2012 Fiscal Year Annual Research Report
魚類における生殖制御脳内ネットワークの機能的ゲノミクス解析
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21380117
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| Research Institution | Utsunomiya University |
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Principal Investigator |
飯郷 雅之 宇都宮大学, 農学部, 准教授 (10232109)
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| Project Period (FY) |
2009-04-01 – 2013-03-31
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| Keywords | 季節繁殖 / 脳内ネットワーク / 機能的ゲノミクス解析 / 生殖制御 / 水産学的脳科学 / 次世代シーケンサー |
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| Research Abstract |
①アユゲノムプロジェクト：次世代シーケンサーによりアユ全ゲノムDNAの塩基配列を決定し，データベース化した．次世代シーケンサー（Illumina HiSeq2000）により，100bp×2 ペアエンドリードにてシーケンスを行い，3825万リード，38.6Gbの塩基配列をABySSによりアッセンブルし（Kmer=51），156,604コンティグ（>200bp），411.9Mbのシーケンスを得た（N50=5,800bp）．
②長日繁殖魚（メダカ），および短日繁殖魚（サクラマス）の脳内において日長変化に応じて発現量の変化する遺伝子（季節繁殖制御遺伝子）のDNAマイクロアレイによる網羅的同定：昨年度に引き続き，長日条件下で飼育した魚と短日条件下で飼育した魚を対象として，DNAマイクロアレイを用いた網羅的遺伝子発現解析（トランスクリプトーム解析）を行い，日長変化の前後で時間経過を追って発現が量的・質的に変化する遺伝子群を同定することを試みた．
③新規脳内光受容体の同定：季節繁殖に関与することが予測される光受容体分子を次世代シーケンサーにより解析したゲノム DNAおよびmRNAの塩基配列データベースから同定し，in situハイブリダイゼーションや免疫組織化学により局在同定を試み，脳内に新規光受容部位を発見した．この部位が光周性制御の中枢であると考えられた．
④Dio2, TSH, KISS1，GPR54のcDNAクローニング：昨年度に引き続き，季節繁殖制御の中枢遺伝子であるDio2，Dio2の制御因子であるTSH，生殖制御中枢因子であるkisspeptinをコードするKISS2，ならびにその受容体であるGPR54のcDNAクローニングを行った．
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| Current Status of Research Progress |
Reason
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
24年度が最終年度であるため、記入しない。
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