• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2011 Fiscal Year Annual Research Report

N結合糖鎖による生体高分子ゲルのゲル化調節機構の研究

Research Project

Project/Area Number 21550200
Research InstitutionGunma University

Principal Investigator

窪田 健二  群馬大学, 大学院・工学研究科, 教授 (40153332)

Keywords高分子ゲル / フィブリノゲン / N結合糖鎖 / αC鎖 / Fragment-X / ラテラル凝集
Research Abstract

最終年度の今年度は、(1)これまで足踏みしていたN結合糖鎖の非還元末端からの逐次切除による凝集促進効果の検討 (2)D領域、E領域それぞれに結合している糖鎖の役割を明らかにすることについて、大きな成果が得られた。具体的には、2残基目のGal切除によっては更なる変化がほとんど見られず、非還元末端のシアル酸1残基切除による促進効果が主要であり、D領域のBβ鎖に結合している糖鎖がラテラル凝集への移行を調節する主要因子であることが実証された。イオン強度に凝集が依存することから、シアル酸の負電荷が相互作用に関与することから、プロトフィブリル形成時にBβ鎖N端部と相互作用することが強く示唆され、この相互作用を介してフィブリノペプチドBと相互作用しているαCドメインのリリースにN結合糖鎖が関与することが示された。また(3)αC鎖を欠損させたフラグメントXについての研究から、Bβ鎖N端部がラテラル凝集にとって必須の部位であることが明らかとなった。一方、N結合糖鎖の切り出しについては、酵素endo-Mの効率が良くないことから、トリプシン消化による糖ペプチドの調製に方針を転換し、現在最終的な精製段階に達しており、現在進めている遺伝子工学的に調製したBβ鎖N端66残基との相互作用解析を計画している。また、遺伝子工学的に調製したαC鎖部分鎖の相互作用解析からは、αCドメインがE領域(フィブリノベプチドB)と相互作用すること、αC鎖同+でアミロイド様のβシート構造を作ることを確認した。これらを総合すると、Bβ鎖N端部がラテラル凝集の中心となり、αC鎖はそれを媒介すること、これらのトリガーとしてN結合糖鎖が抑制的に作用する、すなわち、N結合糖鎖はフィブリンゲル形成におけるラテラル凝集の積極的な調節因子として働いているというスキームを示すことができ、当初の研究目的を十分に達成する結果を得た。

  • Research Products

    (21 results)

All 2012 2011

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (17 results)

  • [Journal Article] Desialylation of N-linked Carbohydrate Chain of Fibrinogen2012

    • Author(s)
      K.Kubota, Y.Toyama, N.Nameki, K.Wakamatsu
    • Journal Title

      Key Engineering Materials

      Volume: (in press)

    • DOI

      ISSN 1013-9826

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Deglycosylation Effect of Plasmin-Treated Fibrinogen on the Polymerization2012

    • Author(s)
      K.Kubota, Y.Yatagai, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Journal Title

      Transactions of the Materials Research Society of Japan

      Volume: (in press)

    • DOI

      ISSN 1382-3469

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Additive Effect of Betaines on the Fibrinogen Cryogelation Induced by Low Temperature2011

    • Author(s)
      Y.Toyama, K.Miyamoto, K.Kubota, K.Wakamatsu, N.Nameki, T.Saheki, M.Ochiai
    • Journal Title

      Transactions of the Materials Research Society of Japan

      Volume: 36 Pages: 393-396

    • DOI

      ISSN 1382-3469

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] pH dependence of Rheological Properties of Gelatin Gel Mixed with Agra and Agarose2011

    • Author(s)
      Y.Toyama, R.Sahara, Y.Iino, K.Kubota
    • Journal Title

      Transactions of the Materials Research Society of Japan

      Volume: 36 Pages: 383-386

    • DOI

      ISSN 1382-3469

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Interactions of Recombinant aC-domain with Intact Fibrinogen and Fibrinogen Degradation Products2011

    • Author(s)
      Y.Ishibashi, Y.Arafune, N.Nameki, K.Kubota, Y.Toyama, Y.Handa, M.Ochiai
    • Organizer
      the Materials Research Society of Japan 21^<st> Academic Symposium
    • Place of Presentation
      横浜開港記念館
    • Year and Date
      2011-12-21
  • [Presentation] Effect of Domain Selective Deglycosylation on the Fibrin Polymerization2011

    • Author(s)
      N.Watanabe, T.Fukuda, K.Kubota, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      the Materials Research Society of Japan 21^<st> Academic Symposium
    • Place of Presentation
      横浜開港記念館
    • Year and Date
      2011-12-21
  • [Presentation] Cleaving Effect of Disaccharide from the Unreduced Termini of N-linked Carbohydrate Chains on the Fibrin Polymerization2011

