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2011 Fiscal Year Annual Research Report

励起状態における分子間相互作用理論の高度化

Research Project

Project/Area Number 21685002
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

長谷川 淳也  京都大学, 福井謙一記念研究センター, 准教授 (30322168)

Keywords励起状態 / 分子間相互作用 / 分子軌道局在化法 / ソルバトクロミズム / オプシンシフト / 励起エネルギー移動
Research Abstract

本研究は、光合成・視覚・発光などの光過程において、励起状態における機能発現と分子間相互作用の関わりを、理論的に明らかにするために、分子の励起状態と周辺環境の分子間相互作用理論を高度化することを目的としている。平成23年度においては、昨年度に引き続き、以下の研究を進めた。
(1)ヒト視物質とバクテリオロドプシン(bR)の励起状態における蛋白質の量子的効果:昨年度開発した分子軌道の局在化法を用いて、配置間相互作用計算を行い、励起エネルギー変換の起源を、量子的効果を考慮し、アミノ酸レベルの寄与を解析した。その結果、ヒト視物質における周辺蛋白質の寄与はの各錐体においてほぼ等しく、カラーチューニングへの影響は小さかった。しかし、bRでは隣接するπ性アミノ酸残基がCT相互作用により無視できない寄与をすることが分かった。更には、蛋白質の励起波動関数の構造が明らかになり、今後の理論的モデルの構築に重要な情報を得た。具体的には、色素-残基間のCT、残基におけるエキシトンにほぼ限定されることが分かった。
(2)励起エネルギー移動におけるトンネリング因子の評価と解析:局在化分子軌道を励起エネルギー移動の解析に応用した。種々のドナー(D)-ブリッジ(B)-アクセプター(A)系についてテストした結果、DやAの準位とBの準位が近接すればBを経由する間接的励起移動が起こりうること、多数のステップを経由する励起移動のトンネリング因子の大きさは、D-A間距離に対して指数関数的に減衰すること、長距離では直接移動や1,2個のBを経由する移動経路が主要になることが明らかになった。
(3)光合成色素蛋白質複合体PSII反応中心の励起状態と分子間相互作用:PSIIと紅色細菌の反応中心について励起状態を解析し、光吸収スペクトルを帰属した。また、両者のスペクトルの差異について、色素の空間配置と蛋白質の構造に起源を見出した。

  • Research Products

    (21 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (11 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Chronological Change from Face-On to Edge-On Ordering of Zinc Tetraphenylporphyrin at Phenyloctane-HOPG Interface2012

    • Author(s)
      J. Hasegawa, K. Higashiguchi, and K. Matsuda
    • Journal Title

      Chem. Asian J.

      Volume: 7(2) Pages: 394-399

    • DOI

      DOI:10.1002/asia.201100587

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Kinetic investigation on carbamate formation from the reaction of carbon dioxide with amino acids in homogeneous aqueous solution2012

    • Author(s)
      Y. Yamamoto, J. Hasegawa, and Y. Ito
    • Journal Title

      J. Phys Org. Chem

      Volume: 25(3) Pages: 239-247

    • DOI

      DOI:10.1002/poc.1900

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Color tuning in human cone visual pigments : the role of the protein environment2012

    • Author(s)
      J.Hasegawa, K.Fujimoto, H.Nakatsuji
    • Journal Title

      Progress in Theoretical Physics and Chemistry

      Volume: (印刷中)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Excitation Energy Transfer in GFP-X-CFP Model Peptides (X=amino acids) : directvs. through-bridge energy transfers2012

    • Author(s)
      T.Kawatsu, J.Hasegawa
    • Journal Title

      Intern.J.Quantum.Chem.

      Volume: (印刷中)

    • DOI

      10.1002/qua.24027

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Bridge-Mediated Excitation Energy Transfer Pathways through Protein Media : a Slater Determinant-Based Electronic Coupling Calculation Combined with Localized Molecular Orbitals2011

    • Author(s)
      T. Kawatsu, K. Matsuda, and J. Hasegawa
    • Journal Title

      J. Phys Chem. A

      Volume: 115(39) Pages: 10814-10822

    • DOI

      DOI:10.1021/jp2068792

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Chemical-intuition based LMO transformation simplifies excited-state wave functions of peptides2011

    • Author(s)
      J. Hasegawa, T. Kawatsu, K. Toyoya, and K. Matsuda
    • Journal Title

