• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2011 Fiscal Year Annual Research Report

触媒的タンパク質機能欠失法の開拓

Research Project

Project/Area Number 21390031
Research InstitutionThe University of Tokushima

Principal Investigator

大高 章  徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 教授 (20201973)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 重永 章  徳島大学, 大学院・ヘルスバイオサイエンス研究部, 助教 (10423394)
Keywordsタンパク質 / ペプチド合成 / ペプチド結合切断 / チオエステル / タンパク濃縮 / 刺激応答型アミノ酸
Research Abstract

生命現象の理解や創薬において、タンパク質機能の解明は必要不可欠な検討事項である。本研究では、タンパク質の選択的かつ触媒的分解を通じた新規タンパク質機能欠失法の開拓を研究目的とした。本年度は標的タンパク質分子を釣り上げるため(濃縮)に必要な釣竿分子のデザイン合成と実際のタンパク質濃縮への実験を検討した。さらに、特定タンパク質をリガンド特異的に標識する新規化学的手法を開発した。
標的タンパク質同定にいたる一連の実験手順として、次の操作を考えた。(1)生理活性物質であるベイト分子と標的タンパク質間の結合形成、この際、ベイト分子には光親和性標識部位とアルキン部位を導入し、ベイト-標的タンパク質複合体形成後、光照射を行いベイト-標的タンパク質間に共有結合を形成させる。(2)ベイト-標的タンパク質複合体のアルキン部位とLinkerのアジド部位でクリック反応を行い、ビオチン化Linker-ベイト-標的タンパク質複合体を形成させる。(3)この複合体をビオチンカラムに固定化、(4)Linker部位の化学選択的切断を行い、次いでTag分子による化学選択的修飾を行う。Tagを指標とした標的タンパク質同定を行う。以上の計画の下、下記の検討を行った。
Cleavable Linkerの合成とタンパク質濃縮への展開
温和かつ化学選択的切断が可能な刺激応答型アミノ酸を利用したアミド結合切断デバイスを開発し、これをCleavable Linkerの基盤構造とした。また、またアミド結合切断後に生じる官能基については、アルデヒド類によって選択的な修飾が可能なオキシアミノ基を利用した。前年度までの研究を基盤とし、まずCeravable Linkerの化学合成を行った。モデルタンパク質としてエノラーゼを選択し、エノラーゼへのアルキンユニットの導入、Cleavable Linkerとのクリック反応、アビジンカラムによる濃縮、フッ素アニオンのよる濃縮操作を行い、当初の計画通り、タンパク質濃縮が可能であることを確認した。現在、効率性の向上について検討中である。またCleavable Linkerとは別に、タンパク質リガンド特異的にTag分子を導入できる機能性分子としてチオエステル等価体として機能するN-sulfanylethylanilideユニットを開発し、現在これを利用した標識化を進めている。

  • Research Products

    (38 results)

All 2012 2011

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (26 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Development of reduction-responsive amino acid that induces peptide bond cleavage in hypoxic cells2012

    • Author(s)
      Shigenaga, A.
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 13(in press)

    • DOI

      10.1002/cbic.201200141

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Caged ceramide which releases parent ceramide after UV-induced amide bond cleavage followed by intramolecular O-N acyl transfer2012

    • Author(s)
      Shigenaga, A.
    • Journal Title

      Peptide Science 2011

      Pages: 385-386

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Doubly-kinetically controlled proline ligation2012

    • Author(s)
      Ding, H.
    • Journal Title

      Peptide Science 2011

      Pages: 133-134

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-sulfanylethylanilide peptide : a peptide thioester equivalent which can directly participate in native chemical ligation2012

    • Author(s)
      Sato, K.
    • Journal Title

      Peptide Science 2011

      Pages: 13-14

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-Sulfanylethylanilide peptide as a crypto-thioester peptide2011

    • Author(s)
      Sato, K.; Shigenaga, A.; Tsuji, K.; Tsuda, S.; Sumikawa, Y.; Sakamoto, K.; Otaka, A
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 12 Pages: 1840-1844

    • DOI

      doi:10.1002/cbic.201100241

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and synthesis of caged ceramide : UV-responsive ceramide releasing system based on UV-induced amide bond cleavage followed by O-N acyl2011

    • Author(s)
      Shigenaga, A.
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 67 Pages: 3984-3990

    • DOI

      10.1016/j.tet.2011.04.048

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Application of N-C- or C-N-directed sequential native chemical ligation to the preparation of CXCL14 analogs and their biological evaluation2011

    • Author(s)
      Tsuji, K.
    • Journal Title

      Bioorg.Med.Chem.

      Volume: 19 Pages: 4014-4020

    • DOI

      10.1016/j.bmc.2011.05.018

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dual kinetically-controlled native chemical ligation using a combination of sulfanylproline and sulfanylethylanilide peptide2011

    • Author(s)
      Ding, H.
    • Journal Title

      Org.Lett.

