分子マーカーによるサケの系群識別と海洋生活史の究明

2011 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21380115
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 阿部 周一 北海道大学, 大学院・水産科学研究院, 教授 (80125278)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 佐藤 俊平 (独)水産総合研究センター, 北海道区水産研究所, 研究員 (70425461)
• Keywords: サケ類 / DNAマーカー / SNP / 遺伝構造 / 系群識別

Research Abstract

1.これまでに200座近いサケの一塩基多型(SNP)マーカーを連携研究者とともに開発し、このうち96座が遺伝分析に応用できた。これらのSNPマーカーを用いた環太平洋サケ114集団の分析から、ミトコンドリアDNA(mtDNA)やマイクロサテライトDNA(msDNA)マーカーを用いた分析よりも詳細な遺伝構造がとくに北米において明らかになった。
2.分析集団数が十分ではなかった日本のサケ集団について、新規取集を加えた41集団を53座のSNPマーカーで分析したところ、北海道5地域、本州太平洋側と本州日本海側の集団間に有意な遺伝的分化が認められた。遺伝的分化は、北海道と本州の集団の間で大きかった。これらから、日本のサケには遺伝的に異なる7つの地域集団の存在が示唆された。また、一部の河川で産卵遡上時期が異なる群の間に遺伝的分化が認められたことから、サケの遺伝構造が地理的だけでなく時間的な影響も受けていることが示唆された。
3.この3年間で作成した環太平洋サケ146集団のSNP基準群の系群識別精度は、従来のmtDNAやmsDNAマーカーより高かった。2009年7-8月にベーリング海北部、中部、南部、および西部で採捕されたサケ未成魚について、SNPマーカー32座を使用し遺伝的系群識別を実施したところ、日本系サケは中部および北部ベーリング海に、ロシア系サケは南部および西部ベーリング海に優占することが分かった。一方、北米系サケは、アジア系サケと比ベベーリング海全域で少なかった。以上より、日本系サケは従来考えられていたよりも北の海域(北緯60°以北)にも回遊・分布することが示唆された。

