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2010 Fiscal Year Annual Research Report

慢性腎臓病の糸球体マイクロプロテオーム解析による病因・病態の解明

Research Project

Project/Area Number 21390262
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

山本 格  新潟大学, 医歯学系, 教授 (30092737)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 矢尾板 永信  新潟大学, 医歯学系, 准教授 (00157950)
吉田 豊  新潟大学, 医歯学系, 講師 (40182795)
田中 憲一  新潟大学, 医歯学系, 教授 (10126427)
小原 令子  かずさDNA研究所, ゲノム医学研究室, 特定研究支援者 (20392285)
Keywords慢性腎臓病 / 糸球体 / プロテオーム / 質量分析計 / 抗体 / データベース
Research Abstract

1. ヒト正常腎糸球体プロテオームデータベースの構築
質量分析計で同定した正常ヒト糸球体のタンパク質とHuman Protein Atlas (http://www.proteinatlas.org/)との共同研究により、タンパク質の存在部位をしめす免疫組織化学画像を統合したデータベースを構築し、情報をウェブ上(http://www.hkupp.org/)に公開した。また、質量分析計とHuman Protein Atlasの正常ヒト糸球体のタンパク質を比較する共同研究も開始した。
2. ヒト腎生検試料の糸球体のプロテオーム解析技術の改革
フォルマリン固定-パラフィン包埋ヒト腎生検試料の切片から得られた糸球体50個から約200種類のタンパク質を同定できる新しい基盤技術を開発し、それを応用して膜性腎症などの検体の解析を開始した。腎臓病の病因・病態の解明に繋がると期待される。
3. 尿プロテオームデータベースの構築
正常ヒトの肝臓、血漿、腎臓、尿の質量分析計によるプロテオーム解析から、それぞれ5897、1879、1321、1189種類のタンパク質が同定された。尿プロテオームのうち、458(38.5%)は血漿、154(13.0%)は腎臓に由来するタンパク質であることが分かった。腎臓内のそれらの存在部位を示す免疫組織化学画像を統合したデータベースの構築を開始した。腎臓病の尿バイオマーカーの発見に寄与するデータベースとなると考えられる。

  • Research Products

    (16 results)

All 2010 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (5 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Proteomics database in chronic kidney disease2010

    • Author(s)
      Yamamoto Tadashi
    • Journal Title

      Adv Chronic Kidney Dis

      Volume: 17 Pages: 487-492

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Expression and localization of insulin-like growth factor binding proteins in normal and proteinuric kidney glomeruli.2010

    • Author(s)
      Fujinaka Hidehiko
    • Journal Title

      Nephrolog

      Volume: 15 Pages: 487-492

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Differential proteomic shotgun analysis elucidates involvement of water channel aquaporin 8 in presence of a-amylase in the colon2010

    • Author(s)
      Magdeldin Sameh
    • Journal Title

      J Proteome Res

      Volume: 9 Pages: 6635-6646

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The 4th Human Kidney and Urine Proteome Project(HKUPP)workshop.2010

    • Author(s)
      Yamamoto Tadashi
    • Journal Title

      Proteomics.

      Volume: 10 Pages: 2069-2070

  • [Journal Article] Recommendations for biomarker identification and qualification inclinical proteomics2010

    • Author(s)
      Mischak Harald
    • Journal Title

      Sci Transl Med

      Volume: 2 Pages: 1-6

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Glomerular proteins related to slit diaphragm and matrix adhesion in the foot processes are highly tyrosine phosphorylated in the normalrat kidney2010

    • Author(s)
      Zhang Ying
    • Journal Title

      Nephrol Dial Transplant

      Volume: 25 Pages: 1785-1795

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Functional proteomic analysis of experimental autoimmune myocarditis-induced chronic heart failure in the rat2010

    • Author(s)
      Sanzen Yoshiki
    • Journal Title

      Biol Pharm Bull.

      Volume: 33 Pages: 477-486

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular characterization of Panton-Valentine leukocidin-positive community-acquired methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates in Egypt.2010

    • Author(s)
      Enany Shyma
    • Journal Title

      Microbiol Res

      Volume: 165 Pages: 152-162

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Notes for proteomics analysis of microdissected kidney glomerulus sections2010

    • Author(s)
      Yamamoto T
    • Organizer
      6th International Barbados Proteomics Conference
    • Place of Presentation
      Holetown, Barbados
    • Year and Date
      20100108-15
  • [Presentation] The Human Proteome Project & Human Kidney and Urine Proteome Project2010

    • Author(s)
      Yamamoto T
    • Organizer
      EUROKUP conference
    • Place of Presentation
      Pissouri, Cyprus
    • Year and Date
      2010-11-06
  • [Presentation] Origin of Urine Proteins2010

    • Author(s)
      Yamamoto Tadashi
    • Organizer
      HUPO 9^<th> World Congress 2010
    • Place of Presentation
      Sydney, Australia
    • Year and Date
      2010-09-20
  • [Presentation] Human Kidney and Urine Proteome Project2010

    • Author(s)
      Yamamoto Tadashi
    • Organizer
      53^<th>日本腎臓学会総会
    • Place of Presentation
      神戸、日本
    • Year and Date
      2010-06-18
  • [Presentation] Proteomics for Understanding of Kidney Functions and Diseases2010

    • Author(s)
      Yamamoto Tadashi
    • Organizer
      KHUPO 10th Annual International Proteomics Conference
    • Place of Presentation
      Seoul, Korea
    • Year and Date
      2010-04-02
  • [Book] Methods and Protocols(Isolation and Enrichment of Glomeruli Using Sieving Techniques In Renal and Urinary Proteomics)2010

    • Author(s)
      Yamamoto Tadashi
    • Total Pages
      422
    • Publisher
      Wiley-Blackwell
  • [Remarks]

    • URL

      http://www/hkupp.org/

  • [Remarks]

    • URL

      http://www.hkupp.urinebank.org/

URL: 

Published: 2012-07-19  

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