shimoyama
    • Journal Title

      Mater.Trans.

      Volume: 50 Pages: 2187-2191

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Antibacterial activities and effects on the human skin cell by electrolytic ally coloured anodic oxide coating aluminum2009

    • Author(s)
      M.Yuguchi, T.Iwasa, T.Momono
    • Journal Title

      Bokin Bobai

      Volume: 37 Pages: 9-14

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] イカロドプシン光反応初期中間体のX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本薬学会第130年回
    • Place of Presentation
      岡山
    • Year and Date
      20100328-20100330
  • [Presentation] イカロドプシンの光化学反応:バソ中間体の構造解析から何がわかるか2010

    • Author(s)
      村上緑
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎(招待講演)
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] 古細菌の光駆動イオンポンプ:反応中間体の構造解析からなにが分かるか2010

    • Author(s)
      神山勉
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎(招待講演)
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] Crystallization of octopus rhodopsin2010

    • Author(s)
      J.Zhang, S.Kanada, M.Tsuda, T.Iwasa, T.Gotoh, M.Murakami, T.Kouyama
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎(招待講演)
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] Natronomonas pharaonis由来光駆動塩素イオンポンプhalorhodpsin光反応中間体のX線結晶構造解析2010

    • Author(s)
      金田創運, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      分子研研究会「拡がるロドプシンの仲間から"何がわかるか"何をもたらすか"」
    • Place of Presentation
      岡崎(招待講演)
    • Year and Date
      20100323-20100324
  • [Presentation] X-ray analysis of the primary photochemical reaction of squid rhodopsin2010

    • Author(s)
      M.Murakami
    • Organizer
      International Symposium"Fifty Years of Biophysics Research at Nagoya University
    • Place of Presentation
      Nagoya(招待講演)
    • Year and Date
      20100312-20100314
  • [Presentation] Crystallization of octopus rhodopsin2010

    • Author(s)
      J.Zhang, S.Kanada, M.Tsuda, T.Iwasa, T.Gotoh, M.Murakami, T.Kouyama
    • Organizer
      International Symposium"Fifty Years of Biophysics Research at Nagoya University"
    • Place of Presentation
      Nagoya
    • Year and Date
      20100312-20100314
  • [Presentation] Natronomonas pharaonis由来光駆動塩素イオンポンプハロロドプシンの結晶構造解析2009

    • Author(s)
      金田創運, 竹口優, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] タコロドプシンの結晶化2009

    • Author(s)
      張進, 金田創運, 津田基之, 岩佐達郎, 村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] バクテリオロドプシンミュータントL93Aの長寿命化した光反応中間体の結晶学的研究2009

    • Author(s)
      山崎芳和, 樋掛雅則, 村上緑, 井原邦夫, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] バクテリオロドプシンのM中間体の結晶構造のpH依存性2009

    • Author(s)
      神山勉, 山本昌孝, 早川直紀, 村上緑
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Presentation] イカロドプシンバソ中間体のX線結晶構造解析2009

    • Author(s)
      村上緑, 神山勉
    • Organizer
      日本生物物理学会第48回年会
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      20091030-20091101
  • [Remarks]

    • URL

      http://bio.phys.nagoya-u.ac.jp

URL: 

Published: 2012-07-19  

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