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2011 Fiscal Year Annual Research Report

ミトコンドリアゲノムの構造多様性と分子系統解析に基づく尾索動物の進化の研究

Research Project

Project/Area Number 21570101
Research InstitutionTokyo University of Pharmacy and Life Science

Principal Investigator

横堀 伸一  東京薬科大学, 生命科学部, 講師 (40291702)

Keywords尾策動物 / ミトコンドリアゲノム / タリア綱 / 分子系統解析
Research Abstract

尾索動物全体の系統進化の理解の上で重要であるグループ(種)を選択し、ミトコンドリア(mt)ゲノムの全塩基配列の決定を行い、その一次配列とそれ以外の高次情報(主としてミトコンドリアゲノムの遺伝子構造)に基づいて分子系統解析を行い、尾索動物の進化経路を明らかにすることを目的として、研究を行っている。
主として尾索動物の中でもホヤ綱腸性目とタリア綱に注目し、ミトコンドリアゲノムの全塩基配列の解析を進めている。昨年度に引き続き、腸性目については、ヘンゲボヤ科のPolycitor proliferus(ヘンゲボヤ)、Eudistoma parvum、ウスボヤ科のDiplosoma virens、ドロボヤ科のCorella sp.、マメボヤ科のPerophora sp.、ナツメボヤ科のPhallusia nigra、オオグチボヤ科のMegalodicopia hiansのミトコンドリアゲノムの部分配列の決定を行った。そのうち、D. virens、Corella sp.、Perophora sp.、E. parvum、M. hiansについては、long PCRを行い、そのmtDNAの全領域に相当するPCR産物を得た。順次、配列決定を進めている。
また、昨年度決定したヒカリボヤPyrosoma atlanticum(ヒカリボヤ目)のmtDNAの全塩基配列を、他のタリア綱(サルパ目Ritteriella amoboinensis、Ritteriella pecteti、ウミタル目Doliolum nationalis)を含む尾索動物mtDNAの全塩基配列とともに分子系統解析に供した。その結果、タリア綱は単系統群であり、腸性目+タリア綱が単系統群であることが示唆された。また、ヒカリボヤ目の系統学位置は、次の2つのいずれかであると示唆された。(1)ヒカリボヤ目はサルパ目の姉妹群である。(2)ヒカリボヤ目はタリア綱の中で最初に分岐した目である。サルパ目の早い進化速度がこの解析結果に影響を与えている可能性がある。

  • Research Products

    (12 results)

All 2012 2011

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Male death resulting from hybridisation between subspecies of the gypsy moth, Lymantria dispar2011

    • Author(s)
      Higashiura, Y., H.Yamaguchi, M.Ishihara, N.Ono, H.Tsukagoshi, S.Yokobori, S.Tokishita, H.Yamagata, T.Fukatsu
    • Journal Title

      Heredity

      Volume: 106 Pages: 603-613

    • DOI

      10.1038/hdy.2010.92

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Taurine-containing uridine modifications in tRNA anticodons are required to decipher non-universal genetic codes in ascidian mitochondria2011

    • Author(s)
      Suzuki, T., K.Miyauchi, T.Suzuki, S.Yokobori, N.Shigi, A.Kondow, N.Takeuchi, A.Yamagishi, K.Watanabe
    • Journal Title

      J.Biol.Chem.

      Volume: 286 Pages: 35494-35498

    • DOI

      10.1074/jbc.M111.279810

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] tRNA modification and genetic code variations in animal mitochondria2011

    • Author(s)
      Watanabe, K., S.Yokobori
    • Journal Title

      J.Nucleic Acids.

    • DOI

      10.4061/2011/623095

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetic code : introduction (Version 2)2011

    • Author(s)
      Watanabe, K., S.Yokobori
    • Journal Title

      Encyclopedia of Life Science

    • DOI

      10.1002/9780470015902.a0000809.pub2

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析2012

    • Author(s)
      小澤元希、島村繁、高木善弘、横堀伸一、前田太郎、丸山正、吉田尊雄
    • Organizer
      ブルーアース2012
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      20120200
  • [Presentation] ミトコンドリアtRNAの解析から見た遺伝暗号の進化2012

    • Author(s)
      横堀伸一、山岸明彦、渡辺公綱
    • Organizer
      第37回生命の起原と進化学会学術講演会
    • Place of Presentation
      高槻(2012/03)
    • Year and Date
      2012-03-08
  • [Presentation] 尾索動物ミトコンドリア遺伝暗号の進化2011

    • Author(s)
      横堀伸一、山岸明彦、渡辺公綱
    • Organizer
      日本進化学会第13回年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      20110700
  • [Presentation] Unique characteristics of ascidian mitochondrial tRNAs : Existence of 5-taurinometylyuridine-containing tRNAs involved in deciphering the non-universal genetic codes and an initiator tRNA corresponding to AUG codon2011

    • Author(s)
      Suzuki, T., K. Miyauchi, N. Shigi, A. Kondoh, N. Takeuchi, T. Suzuki, A. Yamagishi, S. Yokobori, & K. Watanabe.
    • Organizer
      RNA2011
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      20110600
  • [Presentation] Molecular phylogeny of urochordates and evolution of mitochondrial genetic code in urochordate mitochondria2011

    • Author(s)
      Yokobori, S., K.Watanabe, A.Yamagishi
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜(2011/12)
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] 深海性二枚貝シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析2011

    • Author(s)
      小澤元希、島村繁、高木善弘、横堀伸一、丸山正、吉田尊雄
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      横浜(2011/12)
    • Year and Date
      2011-12-14
  • [Presentation] tRNAから見た遺伝暗号の進化2011

    • Author(s)
      横堀伸一
    • Organizer
      第4回アストロバイオロジーネットワークワークショップ
    • Place of Presentation
      神戸(2011/11)
    • Year and Date
      2011-11-27
  • [Presentation] ミトコンドリアゲノムに基づく尾索動物の分子系統解析2011

    • Author(s)
      大曽根祐、廣瀬裕一、和田洋、西川淳、倉林敦、山岸明彦、横堀伸一
    • Organizer
      日本動物学会第82回年次大会
    • Place of Presentation
      旭川、北海道
    • Year and Date
      2011-09-21

URL: 

Published: 2013-06-26  

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