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2009 Fiscal Year Annual Research Report

ライブクレムを基盤とする分子特異的ナノイメージング法の開発

Research Project

Project/Area Number 21370094
Research InstitutionNational Institute of Information and Communications Technology

Principal Investigator

原口 徳子  National Institute of Information and Communications Technology, 上席研究員 (20359079)

Keywords細胞・組織 / 遺伝子 / 蛋白質 / 生体分子 / バイオイメージング
Research Abstract

ライブクレム(Live CLEM)とは、蛍光顕微鏡を用いて特定分子を観察した後に、同じサンプルを電子顕微鏡で観察する方法であり、生きた細胞の蛍光観察から得られた分子ダイナミクスと、電子顕微鏡観察から得られたナノメートルオーダーの超構造解析を同一試料で比較することにより分子特異的なナノイメージングが達成できる。本研究課題は、これまで独自に開発してきたライブクレム法をさらに発展させ、より汎用性が高く・空間精度の高いナノイメージング法を開発することを目的とする。具体的な目標としては、1)これまで接着細胞に限定されていた適応範囲をより広い生物試料に広げることと、2)蛍光像と電顕像の位置合わせの精度を向上させることである。本年度は、項目1)として、これまでライブクレム観察が不可能だった浮遊性細胞、分裂酵母に対して、細胞が動かないように固定(immobilize)していた方法に工夫を加えることによって方法の最適化を行い、分裂酵母に適応できるライブクレム法を確立した。遺伝学的解析が容易な分裂酵母での成功は、分子レベルの変化をナノレベルでの細胞構造変化に関連付けることが可能となるため、生命現象の理解のために特に有用である。項目2)では、蛍光顕微鏡像と電子顕微鏡像の位置合わせの精度を向上させることを試みた。位置合わせの指標として細胞内に人工的なプラスティックビーズ(直径1マイクロメートル程度)を挿入し、その位置情報を元に、蛍光像と電顕像の位置決めを行い、これによって位置合わせが容易になることを確認した。この方法は、入れたビーズによって細胞機能が変化する可能性があるのが難点ではあるが、位置合わせの精度を上げることには有効であることが明らかになった。

  • Research Products

    (44 results)

All 2010 2009 Other

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (31 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Alignment and recognition of homologous chromosomes in meiosis2010

    • Author(s)
      Ding, D.-Q.
    • Journal Title

      The FEBS Journal 277

      Pages: 565-570

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Artificial induction of autophagy around polystyrene beads in nonphagocytic cells2010

    • Author(s)
      Kobayashi, S.
    • Journal Title

      Autophagy 6

      Pages: 36-45

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] テロメアとテロメア合成酵素によって染色体が保護される仕組みの発見2010

    • Author(s)
      平岡泰
    • Journal Title

      蛋白質・核酸・酵素 55

      Pages: 104-107

  • [Journal Article] A Locally-Induced Increase in Intracellular Ca2+ Propagates Cell-to-Cell in the Presence of Plasma Membrane Ca2+ ATPase Inhibitors in Non-excitable Cells2009

    • Author(s)
      Nakano, T.
    • Journal Title

      FEBS Letters 583

      Pages: 3593-3599

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Membrane proteins Bqt3 and -4 anchor telomeres to the nuclear envelope to ensure chromosomal bouquet formation2009

    • Author(s)
      Chikashige, Y.
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology 187

      Pages: 413-427

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Two Distinct Repeat Sequences of Nup98 Nucleoporins Characterize Dual Nuclei in the Binucleated Ciliate Tetrahymena2009

    • Author(s)
      Iwamoto, M.
    • Journal Title

      Current Biology 19

      Pages: 843-847

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Codon usage bias is correlated with gene expression levels in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe.2009

    • Author(s)
      Hiraoka, Y.
    • Journal Title

      Genes to Cells 14

      Pages: 499-509

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 自己組織体としての細胞核2009

    • Author(s)
      小林昇平
    • Journal Title

      自己組織化ハンドブック

      Pages: 306-312

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 核膜バリアの意味:その破綻によって見えてきた核膜孔複合体の機能2009

