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2011 Fiscal Year Annual Research Report

がんにおけるDNA高度メチル化を指標としたバイオマーカーの探索

Research Project

Project/Area Number 21590425
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

福重 真一  東北大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (90192723)

Keywords遺伝子 / 発現制御 / 転写抑制 / メチルCpG結合蛋白 / エピジェネティクス / MeTA / マイクロアレイ
Research Abstract

本研究では申請者が開発したMeTA(Methyl-CpG targeted transcriptional activation)法と遺伝子発現マイクロアレイの組み合わせ(MeTA-array)によってがん細胞において高度にメチル化したCpGアイランド、およびその制御下にある遺伝子を見つけ出し、がんへの関与や診断・治療のバイオマーカーとしての可能性を検討することを目的とした。
MeTA-arrayを用い、膵がんにおける高メチル化遺伝子を探索するため、12種の膵がん細胞株についてMeTA-arrayを実施した。半定量RT-PCRによりマイクロアレイデータを検証した結果、正常膵管上皮細胞株HPDEで発現が高く、12種の膵がん細胞株で共通に発現低下している7遺伝子(NEFL、NEFM、NEFH、IRX4、TMEM204、LHX6、NPTX2)を同定した。このうち4遺伝子はMeTA-arrayによってはじめて同定された膵がん高メチル化候補遺伝子であった。次に、NEFL、NEFM、NEFH、IRX4、TMEM204の5遺伝子についてHPDEと21種の膵がん細胞株を用いプロモーター領域のメチル化の有無、程度をメチル化特異的PCR(MSP)法で解析した。HPDEではいずれの遺伝子も非メチル化であったが、膵がん細胞株ではNEFL、NEFM、NEFH、IRX4で100%(21/21)、TMEM204で95%(20/21)がメチル化していることが明らかとなった。さらに、手術切除標本から、腫瘍部と非腫瘍部のゲノムDNAを採取し、NEFM、IRX4のプロモーター領域のメチル化をMSP法で解析した結果、それぞれ82%(18/22)、68%(15/22)が膵がん特異的にメチル化していた。これらの結果は、MeTA-arrayにより新規のがん特異的メチル化遺伝子の単離ができることを示している。

  • Research Products

    (6 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Road to early detection of pancreatic cancer : Attempts to utilize epigenetic biomarkers2012

    • Author(s)
      Shinichi Fukushige
    • Journal Title

      Cancer Lett

      Volume: (未定)(in press)

    • DOI

      10.1016/j.canlet.2012.03.022

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DCK is frequently inactivated in acquired gemcitabine-resistant human cancer cells2012

    • Author(s)
      Yuriko Saiki
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: (未定)(in press)

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2012.03.122

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Microarray coupled with methyl-CpG targeted transcriptional activation (MeTA-array) identifies hypermethylated genes containing the stringent criteria of CpG islands at high frequency2011

    • Author(s)
      Yuko Sato
    • Journal Title

      Epigenetics

      Volume: 6 Pages: 752-759

    • DOI

      10.4161/epi.6.6.15906

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of epigenetically silenced genes in human pancreatic cancer by a novel method "microarray coupled with methyl-CpG targeted transcriptional activation" (MeTA-array)2011

    • Author(s)
      Hideyuki Shimizu
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun

      Volume: 411 Pages: 162-167

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2011.06.121

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] メチルCpG配列を標的とする転写活性化とマイクロアレイの組み合わせはヒトがんにおける低メチル化遺伝子の同定を可能にする2011

    • Author(s)
      福重真一、陳娜、堀井明
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2011-10-03
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.med.tohoku.ac.jp/~molpath/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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