Research Products

• [Journal Article] Genetic differentiation between hatchery and wild collections of masu salmon (Oncorhynchus masou) inferred from mitochondrial and microsatellite DNA analyses (2012)
  • Author(s): Yu, J.-N., Azuma, N., Abe, S.
  • Journal Title: Environmental Biology of Fishes Volume: 94 Pages: 259-271
  • DOI: 10.1007/s10641-011-9869-0
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Proteomic analysis of inviable salmonid hybrids between masu salmon Oncorhynchus mason female and rainbow trout O. mykiss male during the early embryogenesis (2011)
  • Author(s): Zheng, L., Tanaka, H., Abe, S.
  • Journal Title: Journal of Fish Biology Volume: 78 Pages: 1508-1528
  • DOI: 10.1111/j.1095-8649.2011.02958.x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Single nucleotide polymorphisms across a species' range : implication for conservation studies of Pacific salmon (2011)
  • Author(s): Seeb, L.W., Templin, W.D., Sato, S., Abe, S., Warheit, K., Park, J.Y., Seeb, J.E.
  • Journal Title: Molecular Ecology Resources Volume: 11(Supplement 1) Pages: 195-217
  • DOI: 10.1111/j.1755-0998.2010.02966.x
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Microsatellite identification of Canadian sockeye salmon rearing in the Bering Sea (2011)
  • Author(s): Beacham, T.D., Candy, J.R., Porszt, E., Sato, S., Urawa, S.
  • Journal Title: Transactions of the American Fisheries Society Volume: 140 Pages: 296-306
  • DOI: 10.1080/00028487.2011.567643
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Genetic structure of Japanese pink salmon populations inferred from nucleotide sequence analysis of mitochondrial DNA (2012)
  • Author(s): Sato, S., S.Urawa
  • Organizer: 25th Northwest Pink & Chum Salmon Workshop
  • Place of Presentation: Centennial Hall (Alaska, USA)
  • Year and Date: 2012-02-13
• [Presentation] サケ類のゲノム生物学-育種と資源管理へ向けて- (2011)
  • Author(s): 阿部周一
  • Organizer: 第5回サケ学研究会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌市)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-12-18
• [Presentation] 日本系サケ個体群の遺伝的評価:現状と今後の課題 (2011)
  • Author(s): 佐藤俊平
  • Organizer: 第5回サケ学研究会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌市)(招待講演)
  • Year and Date: 2011-12-17
• [Presentation] Genetic differentiation between collections of hatchery and wild masu salmon inferred from mitochondrial and microsatellite DNA analysis (2011)
  • Author(s): Yu J.-N., N.Azuma, Abe, S.
  • Organizer: NPAFC International Workshop
  • Place of Presentation: Vancouver Island Conference Centre(カナダ)
  • Year and Date: 2011-10-31
• [Presentation] Influence of fish size and abundance on lipid contents of immature chum salmon (Oncorhynchus keta) in the central Bering Sea (2011)
  • Author(s): Kaga, T., Sato, S., Azumaya, T., Dabvis, N.D., Fukuwaka, M.
  • Organizer: NPAFC International Workshop
  • Place of Presentation: Vancouver Island Conference Centre(カナダ)
  • Year and Date: 2011-10-31
• [Presentation] Status of hatchery-origin chum salmon in the Bering Sea deduced from otolith mark recoveries (2011)
  • Author(s): Urawa, S., Sato, S., Takahashi, M.
  • Organizer: NPAFC International Workshop
  • Place of Presentation: Vancouver Island Conference Centre(カナダ)
  • Year and Date: 2011-10-30
• [Presentation] Improved genetic stock identification of chum salmon through the PacSNP collaboration (2011)
  • Author(s): Templin, W.D., Habicht, C., Seeb, L.W., Sato, S., Abe, S., Warheit, K., Park, J.Y., Seek J.E.
  • Organizer: NPAFC International Workshop
  • Place of Presentation: Vancouver Island Conference Centre(カナダ)
  • Year and Date: 2011-10-30
• [Presentation] Stock-specific distribution of immature chum salmon in the summer Bering Sea inferred from SNP markers (2011)
  • Author(s): Sato, S., Kato, M., Morita, K., Urawa, S.
  • Organizer: NPAFC International Workshop
  • Place of Presentation: Vancouver Island Conference Centre(カナダ)
  • Year and Date: 2011-10-30
• [Presentation] Decreased genetic diversity in hatchery broodstocks of masu salmon inferred from DNA marker analysis (2011)
  • Author(s): Yu J.-N., Azuma, N., Abe, S.
  • Organizer: 平成23年度日本水産学会秋季大会
  • Place of Presentation: 長崎大学(長崎市)
  • Year and Date: 2011-09-30
• [Presentation] サケ類雑種の分子細胞遺伝学的研究 (2011)
  • Author(s): 杉本貴城・阿部周一
  • Organizer: 平成23年度日本水産学会秋季大会
  • Place of Presentation: 長崎大学(長崎市)
  • Year and Date: 2011-09-30
• [Presentation] Winter distribution and trophic status of Pacific salmon in the north Pacific ocean under changing climate (2011)
  • Author(s): Urawa, S., Kaga, T., Sato, S., Fukuwaka, M., Azumaya, T.
  • Organizer: アメリカ水産学会年次会議
  • Place of Presentation: Washington State Convention Center (seattle,米国)
  • Year and Date: 2011-09-07
• [Presentation] Proteomics on the viability and fertility in salmonid hybrids (2011)
  • Author(s): Zheng, L., Senda, Y., Tanaka, H., Abe, S.
  • Organizer: International Symposium on the Diversification in Inland Finfish Aquaculture
  • Place of Presentation: Pisek Malt-House(チェコ共和国)
  • Year and Date: 2011-05-17