      Volume: 13 Pages: 5588-5591

    • DOI

      10.1021/ol202316v

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of UV-responsive catch-and-reiease system of a cysteine protease model peptide2011

    • Author(s)
      Shigenaga, A.
    • Journal Title

      Tetrahedron

      Volume: 67 Pages: 8879-8886

    • DOI

      10.1016/j.tet.2011.09.062

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] N-sulfanylethylanilide peptide : a peptide thioester equivalent which can directly participate in native chemical ligation2011

    • Author(s)
      Sato, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the Twenty-Second American Peptide Symposium

      Pages: 72-73

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of CXCL14 and its derivatives utilizing C to N or N to C directive sequential NCL protocol2011

    • Author(s)
      Tsuji, K.
    • Journal Title

      Proceedings of the Twenty-Second American Peptide Symposium

      Pages: 74-75

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] フッ化物イオン応答型アミノ酸の開発と標的タンパク質精製ツールへの応用2012

    • Author(s)
      山本純
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] 4-チオプロリンを用いたNative chemical Ligation2012

    • Author(s)
      丁昊
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] リン酸化タンパク質の機能解明に向けたケージド非水解性リン酸化アミノ酸含有ペプチドの合成研究2012

    • Author(s)
      傅田将也
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] CXCL14・CXCL12デュアルアンタゴニストペプチドの創製2012

    • Author(s)
      粟飯原圭佑
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] 新規チオール応答型アミノ酸の合成とDNA放出システムへの展開2012

    • Author(s)
      戎野紘司
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] タンパク質化学合成を指向したN-アミノアシルN-直換アニリンリンカーの効率的合成法の開発2012

    • Author(s)
      坂本健
    • Organizer
      日本薬学会第132回年会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      2012-03-29
  • [Presentation] Native chemical ligation (NCL) without using peptide thioester2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      14th Peptide Forum
    • Place of Presentation
      鹿児島大学(鹿児島市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] Application of Stimulus-responsive Amino Acid to Traceable Linker for Efficient Enrichment and Specific Labeling of Target Proteins2011

    • Author(s)
      山本純
    • Organizer
      8th AFMC International Medicinal Chemistry Symposium
    • Place of Presentation
      京王プラザホテル(東京都)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] The First Accomplishment of Development of CXCL14 Antagonistic Peptide by Dimerization of CXCL14 Fragment2011

    • Author(s)
      辻耕平
    • Organizer
      8th AFMC International Medicinal chemistry Symposium
    • Place of Presentation
      京王プラザホテル(東京都)
    • Year and Date
      2011-11-29
  • [Presentation] AMP化タンパク質の機能解明を指向したペプチド性分子ツールの開発2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] CXCL14およびその誘導体の効率的合成法の開発と活性評価2011

    • Author(s)
      辻耕平
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] リン酸化タンパク質の機能解明に向けた紫外線応答型リン酸化アミノ酸誘導体の合成研究2011

    • Author(s)
      傅田将也
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] ペプチドチオエステル合成用アニリン型補助基への効率的アミノ酸導入法の開発2011

    • Author(s)
      坂本健
    • Organizer
      第50回日本薬学会・日本薬剤師会・日本病院薬剤師会中国四国支部学術大会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Year and Date
      2011-11-12
  • [Presentation] タンパク質AMP化の生理学的意義解明を指向した新規分子ツールの開発2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      第37回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島市)
    • Year and Date
      2011-11-07
  • [Presentation] 4-メルカプトプロリンを用いたペプチドフラグメント縮合法の開発2011

    • Author(s)
      丁昊
    • Organizer
      第37回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島市)
    • Year and Date
      2011-11-07
  • [Presentation] タンパク質化学合成を指向したワンポット4成分連続縮合法の開発2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      第37回反応と合成の進歩シンポジウム
    • Place of Presentation
      あわぎんホール(徳島市)
    • Year and Date
      2011-11-07
  • [Presentation] N-Sulfanylethylanilide peptide : a peptide thioester equivalent which can directly participate in native chemical ligation2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      第48回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-26
  • [Presentation] Caged ceramide which releases parent ceramide after UV-induced amide bond cleavage followed by intramolecular O-N acyl transfer2011

    • Author(s)
      重永章
    • Organizer
      第48回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンショーンセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-26
  • [Presentation] Double-kinetically controlled proline ligation2011

    • Author(s)
      丁昊
    • Organizer
      第48回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(札幌市)
    • Year and Date
      2011-09-26
  • [Presentation] Development of nucleocytoplasmic shuttle peptide using stimulus-responsive processing device2011

    • Author(s)
      大高章
    • Organizer
      日本生物物理学会第49回年会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(姫路市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-16
  • [Presentation] タンパク質AMP化の生理学的意義解明に向けたAMP化アミノ酸誘導体の創製2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      創薬懇話会2011
    • Place of Presentation
      ダイヤモンド瀬戸内マリンホテル(岡山市)
    • Year and Date
      2011-07-06
  • [Presentation] タンパク質化学合成を指向したワンポット4成分連続縮合法の開発2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      創薬懇話会2011
    • Place of Presentation
      ダイヤモンド瀬戸内マリンホテル(岡山市)
    • Year and Date
      2011-07-06
  • [Presentation] Design and synthesis of traceable linker for efficient enrichment and specific labeling of target proteins2011

    • Author(s)
      山本純
    • Organizer
      22nd American Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sheraton hotel (San Diego USA)
    • Year and Date
      2011-06-26
  • [Presentation] N-sulfanylethylanilide derivative as a peptide thioester equivalent2011

    • Author(s)
      佐藤浩平
    • Organizer
      22nd American Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sheraton hotel (San Diego USA)
    • Year and Date
      2011-06-26
  • [Presentation] Synthesis of CXCL14 and its derivatives utilizing C to N or N to C directive sequential NCL protocol2011

    • Author(s)
      辻耕平
    • Organizer
      22nd American Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sheraton hotel (San Diego USA)
    • Year and Date
      2011-06-26
  • [Presentation] AMP化タンパク質の機能解明に向けたAMP化アミノ酸誘導体の創製2011

    • Author(s)
      小倉圭司
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第6回年会
    • Place of Presentation
      東京工業大学(東京都)
    • Year and Date
      2011-05-23
  • [Book] 遺伝子医学MOOK21号最新ペプチド合成技術とその創薬研究への応用「刺激応答型アミノ酸の開発と生命科学分野への応用」2012

    • Author(s)
      重永章
    • Publisher
      メディカルドゥ(印刷中)

URL: 

Published: 2013-06-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi