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2012 Fiscal Year Annual Research Report

木構造データに対する汎用性の高い類似度計算技術の開発

Research Project

Project/Area Number 21700178
Research InstitutionDoshisha University

Principal Investigator

深川 大路  同志社大学, 文化情報学部, 助教 (10442518)

Project Period (FY) 2009-04-01 – 2013-03-31
Keywords木構造 / 類似度 / 近似パターン照合 / アルゴリズム
Research Abstract

本研究は、木構造によって表現され得る様々なデータを対象に、近似パターン照合や類似度計算を効率良く行うための汎用的な枠組みとアルゴリズムの提案および実装を目指している。前年度までの研究によって、いくつかの指数時間アルゴリズムを構築し、理論的に興味深い成果を得ることができた。それらのアルゴリズムは、類似度が高いデータに対して有効なものや、次数や頂点のラベルが限られた場合において有効なものなど、幅広い性質を持つデータに対して選択的に適用できる可能性を有している。本年度は、それらのアルゴリズムによってカバーできない状況に対応すべく、新たなパラメータに基づいた計算効率の理論的保証付きアルゴリズムの提案を得ることができた。提案アルゴリズムは、分岐頂点の個数という新たなパラメータに着目し、なおかつ、動的計画法や最大重み付き二部マッチングなどによって既存手法を置き換えるものであり、計算効率については、先行研究によって知られていた指数時間アルゴリズムを改善する結果となった。一方、実用的には、大規模データベースへの提案手法の摘要にあたって、理論的保証のある指数時間アルゴリズムに限らず高速近似アルゴリズムによる絞り込みを活用することが効果的であることが計算機実験の結果により明らかになった。

Current Status of Research Progress
Reason

24年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

24年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (4 results)

All 2013 2012

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Approximation and parameterized algorithms for common subtrees and edit distance between unordered trees2013

    • Author(s)
      Tatsuya Akutsu, Daiji Fukagawa, Magnus M. Halldorsson, Atsuhiro Takasu, Keisuke Tanaka
    • Journal Title

      Theoretical Computer Science

      Volume: 470 Pages: 10-22

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Clique-Based Method Using Dynamic Programming for Computing Edit Distance Between Unordered Trees2012

    • Author(s)
      Tomoya Mori, Takeyuki Tamura, Daiji Fukagawa, Atsuhiro Takasu, Etsuji Tomita, Tatsuya Akutsu
    • Journal Title

      Journal of Computational Biology

      Volume: 19(10) Pages: 1089-1104

    • DOI

      DOI:10.1089/cmb.2012.0133

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Efficient Exponential Time Algorithms for Edit Distance between Unordered Trees2012

    • Author(s)
      Tatsuya Akutsu, Takeyuki Tamura, Daiji Fukagawa, Atsuhiro Takasu
    • Organizer
      23rd Annual Symposium on Combinatorial Pattern Matching (CPM 2012)
    • Place of Presentation
      Helsinki, Finland
    • Year and Date
      20120703-20120705
  • [Presentation] 無順序木の編集距離の指数時間厳密アルゴリズム2012

    • Author(s)
      阿久津達也, 田村武幸, 深川大路, 高須淳宏
    • Organizer
      電子情報通信学会コンピュテーション研究会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2012-06-21

URL: 

Published: 2014-07-24  

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