    • Author(s)
      T.Fukuta, N.Watanabe, K.Kubota, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      the Materials Research Society of Japan 21^<st> Academic Symposium
    • Place of Presentation
      横浜開港記念館
    • Year and Date
      2011-12-21
  • [Presentation] Deglycosylation Effect of Plasmin-treated Fibrinogen on the Polymerization2011

    • Author(s)
      K.Kubota, Y.Yatagai, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      the Materials Research Society of Japan 21^<st> Academic Symposium
    • Place of Presentation
      横浜開港記念館
    • Year and Date
      2011-12-21
  • [Presentation] Desialylation of N-linked Carbohydrate Chain of Fibrinogen2011

    • Author(s)
      K.Kubota, Y.Toyama, N.Nameki, K.Wakamatsu
    • Organizer
      2^<nd> International Conference on Advanced Micro-Device Engineering
    • Place of Presentation
      群馬大学桐生キャンパス
    • Year and Date
      2011-12-10
  • [Presentation] Silica Gel Carriers for the Controlled Release of Dark Material from Sugarcane Molasses2011

    • Author(s)
      K.Hatano, T.Akaishi, K.Tsunoda, K.Kubota
    • Organizer
      1st International Symposium on Element Innovation
    • Place of Presentation
      桐生市市民文化会館
    • Year and Date
      2011-12-09
  • [Presentation] フィブリン重合とゲル2011

    • Author(s)
      K.Kubota
    • Organizer
      日本バイオレオロジー学会第11回バイオレオロジーリサーチフォーラム
    • Place of Presentation
      東京大学本郷キャンパス(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-02
  • [Presentation] 廃糖蜜由来暗色物質を含有した徐放性キセロゲルの作製2011

    • Author(s)
      赤石哲夫、高橋和樹、小松勇、窪田健二、秦野賢一
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • Place of Presentation
      東洋大学板倉キャンパス
    • Year and Date
      2011-10-15
  • [Presentation] 界面活性剤溶液の相挙動の複雑さ、面白さ2011

    • Author(s)
      K.Kubota
    • Organizer
      日本レオロジー学会第13回レオロジーフォーラム
    • Place of Presentation
      桐生市市民文化会館(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-08
  • [Presentation] SPRを用いたFibrinogen分解産物とαC domainの相互作用測定2011

    • Author(s)
      Y.Ishibashi, Y.Arafune, N.Nameki, K.Kubota, Y.Toyama, Y.Handa, M.Ochiai
    • Organizer
      レオロジー学会第59回レオロジー討論会
    • Place of Presentation
      桐生市市民文化会館
    • Year and Date
      2011-10-08
  • [Presentation] Accelerated Gel Formation in Asialofibrinogen2011

    • Author(s)
      K.Kubota, T.Fukuda, N.Watanabe, Y.Yatagai, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      IUMRS 12<th> International Conference in Asis
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2011-09-30
  • [Presentation] セルロース系加水分解物からの発酵阻害物質の除去とその効果2011

    • Author(s)
      青柳直和、宮川拓也、田之倉優、窪田健二、秦野賢一
    • Organizer
      日本生物工学会第63回大会
    • Place of Presentation
      東京農工大学
    • Year and Date
      2011-09-27
  • [Presentation] Deglycosylation Effect of Plasmin-treated Fibrinogen on the Polymerization2011

    • Author(s)
      K.Kubota, Y.Yatagai, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      IUMRS 12^<th> International Conference in Asis
    • Place of Presentation
      Taipei, Taiwan
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] 廃糖蜜由来の暗色物質のファイトレメディエーションへの利用2011

    • Author(s)
      金沢一樹、角田欣一、窪田健二、秦野賢一
    • Organizer
      環境科学会2011年年会
    • Place of Presentation
      関西学院大学西宮上ヶ原キャンパス
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Presentation] フィブリン重合におけるフィブリノペプチドリリースの解析2011

    • Author(s)
      N.Watanabe, K.Kubota, T.Fukuta, Y.Yatagai, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      高分子学会第60回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場
    • Year and Date
      2011-05-25
  • [Presentation] フィブリン凝集に対するN-結合糖鎖の部分的切除効果2011

    • Author(s)
      T.Fukuta, K.Kubota, N.Watanabe, Y.Yatagai, Y.Toyama, N.Nameki, M.Ochiai
    • Organizer
      高分子学会第60回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場
    • Year and Date
      2011-05-25
  • [Presentation] 赤外分光法によるジェランガムのゲル化に伴う分子間・分子内水素結合の変化に関する研究2011

    • Author(s)
      T.Sakiyama, H.Sato, K.Kubota, K.Ozaki
    • Organizer
      高分子学会第60回高分子学会年次大会
    • Place of Presentation
      大阪国際会議場
    • Year and Date
      2011-05-25

URL: 

Published: 2013-06-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi