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2011 Fiscal Year Final Research Report

Molecular mechanism of mRNA degradation induced by translation arrest in plants

Research Project

  • PDF
Project/Area Number 21570032
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Plant molecular biology/Plant physiology
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

ONOUCHI Hitoshi  北海道大学, 大学院・農学研究院, 准教授 (50322839)

Project Period (FY) 2009 – 2011
Keywords翻訳制御 / mRNA分解制御 / 上流ORF
Research Abstract

In plants, it has not been known whether mRNAs with stalled ribosomes are subject to mRNA surveillance. In this study, using Arabidopsis upstream open reading frames, we found that ribosome stalling caused by the uORF-encoded peptides promotes mRNA degradation by the nonsense-mediated mRNA decay pathway in Arabidopsis

  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011 2010 2009 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (12 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] S-adenosyl-L-methionine induces compaction of nascent peptide chain inside the ribosomal exit tunnel upon translation arrest in the Arabidopsis CGS1 gene2011

    • Author(s)
      Noriyuki Onoue, Yui Yamashita, Nobuhiro Nagao, Derek B. Goto, Hitoshi Onouchi, and Satoshi Naito
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: vol.286, No.17 Pages: 14903-14912

    • DOI

      DOI:10.1074/jbc.M110.211656

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis cell-free extract, ACE, a new in vitro translation system derived from Arabidopsis callus cultures2011

    • Author(s)
      Katsunori Murota K, Yuka Hagiwara-Komoda, Keisuke Komoda, Hitoshi Onouchi, Masayuki Ishikawa, and Satoshi Naito
    • Journal Title

      Plant & Cell Physiology

      Volume: vol.52, No.8 Pages: 1443-1453

    • DOI

      DOI:10.1093/pcp/pcr080

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] uORFにコードされるペプチドが関与する遺伝子発現制御機構2012

    • Author(s)
      戸田智美、渡部峻、竹本まり子、蝦名績、遠洞弥生、小山博彰、瀬戸隆太、高橋広夫、高橋アンナ、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会、京都産業大学
    • Place of Presentation
      京都市
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] uORFがコードするペプチドにより発現が制御されるシロイヌナズナ遺伝子の探索2012

    • Author(s)
      竹本まり子、渡部峻、蝦名績、遠洞弥生、小山博彰、瀬戸隆太、戸田智美、高橋広夫、高橋アンナ、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第53回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      京都産業大学(京都市)
    • Year and Date
      2012-03-17
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるペプチド配列依存的に翻訳を制御するuORFの探索と解析2011

    • Author(s)
      竹本まり子、蝦名績、渡部峻、遠洞弥生、小山博彰、高橋広夫、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2011-12-15
  • [Presentation] Nascent peptide-mediated control of gene expression in Arabidopsis : Feedback regulation of methionine biosynthesis and beyond2011

    • Author(s)
      Hitoshi Onouchi, Isao Ebina, Mariko Takemoto, Shun Watanabe, Noriyuki Onoue, Yui Yamashita, Yayoi Endo, Hiroaki Koyama, Yoko Yamashita-Nagami, Hiro Takahashi, Satoshi Naito
    • Organizer
      12th International Congress on Amino Acids, Peptides and Protein
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2011-08-04
  • [Presentation] Identification of Regulatory Upstream Open Reading Frames in Arabidopsis that Control Translation of the Main Coding Sequence in an Amino Acid Sequence-Dependent Manner2011

    • Author(s)
      Isao Ebina, Shun Watanabe, Mariko Takemoto, Yayoi Endo, Hiroaki Koyama, Hiro Takahashi, Satoshi Naito, and Hitoshi Onouchi
    • Organizer
      The 16th Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      Kyoto International Conference Center (Kyoto)
    • Year and Date
      2011-06-17
  • [Presentation] 植物のuORFにコードされる新生ペプチドによる翻訳制御機構の探索と解析2011

    • Author(s)
      小山博彰、遠洞弥生、竹本まり子、渡部峻、蝦名績、高橋広夫、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第52回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台市)
    • Year and Date
      2011-03-11
  • [Presentation] uORFがコードするペプチドにより制御されるシロイヌナズナ遺伝子の探索2011

    • Author(s)
      竹本まり子、渡部峻、小山博彰、遠洞弥生、蝦名績、高橋広夫、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第52回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学(仙台市)
    • Year and Date
      2011-03-11
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるペプチド依存的なuORF制御機構の解析2010

    • Author(s)
      渡部峻、蝦名績、高野順平、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第51回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本市)
    • Year and Date
      20100320-21
  • [Presentation] uORFがコードするペプチドにより翻訳が制御されるシロイヌナズナ遺伝子の探索と解析2010

    • Author(s)
      尾之内均
    • Organizer
      日本植物学会第74回大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      中部大学(春日井)
    • Year and Date
      2010-09-10
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるペプチド配列依存的に制御を行う新規uORFのゲノムワイドな探索2010

    • Author(s)
      渡部峻、竹本まり子、蝦名績、遠洞弥生、小山博彰、高橋広夫、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      学術総合センター一ツ橋記念講堂(東京)
    • Year and Date
      2010-07-28
  • [Presentation] シロイヌナズナのuORFにコードされるペプチドが関与する転写後制御機構の解析2010

    • Author(s)
      竹本まり子、内山尚子、蝦名 績、渡部峻、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第12回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      学術総合センターツ橋記念講堂(東京)
    • Year and Date
      2010-07-28
  • [Presentation] シロイヌナズナにおけるuORFにコードされるペプチドによる翻訳制御の探索2009

    • Author(s)
      蝦名績、渡部峻、内藤哲、尾之内均
    • Organizer
      第32回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2009-12-11
  • [Remarks] 研究室ホームページURL

    • URL

      http://arabi4.agr.hokudai.ac.jp/arabi.html

URL: 

Published: 2013-07-31  

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