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2010 Fiscal Year Annual Research Report

サンゴ-褐虫藻共生体の分子メカニズムの解明?白化現象解明を目指して?

Research Project

Project/Area Number 21710199
Research InstitutionOkinawa Institute of Science and Technology

Principal Investigator

新里 宙也  独立行政法人沖縄科学技術研究基盤整備機構, マリンゲノミックスユニット, 研究員 (70524726)

Keywordsサンゴ / 褐虫藻 / 共生 / 白化現象 / 遺伝子発現応答
Research Abstract

サンゴは「褐虫藻」と呼ばれる植物プランクトンと共生している。わずかなストレスでサンゴから褐虫藻が抜け出し、白化現象と呼ばれるサンゴー褐虫藻共生システムが崩壊し、最終的にサンゴが死滅する。しかし、これまでのサンゴの生物学的研究においては、分子レベルでの知見はほとんど無いのが現状である。サンゴが直面する危機、「白化現象」を生物学的に深く理解するためには、サンゴ-褐虫藻の共生機構とストレス応答メカニズムの分子レベルでの知見は欠かせない。本研究では「サンゴ-褐虫藻共生体」を一つの「生命体」として考え、「次世代シークエンサー」を用いて、サンゴのストレス時の遺伝子発現応答を、これまでに無いレベルで網羅的に解析する。そして(1)ホスト(サンゴ)の分子レベルでの温度ストレス応答機構の種間での違い、と(2)サンゴ-褐虫藻生命体の共生メカニズムの分子機構、を明らかにする事を目的としている。
22年度にコユビミドリイシの遺伝子情報からcDNAマイクロアレイを設計し、温度ストレスを与えたサンゴの網羅的遺伝子発現解析を行った。現在データの解析中である。さらにコユビミドリイシ・ゲノムプロジェクトの進展により、コユビミドリイシのほぼ全ての遺伝子の情報が高品質で明らかになった。このデータを元に、新たにcDNAマイクロアレイの設計を行った。これにより、真の「ゲノムワイド」なサンゴの遺伝子発現解析が可能となり、マイクロアレイ解析にかかるコストを半分に減らす事が出来た。さらに単離培養している褐虫藻のトランスクリプトーム解析も開始しており、「サンゴ-褐虫藻共生体」の分子レベルでの研究が軌道に乗りつつある。

  • Research Products

    (5 results)

All 2011 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Identification of fast-evolving genes in the scleractinian cocal Acropora using comparative EST analysis.2011

    • Author(s)
      Iguchi A, Shinzato C, Foret S, Miller DJ.
    • Journal Title

      PLos ONE

      Volume: (In press)

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genome sequencing of the coral Acropora digitifera.2011

    • Author(s)
      Shinzato, C
    • Organizer
      ARC CoE Boden Conference-Genome Biology of Corals and their Relatives
    • Place of Presentation
      オーストラリア、タウンズビル
    • Year and Date
      2011-03-07
  • [Presentation] サンゴ生物学へのゲノム科学的アプローチ~バイオミネラリゼーション研究への応用に向けて~2011

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化-遺伝子から地球環境まで-」
    • Place of Presentation
      東京大学 大気海洋研究所
    • Year and Date
      2011-02-10
  • [Presentation] コユビミドリイシのマイクロアレイの開発2010

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      日本サンゴ礁学会
    • Place of Presentation
      つくばカピオ
    • Year and Date
      2010-12-02
  • [Presentation] 造礁サンゴ、コユビミドリイシ(Acropora digitifera)のゲノム解読2010

    • Author(s)
      新里宙也
    • Organizer
      日本動物学会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2010-09-23

URL: 

Published: 2012-07-19  

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