腎細胞癌の再発、転移に関わるゲノム異常の解明

2010 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21590373
• Research Institution: Oita University
• Principal Investigator: 松浦 恵子 大分大学, 医学部, 准教授 (00291542)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 守山 正胤 大分大学, 医学部, 教授 (90239707)
• Keywords: アレイCGH / 腎細胞癌 / 再発 / メチル化 / ゲノム異常

Research Abstract

本研究では、腎癌の予後を規定する転移に関わる分子の同定をめざし、腎細胞癌の手術時採取された原発巣と再発転移巣のゲノム異常(ゲノムコピー数異常とゲノムの異常メチル化)を解析し比較することで再発(転移)に関わる遺伝子異常を同定することを目的としている。
(1)腎細胞癌の原発巣、転移巣のゲノム異常(コピー数異常)を網羅的に解析し、原発巣と転移巣の違いを明らかにしている。今回、腎癌細胞株について、原発巣ならびに転移巣で見いだされたゲノム異常を有する細胞株を特定した。
(2)ゲノムの高度メチル化領域の網羅的解析から絞り込まれた抽出された高度メチル化候補遺伝子について、腎癌症例のゲノムDNAをbisulfite処理し、それぞれDNA modification kitを用いたメチル化特異的PCR法によって、正常部分と癌部のゲノムでのメチル化の有無を確認した。
(3)さらに、Agilent社製の4x44K発現解析用アレイを用いて腎癌細胞株におけるトランスクリプトーム解析を行い、ゲノムコピー数異常を認めた領域において、発現上昇あるいは発現低下している遺伝子を抽出した。
これらの結果から、chromosome 9pの欠失がみられる症例ほど、再発(転移)までの期間が短いこと、9pに存在する遺伝子が、再発(転移)にとって重要である可能性が示唆された。今後、これらの解析により抽出された遺伝子の発現変化をリアルタイムPCRで確認し、候補遺伝子の機能解析を行うことで、再発(転移)に関わる遺伝子異常の同定とそのメカニズムを解明する予定である。

Research Products

• [Journal Article] Genomic profiling of gastric carcinoma in situ and adenomas by array-based comparative genomic hybridization. (2010)
  • Author(s): Uchida M, Tsukamoto Y, Uchida T, Ishikawa Y, Nagai T, Hijiya N, Tung N, Nakada C, Kuroda A, Okimoto T, Kodama M, Murakami K, Noguchi T, Matsuura K, Tanigawa M, Seto M, Ito H, Fujioka T, Takeuchi I, Moriyama M.
  • Journal Title: Journal of Pathology Volume: 221 Pages: 96-105
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] MicroRNA-375 is down-regulated in gastric carcinomas and regulates cell survival by targeting PDK1 and 14-3-3ζ. (2010)
  • Author(s): Tsukamoto Y, Nakada C, Noguchi T, Tanigawa M, Tung N, Uchida T, Hijiya N, Matsuura K, Fujioka T, Seto M, Moriyama M.(equal contribution)
  • Journal Title: Cancer Research Volume: 70 Pages: 2339-2349
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 腎癌転移と9pゲノムコピー数異常の関係 (2011)
  • Author(s): 成松隆弘, 松浦恵子, 中田知里, 井上亨, 野村威雄, 佐藤文憲, 守山正胤, 三股浩光
  • Organizer: 第20回分子細胞研究会
  • Place of Presentation: 三重県津市
  • Year and Date: 2011-03-12
• [Presentation] Array CGH analysis of renal cell carcinomas in patients with end-stage renal disease (2010)
  • Author(s): Inoue T, Yoshimoto T, Matsuura K, Narimatsu T, Nakada C, Nagashima Y, Hatakeyama S, Sato F, Oyama C, Habuchi T, Nakagawa M, Moriyama M, Mimata H
  • Organizer: 第62回日本泌尿器科学会西日本総会
  • Place of Presentation: 鹿児島県鹿児島市
  • Year and Date: 2010-11-05
• [Presentation] Array CGH analysis of renal cell carcinomas in patients with end-stage renal disease (2010)
  • Author(s): Inoue T, Yoshimoto T, Narimatsu T, Nagashima Y, Matsuura K, Hatakeyama S, Sato F, Ohyama C, Habuchi T, Nakagawa M, Moriyama M, Mimata H
  • Organizer: 69^<th> Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • Place of Presentation: 大阪府大阪市
  • Year and Date: 2010-09-24
• [Presentation] Genomic copy number loss at 9p is associated with metastasis of renal cell carcinoma. (2010)
  • Author(s): Narimatsu T, Inoue T, Yoshimoto T, Nakada C, Matsuura K, Sato F, Seto M, Mimata H, Moriyama M
  • Organizer: 69^<th> Annual Meeting of the Japanese Cancer Association
  • Place of Presentation: 大阪府大阪市
  • Year and Date: 2010-09-23
• [Presentation] 転移性腎癌におけるゲノムコピー数異常の増加 (2010)
  • Author(s): 成松隆弘, 井上享, 吉本多一郎, 中田知里, 松浦恵子, 守山正胤, 瀬戸加大, 佐藤文憲, 三股浩光
  • Organizer: 第98回日本泌尿器科学会総会
  • Place of Presentation: 岩手県盛岡市
  • Year and Date: 2010-04-29
• [Presentation] 透析腎癌の網羅的ゲノム解析 (2010)
  • Author(s): 井上享, 吉本多一郎, 成松隆弘, 中田知里, 松浦恵子, 守山正胤, 瀬戸加大, 長嶋洋治, 佐藤文憲, 羽渕友則, 三股浩光
  • Organizer: 第98回日本泌尿器科学会総会
  • Place of Presentation: 岩手県盛岡市
  • Year and Date: 2010-04-28