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2010 Fiscal Year Annual Research Report

転写制御におけるクロマチンダイナミズムを規定するシス及びトランス因子の機能解析

Research Project

Project/Area Number 21570185
Research InstitutionMeisei University

Principal Investigator

清水 光弘  明星大学, 理工学部, 教授 (80231364)

Keywordsゲノム / 遺伝子 / 転写制御 / クロマチン / ヌクレオソーム / ヒストン / DNA構造 / 酵母
Research Abstract

本研究は、出芽酵母において、ヌクレオソームの配置を規定するシス因子(DNA構造因子)とトランス因子(クロマチン関連因子、ヒストンバリアント)を解析することによって、遺伝子の転写制御におけるヌクレオソームのダイナミズムとその分子機構を加卿oで明らかにすることを目的としている。
1.シス因子(DNA構造因子)によるヌクレオソーム構造の多様性とその機能
酵母ミニ染色体を用いて、神経筋疾患に関与する(CTG)_n、と(ATTCT)_nはヌクレオソームの形成を促進することをin vivoで見出した。また、(CTG)_nをPHO5プロモーター領域に挿入すると、転写活性化条件であるにもかかわらず、PHO5の発現が著しく抑制されることを示した。これらの配列のヌクレオソームの形成能を明らかにするために、(CTG)_30または(ATTCT)_22を含む146bpのヌクレオソームをin vivoで再構成した。micrococcal nucleaseによる消化実験の結果、DNA配列によってヌクレオソームの微細構造に多様性があるという、新しい概念が示唆された。さらに、(CTG)_30のヌクレオソームの結晶化に成功し、現在、X線結晶構造解析を進めている。
2.in vivoにおけるヌクレオソームの形成・配置決定におけるトランス因子の機能解析
減数分裂初期遺伝子群の転写制御におけるIsw2クロマチンリモデリング因子、Rpd3ヒストン脱アセチル化酵素が関与する機構について、それらの変異株を作製して解析した。一方では、ヒトのヒストンH3バリアントH3.1、H3.2、H3.3を出芽酵母で発現する菌株の遺伝学的解析を行った。現在、ヒトと出芽酵母のH3の違いを明確にする目的で、出芽酵母のヒストンH4の遺伝子座をヒトH4遺伝子に置換して、出芽酵母細胞内でヒトの(H3-H4)4に置換された菌株の作製を進めている。

  • Research Products

    (6 results)

All 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] 5-bromodeoxyuridine induces transcription of repressed genes with disruption of nucleosome positioning.2010

    • Author(s)
      Miki, K., Shimizu, M., Fujii, M., Takayama, S., Hossain, M.N., Ayusawa, D.
    • Journal Title

      FEBS Journal

      Volume: 277 Pages: 4539-4548

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNA配列によるヌクレオソーム形成の促進と転写制御2010

    • Author(s)
      清水光弘、藤田亮、富田伸之、森智、神庭昂平、小林玄太、松浦徹、諸橋伸行
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、神戸
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] 出芽酵母の転写活性化・抑制因子Ume6における天然変性領域の機能解析2010

    • Author(s)
      諸橋伸行、大島えりか、藤田仁、大島綾子、Mitchell, AP、清水光弘
    • Organizer
      BMB2010(第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、神戸
    • Year and Date
      20101207-20101210
  • [Presentation] ヌクレオソーム形成促進配列と転写制御2010

    • Author(s)
      清水光弘
    • Organizer
      平成22年度遺伝研研究会 細胞核超分子複合体の動態とその機能
    • Place of Presentation
      国立遺伝学研究所、三島(依頼講演)
    • Year and Date
      20101021-20101022
  • [Presentation] 酵母ゲノムでのシスおよびトランス因子の変異によるヌクレオソームの機能解析2010

    • Author(s)
      清水光弘
    • Organizer
      第19回酵母合同シンポジウム-イノベーションを推進する酵母研究-
    • Place of Presentation
      東京大学、東京
    • Year and Date
      20100624-20100625
  • [Presentation] クロマチン構造をシスに制御するDNA因子と転写制御2010

    • Author(s)
      諸橋伸行、渋沢庸一、清水光弘
    • Organizer
      第54回日本薬学会関東支部会
    • Place of Presentation
      東京薬科大学、東京
    • Year and Date
      2010-10-02

URL: 

Published: 2012-07-19  

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