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2011 Fiscal Year Annual Research Report

レセプター分子との複合体における糖鎖の高精度選択的検出法の開発

Research Project

Project/Area Number 21550092
Research InstitutionMeisei University

Principal Investigator

田代 充  明星大学, 理工学部, 准教授 (40315750)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 吉村 悦郎  東京大学, 農学生命科学, 教授 (10130303)
Keywords生物学的分析 / レセブター・リガンド複合体 / 選択的検出 / 核磁気共鳴 / 分子間相互作用 / 高感度化・高精度化
Research Abstract

核磁気共鳴法(NMR)により、リガンドーレセプター複合体の相互作用解析のための新規測定法の開発を行った。
(1)モデルシステムとして使用した複合体
モデルシステムとして、卵白リゾチームーグルコースおよびヒト血清アルブミンートリプトファンを使用した。リゾチームおよびヒト血清アルブミンは、共に市販品であり入手可能である。
モデル化合物として実際に使用したタンパク質関連の試料溶液は以下の3種類である。
(1)50mMグルコース+0.4mMリゾチーム(10mMリン酸緩衝液pH7.5)
(2)2.OmMトリプトファン+0.1mMヒト血清アルブミン
(3)2.OmMトリプトファン+0.1mMヒト血清アルブミン+2.OmMグルコース
(2)NMR測定法
NMR測定法として、STD法およびWater-LOGSY法の2種類が、高親和性のリガンドに対しても適用可能との報告がある。本研究では水シグナル近傍のリガンドシグナル観測の観点より、STD法をベースに高感度化・高精度化を目指した。pre-saturationおよびZ-filterを繰り返して2回用いたシーケンスが水シグナルの消去に大変効果的であった。
(3)リガンドシグナルの選択的検出
リゾチーム+グルコース複合体においてリガンド(グルコース)シグナルの選択的検出を試みたところ、(2)で述べたpre-saturationおよびZ-filterの組み合わせにより、水シグナルの近傍にある全てのグルコースシグナルを検出できた。ヒト血清アルブミン+トリプトファン複合体にも応用したところ、巨大な水シグナルが線幅の細いシグナルとして観測され、水シグナルの近傍にあるグルコースの1位のシグナルも鮮明に観測された。この複合体においては、結合に関与しないグルコースが同一の溶液中に存在しても、リガンドであるトリプトファンの選択的検出が可能であった。

  • Research Products

    (6 results)

All 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Characterization of the complex formation of 1,6-anhydro-β-maltose and potassium ions using NMR spectroscopy and single-crystal X-ray crystallography2011

    • Author(s)
      T.Fujimoto, T.Kato, Y.Usui, O.Kamo, K.Furihata, K.Tsubono, T.Kato, T.Machinami, M.Tashiro
    • Journal Title

      Carbohydr.Res.

      Volume: 346 Pages: 1991-1996

    • DOI

      10.1016/j.carres.2011.06.017

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective J-resolved-HMQC-1 and-2, new methods for measuring proton-proton coupling constants in strongly coupled spin systems2011

    • Author(s)
      K.Furihata, M.Tashiro
    • Journal Title

      Magn.Reson.Chem.

      Volume: 49 Pages: 459-463

    • DOI

      DOI:10.1002/mrc.2778

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] BIRD-J-resolved HMBC and BIRD-high resolution-HMBC pulse sequences for measuring heteronuclear long range coupling constants and proton-proton spin coupling constants in the complicated spin systems2011

    • Author(s)
      Kazuo Furihata, M.Tashiro, H.Seto
    • Journal Title

      Magn.Reson.Chem.

      Volume: 49 Pages: 53-58

    • DOI

      DOI:10.1002/mrc.2702

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Demonstration of three dopamine molecules bound to α-synuclein : Implication of oligomerization at the initial stage

    • Author(s)
      S.Shimotakahara, Y.Shiroyama, T.Fujimoto, M.Akai, T.Onoue, H.Seki, S.Kado, T.Machinami, Y.Shibusawa, K.Ueda, Mitsuru Tashiro
    • Journal Title

      J.Biophy.Chem.

      Volume: (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Complex formation of the sugar 1,6-anhydro-β-maltose with sodium ions as probed by NMR spectroscopy2011

    • Author(s)
      田代充、吉村悦郎
    • Organizer
      The 3^<rd> International Symposium on Metallomics
    • Place of Presentation
      ミュンスター大学、ドイツ
    • Year and Date
      20110614-20110619
  • [Presentation] An effective pulse Sequence for detecting a ligand binding with a protein receptor using a WET Sequence and the repeated Z-filters2011

    • Author(s)
      田代充、下高原櫻子、降旗一夫
    • Organizer
      52^<th> Experimental NMR Conference
    • Place of Presentation
      カリフォルニア、USA
    • Year and Date
      20110411-20110415

URL: 

Published: 2013-06-26  

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