2011 Fiscal Year Annual Research Report
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21657027
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
渡邉 信久 名古屋大学, シンクロトロン光研究センター, 教授 (70212321)
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| Keywords | 蛋白質 / 生物物理 / X線 / 結晶構造 / 圧力 / ダイヤモンドアンビルセル / DAC / 好圧菌 |
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| Research Abstract |
1)SPring-8の利用
震災特別枠でSPring-8のBL41XUの利用機会を得られたため,KEK PF-ARのビームラインNW12Aの試料ゴニオにDACの搭載を可能にするためのマウントアダプタをBL41XUのゴニオ用に改造し,30keVの高エネルギーX線を使用して高圧実験を行う環境を構築した.NW12Aでは,そのビーム強度から200μm程度以上の結晶サイズが必要であるが,BL41XUでは結晶の小型化が可能であることが分かった.但し,NW12Aと比較して高輝度なためヘリカルスキャンモードの使用が必須であることも確認された.なお,通常の課題申請では不採択となったため,その後の本年度後半の実験は復旧したNW12Aで実施した.
2)好圧生物と常圧生物の相同蛋白質のキメラ蛋白質の構造解析
常圧菌と好圧菌のイソプロピルリンゴ酸脱水素酵素(IPMDH)について,それぞれ2種類及びキメラ蛋白質の常圧下での結晶構造解析を行った.それぞれの分子内空隙の大きさ,表面水和構造の差等に基づいて耐圧性の議論を行った.
3)高圧構造解析と蛋白質の耐圧性の解明
NW12Aが復旧したためIPMDHの高圧構造解析の不足していたデータ収集を実施し,圧力効果の詳細な解析を行う事が出来た.常圧菌と好圧菌のIPMDHで266番目の残基が,常圧菌ではSer,好圧菌ではAlaの差がある.常圧から600MPa程度までのデータを用いて,配位水を含めて詳細な構造解析を行った結果,このわずか1残基の変異と好圧菌IPMDHの耐圧性の関係を明らかにした.
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Research Products
(6 results)
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[Journal Article] High-pressure-induced water penetration into 3-isopropylmalate dehydrogenase2012
Author(s)
Nagae, T., Kawamura, T., Chavas, LMG., Niwa, K, Hasegawa, M., Kato, C., Watanabe, N.
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Journal Title
Acta Cryst., D
Volume: 68
Pages: 300-309
DOI
Peer Reviewed
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[Presentation] 高圧蛋白質結晶構造解析2011
Author(s)
永江峰幸, 河村高志, Leonard Chavas, 丹羽健, 長谷川正, 加藤千明, 渡邉信久
Organizer
第28回PFシンポジウム
Place of Presentation
つくば国際会議場(茨城県)
Year and Date
20110712-20110713
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