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2009 Fiscal Year Annual Research Report

蛋白質の構造変化ダイナミクス研究のための1分子科学の基盤を求めて

Research Project

Project/Area Number 21657038
Research InstitutionUniversity of Fukui

Principal Investigator

老木 成稔  University of Fukui, 医学部, 教授 (10185176)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 岩本 真幸  福井大学, 医学部, 助教 (40452122)
Keywordsチャネル / 構造変化 / ゲーティング / 構造機能相関 / 一分子計測
Research Abstract

蛋白質のダイナミクスを1分子レベルで実験を行うために最適のチャネル分子を使って、脂質平面膜法による単一チャネル電流測定を行った。対象としたチャネルはKcsAカリウムチャネルである。これは結晶構造が明らかになっているだけではなく、私達が最近構造ダイナミクスに関する新しいデータを得た唯一のチャネル蛋白質である。本研究では脂質平面膜に厳密に1分子だけが存在する条件での実験を行った。さらにpH依存性ゲーティング機構を明らかにするための高精度の実験系を確立することができた。これは予想をはるかに超えて難しい実験であったが、この困難な実験を行うことによって重要なゲーティングに関する情報を得ることができた。特にpH依存性ゲーティングに関して、2009年に解明されたKcsAチャネルの全長構造を参考にしつつ、その分子機構を検討しつつある。さらにチェンバー法では困難な急速溶液置換法(すでに開発済み)を適用できるように、KcsAチャネルをリポソームに再構成し、リポソームパッチ法を確立した。溶液置換速度が数ミリ秒以内に可能となり、定常状態の測定以外に過渡的応答を測定することが可能となった。一方、すでに確立した1分子蛋白質構造変化測定法(DXT法)の時間分解能を改善するために、フランスとスイスの高輝度放射光施設での実験を行い、従来の毎秒30フレームから毎秒5000フレームにまで上げることに成功した。1分子レベルでの構造と機能のデータを解析するための手法を開発していきたい。

  • Research Products

    (12 results)

All 2010 2009

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Single Molecular Gating Dynamics for KcsA Potassium Channel2010

    • Author(s)
      Oiki, S., H.Shimizu, M.Iwamoto, T.Konno
    • Journal Title

      Adv.Chem.Phys. (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Docking Model of Drug Binding to the Human Ether-a-go-go Potassium Channel Guided by Tandem Dimer Mutant Patch-Clamp Data : A Synergic Approach2009

    • Author(s)
      Imai, Y.N., S.Ryu, S.Oiki
    • Journal Title

      J.Med.Chem. 52

      Pages: 1630-1638

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Temperature dependence of Proton Permeation through a Voltage-Gated Proton Channel2009

    • Author(s)
      Kuno, M., H.Ando, H.Morihata, H.Sakai, H.Mori, M.Sawada, S.Oiki
    • Journal Title

      J.Gen.Physiol. 134

      Pages: 191-205

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] X線一分子追跡法により明らかになったKcsAカリウムチャネルの開閉機構2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Journal Title

      放射光 22

      Pages: 183-191

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Structural and Functional Fluctuations of the KcsA Potassium Channel2009

    • Author(s)
      Oiki, S, H.Shimizu, M.Iwamoto, T.Konno
    • Organizer
      The 3^<rd> International Symposium : Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-12-21
  • [Presentation] チャネルゲーティングの1分子構造変化ダイナミクス2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      中部日本生理学会
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2009-12-07
  • [Presentation] Single-molecular measurements for structural and functional fluctuations of KcsA potassium channel2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      第47回生物物理学会年会シンポジウム「生体分子の揺らぎをはかる」
    • Place of Presentation
      徳島
    • Year and Date
      2009-10-30
  • [Presentation] KcsAカリウムチャネル構造機能相関の1分子解析2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      第82日本生化学会大会. シンポジウム
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2009-10-17
  • [Presentation] チャネル蛋白質の1分子測定でみえる構造と機能 : イオン透過とゲーティング2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      生物物理若手の会第49回夏の学校
    • Place of Presentation
      千歳
    • Year and Date
      2009-08-03
  • [Presentation] Real time monitoring of structural changes in K-channel gating2009

    • Author(s)
      老木成稔
    • Organizer
      IUPS PSJ
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2009-07-28
  • [Presentation] Dynamics of KcsA Potassium Channel During pH-dependent Gating2009

    • Author(s)
      Oiki, S, H.Shimizu, M.Iwamoto, T.Konno
    • Organizer
      International Symposium on "Reaction Dynamics of Many-Body Chemical Systems"
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2009-06-23
  • [Book] Cell Signaling Reactions : Single-Molecular Kinetic Analysis(Eds. Y. Sako and M. Ueda)(Springer)2010

    • Author(s)
      S.Oiki
    • Publisher
      Single-Channel Structure-Function Dynamics : The Gating of Potassium Channels(印刷中)

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Published: 2011-06-16   Modified: 2016-04-21  

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