Site-specific incorporation of non-natural amino acids into proteins by using pyrrolysyl-tRNA synthetase

2011 Fiscal Year Final Research Report

• Project/Area Number: 21550167
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Chemistry related to living body
• Research Institution: The Institute of Physical and Chemical Research
• Principal Investigator: YANAGISAWA Tatsuo 独立行政法人理化学研究所, システム研究チーム, 研究員 (10450420)
• Project Period (FY): 2009 – 2011
• Keywords: バイオテクノロジー / 非天然型アミノ酸 / タンパク質 / クロスリンカー / ケミカルバイオロジー / 翻訳 / ピロリジン / アミノアシルtRNA合成酵素

Research Abstract

Site-specific incorporation of N^ε-(p-trifluoreomethyldiazirinylbenzyloxycarbonyl) lysine(TmdZLys), a new lysine derivative with a diazirine photo-crosslinker, into proteins has been achieved by the pyrrolysyl-tRNA synthetases(PylRS)/tRNA^<Pyl> system. The incorporated TmdZLys enabled wide-range photo-crosslinking with target proteins. This system is useful for probing protein interaction networks in living cells.

Research Products

• [Journal Article] (2012)
  • Author(s): Yanagisawa, T., Hino, N., Iraha, F., Mukai, T., Sakamoto, K., Yokoyama, S.
  • Journal Title: Mol. BioSyst Volume: 8 Pages: 1131-1135
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] (2011)
  • Author(s): Mukai, T., Yanagisawa, T., Ohtake, K., Wakamori, M., Adachi, J., Hino, N., Sato, A., Kobayashi, T., Hayashi, A., Shirouzu, M., Umehara, T., Yokoyama, S., Sakamoto, K.
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun Volume: 411 Pages: 757-761
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 終止コドンUAGがセンス・コドンに再定義された大腸菌株を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への導入 (2011)
  • Author(s): 坂本健作、安達仁朗、若森昌聡、白水美香子、梅原崇史、柳沢達男、向井崇人、横山茂之
  • Organizer: 第6回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: 兵庫
  • Year and Date: 2011-11-16
• [Presentation] 大腸菌、昆虫細胞、動物細胞を用いた非天然型アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入法の開発 (2010)
  • Author(s): 坂本健作、向井崇人、大竹和正、伊良波史枝、林明子、佐藤文、樋野展正、柳沢達男、脇山素明、横山茂之
  • Organizer: 第10回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2010-06-17
• [Presentation] 翻訳後修飾アミノ酸のタンパク質への部位特異的導入 (2009)
  • Author(s): 坂本健作、小林隆嗣、柳沢達男、横山茂之
  • Organizer: 第4回無細胞生命科学研究会
  • Place of Presentation: 岐阜
  • Year and Date: 2009-11-16
• [Patent(Industrial Property Rights)] 新規非天然型アミノ酸とその応用に関する研究: N(epsilin)-(p-trifluoromethyldiazirinylbenzylo xycarbonyl) lysine
  • Inventor(s): Yokoyama, S., Sakamoto, K., Yanagisawa, T., Hino, N., F. Iraha
  • Industrial Property Rights Holder: Yokoyama, S., Sakamoto, K., Yanagisawa, T., Hino, N., F. Iraha
  • Industrial Property Number: 特願、2011-253307