    • Author(s)
      岩本政明
    • Journal Title

      実験医学 増刊 細胞核-遺伝情報制御と疾患 27

      Pages: 2759-2766

  • [Journal Article] ライブからライブCLEMへ-蛍光顕微鏡法と電子顕微鏡法との融合-2009

    • Author(s)
      原口徳子
    • Journal Title

      蛋白質・核酸・酵素 54

      Pages: 1784-1791

  • [Presentation] Interaction of ARIP4 complex with sumoylated Ad4BP/SF-12010

    • Author(s)
      Tsuchiya, M.
    • Organizer
      Keystone Symposia on Molecular and Cellular Biology
    • Place of Presentation
      Keystone Resort, USA
    • Year and Date
      2010-03-24
  • [Presentation] 減数分裂期で相同染色体が相互認識する仕組み2010

    • Author(s)
      丁大橋
    • Organizer
      第27回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      御殿場高原時之栖、静岡県
    • Year and Date
      2010-01-22
  • [Presentation] 繊毛虫テトラヒメナの核分化と核膜孔複合体との関係2010

    • Author(s)
      武内史英
    • Organizer
      第27回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      御殿場高原時之栖、静岡県
    • Year and Date
      2010-01-21
  • [Presentation] ブーケ配向形成因子S.japonicus Bqt1-Bqt2複合体の精製および機能解析2010

    • Author(s)
      市川雄一
    • Organizer
      第27回染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      御殿場高原時之栖、静岡県
    • Year and Date
      2010-01-21
  • [Presentation] 分裂酵母遺伝子のコドン使用頻度は遺伝子発現レベルに依存する2010

    • Author(s)
      平岡泰
    • Organizer
      定量生物学の会 第二回年会
    • Place of Presentation
      大阪大学、大阪府
    • Year and Date
      2010-01-10
  • [Presentation] 人工染色体のセントロメア機能低下に伴って形成される微小核の細胞内動態と核膜構造2009

    • Author(s)
      原口徳子,荒神尚子,小坂田裕子,糀谷知子,小林昇平,中野めぐみ,舛本寛, V. Larionov, W. C. Earnshaw,平岡泰
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] テトラヒメナのNup98リピート領域に結合する核輸送関連因子の探索2009

    • Author(s)
      岩本政明
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] 脂肪分解過程で出現する微小脂肪滴および脂肪滴表面タンパク質の生理的意義2009

    • Author(s)
      橋本健志
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] 分裂酵母相同染色体対合におけるsme2ホットスポットの解析2009

    • Author(s)
      丁大橋
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] Movements of chromosomes for finding their homologous partners in meiosis2009

    • Author(s)
      平岡泰
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-10
  • [Presentation] 脂質コーティングビーズのエンドソーム脱出過程の直接的可視化2009

    • Author(s)
      小林昇平
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] ブーケ配向形成因子S.japonicus Bqt1-Bqt2複合体の大量精製および生化学的解析2009

    • Author(s)
      市川雄一
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2009-12-09
  • [Presentation] テトラヒメナの核選択的ヌクレオポリンNup98は核輸送のバリアとして働く2009

    • Author(s)
      岩本政明
    • Organizer
      第42回原生動物学会
    • Place of Presentation
      石巻専修大学、宮城県
    • Year and Date
      2009-11-01
  • [Presentation] Large-scale localization of protein components of nuclear structures in fission yeast2009

    • Author(s)
      Hiraoka, Y.
    • Organizer
      The 5th International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      National Olympics Memorial Youth Center, Japan
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] The SUN domain protein links telomeres with cytoplasmic microtubules to induce meiotic telomere clustering2009

    • Author(s)
      Yoshida, M.
    • Organizer
      The 5th International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      National Olympics Memorial Youth Center, Japan
    • Year and Date
      2009-10-27
  • [Presentation] Nuclear translocation of RanGAP1 causes cytoplasmic diffusion of nuclear proteins in fission yeast meiosis2009

    • Author(s)
      Asakawa, H.
    • Organizer
      The 5th International Fission Yeast Meeting
    • Place of Presentation
      National Olympics Memorial Youth Center, Japan
    • Year and Date
      2009-10-27
  • [Presentation] Live CLEM : A new approach for observing molecular dynamics in high resolution2009

    • Author(s)
      Haraguchi, T.
    • Organizer
      6th International Symposium on Electron Microscopy in Medicine and Biology 2009
    • Place of Presentation
      Centennial Hall, Kobe University, Japan
    • Year and Date
      2009-09-17
  • [Presentation] 細胞の情報戦略を知る2009

