2011 Fiscal Year Annual Research Report
琉球諸島ヒト集団の網羅的ゲノム多様性解析?系統・形態・環境適応の解明に向けて?
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21370108
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| Research Institution | Kitasato University |
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Principal Investigator |
太田 博樹 北里大学, 医学部, 准教授 (40401228)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
木村 亮介 琉球大学, 亜熱帯島嶼科学超域研究推進機構, 特命准教授 (00453712)
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| Keywords | 琉球諸島 / 先島諸島 / 日本人の起源 / 炎症性腸疾患 / 歯牙形質 / STR多型 / アイヌ / 縄文人 |
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| Research Abstract |
【背景】石田肇(連携研究者)らの琉球諸島における歯冠形質にもとづく系統解析は、沖縄本島および本州日本が比較的近縁であるのに対し、先島諸島(宮古島と石垣島)は台湾原住民を介して沖縄本島と近縁で、アイヌにより近縁であることを示した。
【目的】琉球諸島と本州日本(特に北部九州)のヒトの系統関係と形態的・生理的環境適応を明らかにする。
【平成23年度の成果】(1)沖縄における炎症性腸疾患原因変異の調査:炎症性腸疾患の1つであるクローン病の原因変異の1つは、人類進化の歴史の中で単に中立変異として残ってきただけでは無く、近傍の変異が自然選択を受けてきたことに連鎖して人類集団中に維持されてきた可能性を示した(Nakagome et al.2012 ; Nakagome and Oota 2012)。これを受けおこなった調査の結果、昨年既に報告したクローン病の別の原因変異の頻度(Nakagome et al.2010)が沖縄と北部九州で有意に異なっていることを明らかにした(Nakagome et al.in preparation)。
(2)沖縄本島・先島諸島由来試料を用いた歯冠形質決定候補遺伝子のSNP解析:昨年既に報告したアジアで広く見られるシャベル型切歯と強く関連している遺伝子の一塩基置換(Kimura et al.2010)が、第2大臼歯の形態小変異とも有意に関連していることを明らかにした(Park et al.in press)。
(3)水田農耕の北部九州起源の検証:弥生時代に大陸から渡来したと考えられている水田農耕の拡散を日本列島全国13カ所の水田周辺から採取した野生メダカの分子系統を解析することで検証を行い、メダカの拡散が北部九州から起こった可能性が高いことを明らかにした(Katsumura et al.2012)。
(4)アイヌ-沖縄同系論の検証:琉球諸島(沖縄本島、宮古島、石垣島)の住民とアイヌの人々の常染色体およびY染色体のSTR多型を分析した結果、男性の系統で琉球諸島住民とアイヌの間で強い系統的な近縁性の証拠が得られた(Koganebuchi et al.in press)。
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Research Products
(22 results)
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[Journal Article] Apopulation genetic study on the relationship between medaka fish and wet-rice-cultivation spreads over the Japanese archipelago2012
Author(s)
T.Katsumura, S.Oda, K.Tsukamoto, Y.Sekiya, T.Yamashita, M.Aso, M.Hata, M.Nonaka, S.Mano, H.Ishida, H.Mitani, S.Kawamura, H.Oota
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Journal Title
A nthropological Science
Volume: 120
Pages: 81-89
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Effects of an Asian-specific nonsynonymous EDAR variant on multiple dental traits
Author(s)
J-H.Park, T.Yamaguchi, C.Watanabe, A.Kawaguchi, K.Haneji, M.Takeda, Y-I.Kim, Y.Tomoyasu, M.Watanabe, H.Oota, T.Hanihara, H.Ishida, K.Maki, S-B.Park, R.Kimura
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Journal Title
Journal of Human Genetics
Volume: (印刷中)
Peer Reviewed
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[Presentation] Population specific susceptibility to Crohn's disease and signals of natural selection on standing variation2011
Author(s)
S.Nakagome, S.Mano, L.Kozlowski, J.M.Bujnicki, H.Shibata, Y.Fukumaki, J.R.Kidd, K.K.Kidd, S.Kawamura, H Oota
Organizer
The 12th ICHG/The 61th Annual Meeting ofThe American Society of Human Genetics
Place of Presentation
Montreal, Canada
Year and Date
20111011-20111015
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