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2010 Fiscal Year Annual Research Report

リベロマイシン誘導体創製に向けた新規生合成酵素群の反応機構解明

Research Project

Project/Area Number 21580104
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

高橋 俊二  独立行政法人理化学研究所, 化学情報・化合物創製チーム, 専任研究員 (30311608)

KeywordsリベロマイシンA / ポリケチド / 放線菌 / 生合成
Research Abstract

以下の3項目の研究を実施した。
1.遺伝子破壊と中間代謝産物の解析:放線菌(Streptomyces reveromyceticus)から同定したリベロマイシン生合成遺伝子クラスター中の未知遺伝子を解析するために、λRedシステムを用いて21個の遺伝子破壊ベクターを調製し、各遺伝子破壊株の構築と蓄積する代謝産物の解析を行った。新たに注目したRevG遺伝子破壊株から、ポリケチド合成酵素により生成すると考えられるRM-A1aが蓄積することを見出した。ポリケチド鎖修飾以前の生合成鍵中間体と考えられることから、RM-A1aを起点とした生合成解析が重要である事が示唆された。さらに、各種の遺伝子破壊株を解析した結果、不安定中間体を経由する生合成ステップが見出されたことから、遺伝子破壊株の解析に加えて、生化学的解析が生合成機構の解明に必須である事が予想された。
2.生化学的解析:フラビン(FAD)依存酸化酵素機能解明に向けて、大腸菌を用いた異種発現系を詳細に検討したところ、発現が困難であったFAD依存酵素の可溶化と精製酵素の調製に成功した。さらに、遺伝子破壊株を用い隔た生理的基質の調製を進め、反応機構を解析する基盤を構築した。脂肪酸-ポリケチドハイブリット形成に必要な鍵酵素について、酵素化学的性質を詳細に検討し、不飽和脂肪酸特異的に反応を行うことが出来る脂肪酸-CoAリガーゼ機能を明らかにした。
3.X線結晶解析情報を基にした新規酵素反応の創出
P450-リベロマイシンEの共結晶解析データを利用して、新規誘導体創製に向けた部位特異変異導入を進めた。また、脂肪酸-CoAリガーゼの精製条件及び結晶化条件の検討を進めた。

  • Research Products

    (18 results)

All 2011 2010

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Gene disruption and biochemical characterization of verruculogen synthase of Aspergillus fumigates2011

    • Author(s)
      Kato N.
    • Journal Title

      Chembiochem.

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Biochemical characterization of a novel indole prenyltransferase from Streptomyces sp.SN-5932010

    • Author(s)
      Takahashi S.
    • Journal Title

      J.Bacteriol.

      Volume: 192 Pages: 2839-2851

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular cloning and characterization of a broad substrate terpenoid oxidoreductase from Artemisia annua2010

    • Author(s)
      Ryden A.M.
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 51 Pages: 1219-1228

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Verticilactam, a new macrolactam isolated from a microbial metabolite fraction library2010

    • Author(s)
      Nogawa T.
    • Journal Title

      Org.Lett

      Volume: 12 Pages: 4564-4567

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 遺伝子破壊によるリベロマイシン生合成機構の解析2011

    • Author(s)
      高橋俊二
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] リベロマイシン生合成におけるバイヤー・ビリガー酸化反応解析2011

    • Author(s)
      熊野匠人
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] ブチルマロニル-CoA生合成機構の解析2011

    • Author(s)
      宮澤岳
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] 放線菌由来新規フラキノシン類縁体の同定2011

    • Author(s)
      高木海
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] Identification of biomediators that enhance reveromycin A production in Streptomyces reveromyceticus2011

    • Author(s)
      Suresh Panthee
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] 分子内peroxide架橋形成を触媒するverruculogen合成酵素FtmFの機能解析・結晶化2011

    • Author(s)
      奥村英夫
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] Streptomyces sp.RK95-74株が生産する代謝産物の生合成遺伝子群の解析2011

    • Author(s)
      植木雅志
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] 微生物代謝産物フラクションライブラリーからの化合物探索を目的としたLC/MSデータプロットの作製2011

    • Author(s)
      野川俊彦
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      京都・京都女子大
    • Year and Date
      20110325-20110328
  • [Presentation] Analysis of Reveromycin A Biosynthetic Gene Cluster2010

    • Author(s)
      高橋俊二
    • Organizer
      2010 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
    • Place of Presentation
      米国・ハワイ・コンベンションセンター
    • Year and Date
      20101215-20101220
  • [Presentation] 微生物代謝産物フラクションライブラリーより単離した新規マクロラクタムの構造2010

    • Author(s)
      野川俊彦
    • Organizer
      第52回天然有機化合物討論会
    • Place of Presentation
      静岡市・グランシップ
    • Year and Date
      20100929-20101001
  • [Presentation] リベロマイシンAのスピロアセタール環化機構の解析2010

    • Author(s)
      高橋俊二
    • Organizer
      日本放線菌学会
    • Place of Presentation
      東京・タワーホール船堀
    • Year and Date
      20100902-20100903
  • [Presentation] Development of screening system and identification of biomediators of reveromycin A biosynthesis2010

    • Author(s)
      Suresh Panthee
    • Organizer
      日本放線菌学会
    • Place of Presentation
      東京・タワーホール船堀
    • Year and Date
      20100902-20100903
  • [Book] In Comprehensive Natural Products II Chemistry and Biology2010

    • Author(s)
      Kuzuyama T.
    • Total Pages
      493-516
    • Publisher
      Elsevier : Oxford
  • [Patent(Industrial Property Rights)] リベロマイシンAまたはその生合成中間体の製造法およびスピロケタール環含有化合物の製造方法2010

    • Inventor(s)
      長田裕之
    • Industrial Property Rights Holder
      独立行政法人理化学研究所
    • Industrial Property Number
      特願2010-194222
    • Filing Date
      2010-08-31

URL: 

Published: 2012-07-19  

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