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2011 Fiscal Year Annual Research Report

ピロリジル転移リボ核酸合成酵素を利用した非天然型アミノ酸の蛋白質への導入

Research Project

Project/Area Number 21550167
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

柳沢 達男  独立行政法人理化学研究所, システム研究チーム, 研究員 (10450420)

Keywords非天然型アミノ酸 / アミノアシルtRNA合成酵素 / tRNA / タンパク質 / ケミカルバイオロジー / 翻訳 / 翻訳後修飾 / クロスリンカー
Research Abstract

重原子、反応性官能基、蛍光基、クロスリンカー等、有用な官能基を有する非天然型アミノ酸を部位特異的に導入する方法はタンパク質の構造と機能を知る上で重要な技術となってきている。ピロリジルtRNA合成酵素(PylRS)/tRNA^<Pyl>ペアは大腸菌や哺乳類細胞などの宿主由来のアミノアシルtRNA合成酵素(aaRS)、tRNAと交差反応しない理想的な非天然型アミノ酸導入システムである。柳沢らはPylRS触媒ドメインの結晶構造を解明すると共に、様々なリジン誘導体をタンパク質に導入できる特異なaaRS/tRNAであることを発見し、タンパク質のラベル化や翻訳後修飾に広く利用される系として礎を築いてきた。当研究グループでは細胞内でのタンパク質間相互作用を探索する目的で、以前からクロスリンカー含有非天然型アミノ酸の導入系を開発してきたが、柳沢らは新規のクロスリンカー含有リジン誘導体、N^ε-(trifluoromethyldiazirinylbenzyloxycarbonyl)-L-lysine (TmdZLys)を大腸菌および哺乳類細胞においてタンパク質に部位特異的に導入することに成功した。TmdZLysを導入したGRB2タンパク質は従来のクロスリンカー含有アミノ酸を導入したGRB2と比べ、細胞内ターゲットであるEGFRタンパク質と広い範囲(反応点から6~15Å)でUVクロスリンクが可能であることから、TmdZLysを利用することでタンパク質間相互作用ネットワークを解明することが期待できる。また、当グループで最近開発された翻訳終結因子欠損大腸菌株を利用しN^ε-acetyl-L-lysine (AcLys)などのリジン誘導体をタンパク質中の複数カ所に導入することにも成功している。本課題の成果は今後生命科学研究の重要な基盤技術になると考えられる。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

  • Research Products

    (8 results)

All 2012 2011

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results) Book (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Wade-range protein photo-crosslinking achieved by a genetically encoded N^ε-(benzyloxycarbonyl) lysine derivative with a diazirinyl moiety2012

    • Author(s)
      T. Yanagisawa, N. Hino, F. Iraha, T. Mukai, K. Sakamoto, S. Yokoyama
    • Journal Title

      Mol. Bio Syst.

      Volume: 8 Pages: 1131-1135

    • DOI

      10.1039/C2MB05321G

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic-code evolution for protein synthesis with non-natural amino acids2011

    • Author(s)
      T. Mukai, T. Yanagisawa, K. Ohtake, M. Wakamori, J. Adachi, N. Hino, A. Sato, T. Kobayashi, A. Hayashi, M. Shirouzu, T. Umehara, S. Yokoyama, K. Sakamoto
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Comm.

      Volume: 411 Pages: 757-761

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 終止コドンUAGがセンス・コドンに再定義された大腸菌株を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への導入2011

    • Author(s)
      坂本健作、安達仁朗、若森昌聡、白水美香子、梅原崇史、柳沢達男、向井崇人、横山茂之
    • Organizer
      第6回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      兵庫県姫路市
    • Year and Date
      20111116-17
  • [Presentation] 転移RNAを擬態する大腸菌翻訳因子EF-Pのアミノアシル化修飾2011

    • Author(s)
      柳沢達男、澄田智美、石井亮平、竹本千重、横山茂之
    • Organizer
      第5回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      高知県高知市
    • Year and Date
      20110805-07
  • [Book] 化学と生物2011

    • Author(s)
      柳沢達男、澄田智美、横山茂之
    • Total Pages
      4
    • Publisher
      転移RNAを擬態する大腸菌翻訳因子EF-Pのアミノアシル化修飾-抗菌薬ターゲットとしての可能性に期待-
  • [Book] Photon Factory Activity Report Research Highlights 20102011

    • Author(s)
      T. Yanagisawa, T. Sumida, S. Yokoyama
    • Total Pages
      1
    • Publisher
      The Crystal Structure of Translation Elongation Factor P (EF-P) Complexed with An Aminoacyl-tRNA Synthetase Paralog, GenX, Reveals that EF-P Functionally Mimics Transfer RNA
  • [Book] SPring-8 Research Frontiers 20102011

    • Author(s)
      T. Yanagisawa, T. Sumida, S. Yokoyama
    • Total Pages
      1
    • Publisher
      Structure and function of a protein mimicking transfer RNA revealed from the structure of translation elongation factor P complexed with an aminoacyl-tRNA synthetase paralog, GenX.
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 新規な非天然型アミノ酸、及びその利用(N^ε-(p-trifluoromethyldia zirinylbenzyloxycarbonyl)-lysine)2011

    • Inventor(s)
      横山茂之、坂本健作、柳沢達男、樋野展正、伊良波史枝
    • Industrial Property Rights Holder
      横山茂之、坂本健作、柳沢達男、樋野展正、伊良波史枝
    • Industrial Property Rights Type
      特許権
    • Industrial Property Number
      2011-253307
    • Filing Date
      2011-11-18

URL: 

Published: 2015-07-13  

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