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2009 Fiscal Year Annual Research Report

酸化的塩基損傷を認識する修復酵素の同定と放射線や活性酸素に対する防御機能の解析

Research Project

Project/Area Number 21510056
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

秋山 秋梅 (張 秋梅)  Kyoto University, 大学院・理学研究科, 准教授 (00260604)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 橋口 一成  京都大学, 大学院・理学研究科, 助教 (80400414)
Keywords放射線 / 活性酵素 / 塩基損傷 / 塩基除去修復 / 突然変異 / DNA修復
Research Abstract

(1)カタユウレイボヤのAPエンドヌクレアーゼ(CiAPE)を精製し、その特徴を解析した。CiAPEは分子量約34kDaのタンパク質である。CiAPEはテトラヒドロフラン(THF)を含む二重鎖オリゴヌクレオチドを効率よく切断した。また大腸菌のxth欠損株であるBW9093株を、CiAPEを組み込んだ発現ベクターで形質転換させたところ、その過酸化水素感受性が補完された。これらの結果よりCiAPEはカタユウレイボヤにおいて酸化ストレスに抵抗するようなAPエンドヌクレアーゼ活性を有することが示された。(2)大腸菌MutTのホモログは,酵母をはじめとする真核生物,植物,ヒトやマウスなどの高等動物からも見つかっており,8-oxo-dGTPの除去機能は生命の維持には欠かせないものであると推測される一方で,線虫C. elegansからはこの酵素のホモログが見つかっていない。C. elegansは発生および神経系の研究に適していると考えられモデル生物として用いられるようになったが,実験材料として優れた性質をもつことから酸化ストレスにおけるモデル生物として使えることも期待されており,そのためにストレス応答の機構の解明が現在の課題となっている。今年度の研究では、E. coli MutTやhuman MTHlとアミノ酸配列が相同であるC. elegansの遺伝子の候補を検索し、その中でC. elegans NDX-1は8-oxo-dGTPは分解しないが、8-oxo-dGDPを分解することがわかった。8-oxo-dGTPを分解する酵素は本研究では同定できなかったが、これまでに知られている8-oxo-dGTPaseとはアミノ酸配列の大きく異なった酵素が働いている可能性もあることから、別の実験によるアプローチを試み、数個の候補を得た。現在さらに解析中である。

  • Research Products

    (27 results)

All 2009

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (22 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Generation, biological consequences and repair mechanisms of cytosine Deamination in DNA2009

    • Author(s)
      Yonekura, S., N, Nakamura, S, Yonei, Q-M.Zhang-Akiyama
    • Journal Title

      Journal of Radiation Research Vol.50

      Pages: 19-26

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Human Nei-like protein NEIL3 has AP lyase activity specific for single-stranded DNA and confers oxidative stress resistance in Escherichia coli mutant2009

    • Author(s)
      Takao, M., Y.Ohta, K.Kitadokoro, K.KobaYashi, S.Iwai, A.Yasui, S.Yonei, Q-M.Zhang
    • Journal Title

      Genes to Cells Vol.14

      Pages: 383-391

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] KsgA, a 16S rRNA adenine methyltransferase, has a novel DNA dlycosylase/AP lyase activity to prevent mutations in Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Zhang-Akiyama, Q-M., H.Morinaga, M.Kikuchi, S.Yonekura, H.Sugiyama, K.Yamamoto, S.Yonei
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research Vol.37

      Pages: 2116-2125

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Purification and characterization of Caenorhadbitis elegans NTH, a homolog of human endonuclease III : essential role of N-terminal region2009

    • Author(s)
      Morinaga, H., S.Yonekura, N.Nakamura, H.Sugiyama, S.Yonei, Q-M.Zhang-Akiyama
    • Journal Title

      DNA Repair Vol.8

      Pages: 844-851

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 真核生物OXR1タンパク質の機能解析2009

    • Author(s)
      橋口一成、田野恵三、浅井翔太、野村崇治、渡邉正己、秋山(張)秋梅
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2009-12-12
  • [Presentation] C. elegansの酸化DNA修復酵素とストレス応答タンパク質のゲノム安定性への関与2009

    • Author(s)
      秋山(張)秋梅、真田悠生、浅井翔太、加藤悠一、森脇隆仁、橋口一成、森永浩伸、中村允耶
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2009-12-10
  • [Presentation] 4-NQOの突然変異誘発性における活性酸素の関与2009

    • Author(s)
      中山強志、橋口一成、米倉慎一郎、米井脩治、山本和生、秋山(張)秋梅
    • Organizer
      日本放射線影響学会第52回大会
    • Place of Presentation
      広島市南区民文化センター(広島市)
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Presentation] 線虫C. elegansの新規遺伝子CeOXRによるROS消去と寿命との関係2009

    • Author(s)
      浅井翔太、橋口一成、中村允耶、石井直明、秋山(張)秋梅
    • Organizer
      日本放射線影響学会第52回大会
    • Place of Presentation
      広島市南区民文化センター(広島市)
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Presentation] 抗酸化酵素の高発現によるヒト細胞の酸化ストレス応答の変化2009

    • Author(s)
      細木彩夏、橋口一成、米倉慎一郎、近藤隆、米井脩治、野村崇治、秋山(張)秋梅
    • Organizer
      日本放射線影響学会第52回大会
    • Place of Presentation
      広島市南区民文化センター(広島市)
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Presentation] 線虫における酸化ヌクレオチド分解酵素の同定と機能の解析2009