      Chem. Phys. Letters

      Volume: 508(1-3) Pages: 171-176

    • DOI

      DOI:10.1016/j.cplett.2011.04.028

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Color tuning in photo-functional proteins2011

    • Author(s)
      J. Hasegawa K. J. Fujimoto, and H. Nakatsuji
    • Journal Title

      Nakatsuji Chem Phys Chem

      Volume: 12(17) Pages: 3106-3115

    • DOI

      DOI:10.1002/cphc.201100452

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical study of the excited states and the redox potentials of unusually distorted β-trifluoromethylporphycene2011

    • Author(s)
      J.Hasegawa, K.Matsuda
    • Journal Title

      Theoret.Chem.Acc.

      Volume: 130 Pages: 175-185

    • DOI

      10.1007/s00214-011-0950-8

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Theoretical Study of the Excited States of the Photosynthetic Reaction Center in Photosystem II : Electronic Structure, Interactions, and Their Origin2011

    • Author(s)
      Y.Kitagawa, K.Matsuda, J.Hasegawa
    • Journal Title

      Biophys.Chem.

      Volume: 159 Pages: 227-236

    • DOI

      10.1016/j.bpc.2011.06.011

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 光生物学システムの励起状態と機能への理論的アプローチ2012

    • Author(s)
      長谷川淳也
    • Organizer
      日本化学会第92春季年会(第2次先端ウオッチング)
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学(神奈川県)(依頼講演)
    • Year and Date
      2012-03-26
  • [Presentation] 光機能性蛋白質における励起状態と分子間相互作用2012

    • Author(s)
      長谷川淳也
    • Organizer
      計算科学研究センター・ワークショップ「バイオサイエンスに対する計算分子科学からのアプローチ」
    • Place of Presentation
      分子科学研究所(愛知県)(招待講演)
    • Year and Date
      2012-01-25
  • [Presentation] 参照軌道を用いた分子軌道の局在化法:レチナール蛋白質の励起状態への応用2012

    • Author(s)
      長谷川淳也、藤本和宏、河津励
    • Organizer
      第9回福井謙一記念研究センターシンポジウム
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2012-01-06
  • [Presentation] 光機能性蛋白質のカラーチューニング2011

    • Author(s)
      長谷川淳也
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー"タンパク質科学の未来を語る-実験・理論研究者の対話-"
    • Place of Presentation
      大阪大学(依頼公演)
    • Year and Date
      2011-11-22
  • [Presentation] 参照軌道を用いた分子軌道の局在化法:励起状態への応用2011

    • Author(s)
      長谷川淳也、河津励、松田建児
    • Organizer
      第5回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2011-09-20
  • [Presentation] Excited states of photo-functional proteins : SAC-CI study2011

    • Author(s)
      J.Hasegawa
    • Organizer
      The 16-th Quantum Systems in Chemistry and Physics
    • Place of Presentation
      石川県立美術館(石川県)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-12
  • [Presentation] Theoretical study on the excited states and molecular interactions of photo-functional proteins2011

    • Author(s)
      J.Hasegawa
    • Organizer
      The 14-th Asian Chemical Congress
    • Place of Presentation
      Bangkok (Thailand)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-09-02
  • [Presentation] Excited states of photo-functional proteins2011

    • Author(s)
      J.Hasegawa
    • Organizer
      Fukui International Symposium for Theoretical Chemistry
    • Place of Presentation
      京都大学(招待講演)
    • Year and Date
      2011-08-31
  • [Presentation] Quantum chemistry of the excited states of photo-functional proteins : physical, chemical, and biological origins of the color-tuning2011

    • Author(s)
      J.Hasegawa
    • Organizer
      Bioinfomatics in Torun-BIT11
    • Place of Presentation
      N.Copernicus University(ポーランド)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-02
  • [Presentation] Excited states of photo-functional proteins : SAC-CI study2011

    • Author(s)
      J.Hasegawa
    • Organizer
      The 4-th Japan-Czech-Slovakia Symposium on Theoretical Chemistry
    • Place of Presentation
      Prague(チェコ)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-05-19
  • [Presentation] 参照軌道を用いる局在化法:励起状態への応用2011

    • Author(s)
      長谷川淳也、河津励、松田建児
    • Organizer
      第14回理論化学討論会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2011-05-14
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fukui.kyoto-u.ac.jp/users/hasegawa/

URL: 

Published: 2013-06-26  

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