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2011 Fiscal Year Annual Research Report

放線菌遺伝子水平移動機構の解明

Research Project

Project/Area Number 21580090
Research InstitutionShinshu University

Principal Investigator

片岡 正和  信州大学, 工学部, 准教授 (90332676)

Keywords微生物遺伝 / ゲノム進化 / 放線菌 / 接合伝達 / TraB / 局在 / 発現
Research Abstract

TraBタンパク質発現の時空間制御の解明
【目的】放線菌は、気中菌糸の形成など高度な分化を示す。TraBの発現をリアルタイム解析手法で明らかにし、TraB発現の時空間制御を解明する。
【成果】放線菌遺伝子水平移動の中心的役目を持つTraBのリアルタイム追跡プローブTraB-GFPを用いて、野性型のTraBの発現と局在を明らかにし、明白な膜局在タンパク質であることを明らかにした。
局在決定ドメインの決定
【目的】TraBは膜に局在しているが、局在に必要なドメインは、見つかっていない。TraBの機能構造を明らかにするため、膜局在ドメインを決定する。
【成果】TraB領域に様々な欠失変異を持つTraB-GFP融合タンパク質発現系を構築し、膜局在に必要な領域の特定と最小領域の確定を行った。
TraBタンパク質のATP結合ドメインの機能
【目的】TraBタンパク質によるDNA輸送の際のエネルギー供給を明らかにするためATP結合ドメインの活性とDNA輸送との関連を調べる。
【成果】TraBの大腸菌を用いた発現系を構築し、TraBのATPase活性をATP transporterの活性測定法をやマカライトグリーンを用いた活性測定法で確認した。多数の点突然変異TraBを作製、それらのATPase活性を測定し、必要な残基の確定を行った。その結果よりATPase活性とプラスミド伝達活性の密接な関連を明らかにした。
TraBタンパク質を含む複合体
【目的】TraBタンパク質を含む複合体を解析する。
【成果】TraBとTraAタンパク質の物理的結合と機能相補の時空間的タイミングを明らかにした。

  • Research Products

    (15 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (2 results) Presentation (12 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] 合成生物学の潮流と展望2011

    • Author(s)
      片岡正和
    • Journal Title

      バイオサイエンスとインダストリー

      Volume: 69 Pages: 192-195

  • [Journal Article] ゲノム合成時代の幕開け2011

    • Author(s)
      片岡正和, 板谷光泰
    • Journal Title

      遺伝

      Volume: 65 Pages: 5-7

  • [Presentation] 放線菌における接合伝達のしくみと合成生物学への応用可能性2012

    • Author(s)
      片岡正和
    • Organizer
      日本農芸化学会年会シンポ
    • Place of Presentation
      京都(招待講演)
    • Year and Date
      2012-03-25
  • [Presentation] 枯草菌-放線菌細胞融合による放線菌染色体への遺伝子の導入2012

    • Author(s)
      松田卓也、板谷光泰、片岡正和
    • Organizer
      日本農芸化学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2012-03-25
  • [Presentation] 線状プラスミドSAP1を用いた遺伝子クラスター輸送システムの構築2012

    • Author(s)
      松田卓也、藤森友真、池田治生、片岡正和
    • Organizer
      日本農芸化学会年会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2012-03-24
  • [Presentation] 線状プラスミドSAP1を用いた放線菌遺伝子クラスター操作システムの構築2012

    • Author(s)
      松田卓也、池田治生、片岡正和
    • Organizer
      日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2012-03-11
  • [Presentation] Conjugative transfer of Streptomyces : the mechanism and application for genome design2011

    • Author(s)
      Masakazu Kataoka
    • Organizer
      JST-BBRC joint UK-Japan Workshop on Microbial Systems Biology
    • Place of Presentation
      Tsuruoka, Yamagata, Japan(招待講演)
    • Year and Date
      2011-10-25
  • [Presentation] 実践的ゲノムデザインをめざして2011

    • Author(s)
      片岡正和
    • Organizer
      日本遺伝学会年会WS
    • Place of Presentation
      京都(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-22
  • [Presentation] Analysis of conjugative transfer of Streptomyces avermitilis linear plasmid SAP12011

    • Author(s)
      Atsushi Suzuki, Takuya Matsuda, Haruo Ikeda, Masakazu Kataoka
    • Organizer
      国際微生物連合会議(IUMS2012)
    • Place of Presentation
      Sapporo
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Presentation] A novel insight of Streptomyces plasmid transfer : clt (cis -acting locus of plasmid transfer) of pSN22 functions in horizontal transfer of the chromosome and the plasmid2011

    • Author(s)
      Tetsu Miyatake, Masakazu Kataoka
    • Organizer
      国際微生物連合会議(IUMS2012)
    • Place of Presentation
      Sapporo
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Presentation] The ATPase activity of TraB protein on Streptomyces plasmid pSN22 is essential for the conjugative transfer2011

    • Author(s)
      Yukihiro Fuseya, Masakazu Kataoka
    • Organizer
      国際微生物連合会議(IUMS2012)
    • Place of Presentation
      Sapporo
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Presentation] 線状プラスミドSAP1の解析2011

    • Author(s)
      鈴木温司、松田卓也、池田治生
    • Organizer
      日本放線菌学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Presentation] 放線菌接合伝達の新側面:放線菌プラスミドpSN22の接合伝達におけるcltの機能2011

    • Author(s)
      宮武徹、片岡正和
    • Organizer
      日本放線菌学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Presentation] 伝達性プラスミドpSN22の接合伝達必須タンパク質TraBの解析2011

    • Author(s)
      伏屋友希弘、宮武徹、片岡正和
    • Organizer
      日本放線菌学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2011-09-08
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.kankyo.shinshu-u.ac.jp/~kataokalab/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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