    • Author(s)
      原口徳子
    • Organizer
      国際フロンティア産業メッセ2009
    • Place of Presentation
      神戸国際展示場、兵庫県
    • Year and Date
      2009-09-03
  • [Presentation] スペクトルイメージング2009

    • Author(s)
      原口徳子
    • Organizer
      第13回細胞生物学ワークショップ
    • Place of Presentation
      未来ICT研究センター、兵庫県
    • Year and Date
      2009-08-19
  • [Presentation] 生細胞イメージング2009

    • Author(s)
      原口徳子
    • Organizer
      第13回細胞生物学ワークショップ
    • Place of Presentation
      未来ICT研究センター、兵庫県
    • Year and Date
      2009-08-19
  • [Presentation] Live CLEM法2009

    • Author(s)
      原口徳子、荒神尚子、糀谷知子、小坂田裕子
    • Organizer
      第34回組織細胞化学講習会
    • Place of Presentation
      徳島大学、徳島県
    • Year and Date
      2009-07-30
  • [Presentation] Nup98 nucleoporins bearing different types of repeat sequence characterize nucleus-specific nuclear pore complexes in Tetrahymena thermophila2009

    • Author(s)
      Iwamoto, M.
    • Organizer
      FASEB Summer Research Conferences "Ciliate Molecular Biology"
    • Place of Presentation
      Vermont Academy, USA
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] 脂質コーティングビーズのエンドソーム脱出過程の直接的可視化2009

    • Author(s)
      小林昇平
    • Organizer
      遺伝子・デリバリー研究会 第9回 シンポジウム
    • Place of Presentation
      大阪大学コンベンションセンター、大阪府
    • Year and Date
      2009-07-11
  • [Presentation] 遺伝子発現・収納を制御するセルバリアとしての核膜孔蛋白質Nup982009

    • Author(s)
      原口徳子
    • Organizer
      第8回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      ラフォーレ修善寺、静岡県
    • Year and Date
      2009-06-19
  • [Presentation] Dynamics and ultrastructure of the nuclear pore complexes during nuclear differentiation in Tetrahymena thermophila2009

    • Author(s)
      Bunai, F.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Nup98 nucleoporins bearing different types of repeat sequence are involved in the nucleus-selective transport in the ciliate Tetrahymana2009

    • Author(s)
      Iwamoto, M.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Nuclear translocation of RanGAP1 causes cytoplasmic diffusion of nuclear proteins in fission yeast meiosis2009

    • Author(s)
      Asakawa, H.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] 減数分裂前期における細胞質微小管を介したテロメア集合2009

    • Author(s)
      勝山聡
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Structures and dynamics of the nuclear pore complex contributing to macronuclear and micronuclear functions in the Cililate2009

    • Author(s)
      Haraguchi, T.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Membrane proteins Bqt3 and Bqt4 anchor telomeres to the nuclear envelope to ensure chromosomal bouquet formation2009

    • Author(s)
      Chikashige, Y.
    • Organizer
      第61回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場、愛知県
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Live CLEM : A New Approach for Observing Molecular Dynamics in High Resolution2009

    • Author(s)
      T. Haraguchi, T. Koujin, T. Kojidani, H. Osakada, S. Kobayashi, M. Iwamoto, F. Bunai, H. Asakawa, Y. Chikashige, Y. Hiraoka
    • Organizer
      The 9th NIBB-EMBL Symposium "Functional Imaging from Atoms to Organisms"
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center, Japan
    • Year and Date
      2009-04-20
  • [Book] 組織細胞化学2009(P149-157)2009

    • Author(s)
      原口徳子
    • Total Pages
      236
    • Publisher
      学際企画
  • [Remarks]

    • URL

      http://www-karc.nict.go.jp/w131103/CellMagic/index.html

  • [Patent(Industrial Property Rights)] Vrk1蛋白質抗体とその製造方法、抗原、検知方法2009

    • Inventor(s)
      原口徳子、荒神尚子、平岡泰
    • Industrial Property Rights Holder
      独立行政法人情報通信研究機構
    • Industrial Property Number
      特許権、特願2009-155028
    • Filing Date
      2009-06-30

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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