    • Author(s)
      真田悠、米倉慎一郎、菊地政弘, 秋山(張)秋梅
    • Organizer
      日本放射線影響学会第52回大会
    • Place of Presentation
      広島市南区民文化センター(広島市)
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Presentation] APサイト修復に関わる線虫APN-1タンパク質の機能解析2009

    • Author(s)
      加藤悠一、橋口一成、秋山(張)秋梅
    • Organizer
      日本放射線影響学会第52回大会
    • Place of Presentation
      広島市南区民文化センター(広島市)
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Presentation] 線虫C. elegansの塩基除去修復酵素が老化・細胞死の制御に果たす役割2009

    • Author(s)
      秋山(張)秋梅、加藤悠一、真田悠生、浅井翔太、森永浩伸、中村允耶、橋口一成
    • Organizer
      日本放射線影響学会第52回大会
    • Place of Presentation
      広島市南区民文化センター(広島市)
    • Year and Date
      2009-11-12
  • [Presentation] 線虫における酸化ヌクレオヂド分解酵素の同定と機能の解析2009

    • Author(s)
      真田悠生、米倉慎一郎、菊地政弘、秋山(張)秋梅
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学理学部(松本市)
    • Year and Date
      2009-09-18
  • [Presentation] 線虫の塩基除去修復とゲノム安定性2009

    • Author(s)
      秋山(張)秋梅, 中村允耶, 森永浩伸, 浅井翔太, 眞田悠生, 加藤悠一, 森脇隆仁
    • Organizer
      日本遺伝学会第81回大会
    • Place of Presentation
      信州大学理学部(松本市)
    • Year and Date
      2009-09-17
  • [Presentation] Mutagenesis of 4-NQO in the growth phase of Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Nakayama, T., Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] The C. elegans OXR1 homolog extends lifespan by suppressing oxidative stress2009

    • Author(s)
      Asai, S., Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Search for the MutT functional homolog in C. elegans2009

    • Author(s)
      Sanada, U, Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Repair of AP sites in C. elegans2009

    • Author(s)
      Kato, Y., K.Hashiguchi, Q-M.Zhane-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Cloning and characterization of uracil-DNA glycosylase and the biological consequences of the loss of its function in the nematode Caenorhabditis elegans2009

    • Author(s)
      Nakamura, N., M.Kikuchi, Q-M.Zhane-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Modulation of cellular effects of gamma rays by overexpression of antioxidant enzymes in human cells2009

    • Author(s)
      Hosoki, A., Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Analysis of physiological function of mismatch repair system in Caenorhabditis elegans2009

    • Author(s)
      Moriwaki, T., Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Characterization of an ascidian homolog that is involved in the repair of oxidatively damaged bases2009

    • Author(s)
      Kato, S., S.Yonekura, Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd International Symposium of the Biodiversity Global COE Project
    • Place of Presentation
      京都国際交流会館(京都市)
    • Year and Date
      2009-07-24
  • [Presentation] Caenorhabditis elegans has two DNA glycosylases for oxidative pyrimidine damage : NTH homolog and a novel DNA glycosylase with functional similarity to NTH2009

    • Author(s)
      Morinaga, H., S.Yonekura, S.Yonei, Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd ASM Conference on DNA Repair and Mutagenesis : From Molecular Structure to Human Disease
    • Place of Presentation
      Fairmont Chateau Whistler(Whistler, BC, Canada)
    • Year and Date
      2009-06-03
  • [Presentation] Cloning and characterization of uracil-DNA glycosylase and the biological consequences of the loss of its function in the nematode Caenorhadbitis elagans2009

    • Author(s)
      Nakamura, N., H.Morinaga, M.Kikuchi, S.Yonekura, N.Ishii, S.Yonei, Q-M.Zhang-Akiyama
    • Organizer
      The 3rd ASM Conference on DNA Repair and Mutagenesis : From Molecular Structure to Human Disease
    • Place of Presentation
      Fairmont Chateau Whistler (Whistler, BC, Canada)
    • Year and Date
      2009-06-02
  • [Presentation] Cloning and characterization of an ascidian AP endonuclease that is involved in the repair of AP Sites in DNA in Ciona intestinalis2009

    • Author(s)
      Zhang-Akiyama, Q-M., D.Nanbara, S.Yonei
    • Organizer
      The 3rd ASM Conference on DNA Repair and Mutagenesis : From Molecular Structure to Human Disease
    • Place of Presentation
      Fairmont Chateau Whistler(Whistler, BC, Canada)
    • Year and Date
      2009-06-02
  • [Presentation] Overexpression of mitochondria-targeted SOD2 regulates radiation resistance and gene expression in HeLa S3 cells2009

    • Author(s)
      Zhang-Akiyama, Q-M., A.Hosoki, S.Yonekura, G-L.Zhao, Z-L.Wei, T.Nomura, S.Yonei, T.Kondo
    • Organizer
      The 2nd Asian Congress of Radiation Research
    • Place of Presentation
      COEX(Soul, Korea)
    • Year and Date
      2009-05-18
  • [Book] Methods in Molecular Biology. Mitochondrial DNA : Methods and Protocols.(Stuart, J.A., Editor)2009

    • Author(s)
      Hashiguchi, K., Q-M.Zhang-Akivama
    • Total Pages
      414
    • Publisher
      Humana Press(New Jersey)

URL: 

Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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