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2011 Fiscal Year Annual Research Report

ポリユビキチン鎖認識の構造生物学

Research Project

Project/Area Number 21687009
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

深井 周也  東京大学, 放射光連携研究機構, 准教授 (10361792)

Keywordsユビキチン / X線結晶構造解析 / シグナル伝達 / 生体分子 / 蛋白質 / 分子認識
Research Abstract

ユビキチン(Ub)は酵母からヒトまで広く保存されたタンパク質であり,鎖状につながった複数個のUb(Ub鎖)がタンパク質分解のシグナルとしてはたらくことが一般に知られている.一方,タンパク質分解以外の様々な分子シグナリングにおける重要性も次々と明らかにされてきている.本研究では,Ub鎖と結合タンパク質との複合体の立体構造をX線結晶構造解析によって決定し,変異体を用いた機能解析と合わせて,多様なUb鎖識別メカニズムを解明する.これまでに,我々は,Lys63結合型Ub鎖(K63鎖)に特異的な切断酵素や受容体とK63鎖との複合体の立体構造を決定し,その認識メカニズムを解明してきた(Sato et al., Nature, 455, 358-362 ; Sato et al., EMBO J., 28, 2461-2468, 2009 ; Sato et al., EMBO J., 28, 3903-3909, 2009 ; Yoshikawa et al., FEBS Lett., 583, 3317-3322, 2009).今年度は,Met1を介して結合したUb鎖(直鎖)に特異的なZnフィンガー型のUb鎖受容体と直鎖特異的なUb鎖受容体がNF-KBシグナリングの活性化に重要であることを明らかにし,その複合体の結晶構造と変異体を用いた結合アッセイおよびレポーターアッセイと合わせて,直鎖特異的な認識メカニズムを報告した(Sato et al., PNAS, 108, 20520-20525).また,DNA二重鎖切断修復においてK63鎖の伸長を抑制するタンパク質複合体の結晶構造決定にも成功した.立体構造に基づいた変異体解析の結果と合わせて論文を投稿し,現在改訂中である.

  • Research Products

    (4 results)

All 2011

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Specific recognition of linear ubiquitin chains by the Npl4 zinc finger (NZF) domain of the HOIL-1L subunit of the linear ubiquitin chain assembly complex2011

    • Author(s)
      Sato, Y., Fujita, H., Yoshikawa, A., Yamashita, M., Yamagata, A., Kaiser, S.E., Iwai, K., Fukai, S.
    • Journal Title

      PNAS

      Volume: 108 Pages: 20520-20525

    • DOI

      doi:10.1073/pnas.1109088108

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure and function of a membrane component SecDF that enhances protein export2011

    • Author(s)
      Tsukazaki, T., Mori, H., Echizen, Y., Ishitani, R., Fukai, S., Tanaka, T., Perederina, A., Vassylyev, D.G., Kohno, T., Maturana, A.D., Ito, K., Nureki, O.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 474 Pages: 235-238

    • DOI

      doi:10.1038/nature09980

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 構造解析のためのユビキチン鎖の大量合成2011

    • Author(s)
      深井周也
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-09
  • [Presentation] Structural basis of ubiquitin chain recognition by NZF domains for NF-κB activation2011

    • Author(s)
      深井周也
    • Organizer
      TNF2011(第13回国際TNF会議)
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-05-18

URL: 

Published: 2013-06-26  

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