2013 Fiscal Year Annual Research Report
多彩な細胞系譜の運命決定・恒常性を制御する転写因子Blimp1の統合的機能解明
Project/Area Number |
21677003
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
斎藤 通紀 京都大学, 医学研究科, 教授 (80373306)
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Project Period (FY) |
2009-05-11 – 2014-03-31
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Keywords | 発生・分化 / 遺伝子 / ゲノム / シグナル伝達 / 再生医学 |
Research Abstract |
平成24年度までの研究で開発した10,000~100,000細胞からのChIIP・seq法を用いて、試験管内における始原生殖細胞様細胞(primordial germ cell-like cells : PGCLCs)誘導系における、ヒストン修飾(H3K4me3, H3K27ac, H3K27me3, H3K9me2)の変化とBLIMP1の結合部位の解析を行った。その結果、PGCLC形成過程の各段階における多数のエンハンサー配列の同定、Polycomb Complexにより抑制される標的遺伝子・ゲノム部位の同定、H3K9me2の消去過程、BLIMP1の結合とH3K27me3修飾付与関係の解明などに成功した。現在これら知見を総合し、PGC形成過程に随伴するクロマチン動態に関するモデルを提唱する論文を作成中である。 また生殖系列特異的遺伝子破壊を可能とするstella-MER-Cre-MERマウスを用いて、生殖系列の増殖・機能維持におけるBlimp1の機能の解析を遂行中(BLIMP1が後期PGCsの形質維持に必須であることを証明した)であるのと同時に、EGFP・Blimp1ホモノックインES細胞に由来するマウスを用いて、発生過程・成体における、Blimp発現細胞を網羅的に同定・記述し、その中で、形質細胞、小腸上皮、網膜などにおけるBLIMP1の結合部位の同定をChIP・seq法により行い、BLIMPIの作用機序を統合的に解析中である。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
少数細胞からの定量的なChIP-seq法の開発が様々な困難を伴ったことと、ChIP-seq法に必要な量GCLCsを得るのに時間を要したことによるが、これらの困難をすでに克服し、現在は当初想定した目的達成に向けた最終段階にある。
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Strategy for Future Research Activity |
上述した問題があったものの、研究は着実に進展し、当初想定した目的達成に向けた最終段階にある。
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Research Products
(33 results)
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[Journal Article] Cell-to-cell expression variability followed by signal reinforcement progre ssively segregates early mouse lineages2014
Author(s)
Ohnishi Y, Huber W, Tsumura A, Kang M, Xenopoulos P, Kurimoto K, Oles A. K., Arauzo-Bravo M. J., Saitou M, Hadjantonakis A, Hiiragi T
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Journal Title
Nature Cell Biology
Volume: 16
Pages: 27-37
Peer Reviewed
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[Journal Article] A Mesodermal Factor, T, Specifies Mouse Germ Cell Fate by Directly Activating Germline Determinants2013
Author(s)
Aramaki S, Hayashi K, Kurimoto K, Ohta H, Yabuta Y, Iwanari H, Mochizuki Y, Hamakubo T, Kato Y, Shirahige K, Saitou M
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Journal Title
Developmental Cell
Volume: 27
Pages: 516-529
DOI
Peer Reviewed
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