コアコレクションを利用したソルガムのアレロパシー活性に関与する染色体領域の特定

2010 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 21658002
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 奥野 員敏 筑波大学, 大学院・生命環境科学研究科, 教授 (70355460)
• Keywords: ソルガム / アレロパシー / コアコレクション / 連鎖不平衡解析 / 生物的雑草防除 / 量的形質遺伝子座(QTL)

Research Abstract

ソルガムの起源地であるアフリカでは、除草剤による雑草防除は現実的でなく、アレロパシー活性(他感作用)を利用した雑草防除は有効な手段となる。そこで、本課題では、ソルガムのアレロパシー活性の品種変異を解析し、関連するQTLの検出をめざす。
(1)SSRマーカーによる多型解析
SSRマーカーによるコアコレクションの多型解析の結果、10本の染色体で合計98座のSSRマーカー座から連鎖地図を作製した。
(2)アソシエーション解析によるQTLの検出
107品種のアレロパシー活性値とSSRマーカー98座におけるDNA遺伝子型情報を用いて解析した結果、第2および第5染色体上に高い関連性を示す領域を検出した。レタス根の伸長阻害効果を指標としてアレロパシー活性を評価すると、少なくとも3ケ所の関連領域(QTL)が存在すると考えられる。
(3)QTL解析
今年度、F_2200個体を圃場で栽培し、個体別に葉サンプルを採取しDNAを抽出した。両親品種で多型を示すSSRマーカーを選定し、連鎖地図を作製した。F2個体別に自殖F3種子を採取した。現在、F3系統を用いてアレロパシー活性を評価中である。評価終了後に、SSRマーカー遺伝子型情報と併せてQTL解析を行って、アレロパシー活性関連QTLを検出する。